New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5258442 | 58 (1.120) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 7.2% | coding (715/1212 nt) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
? | NC_002947 | = 5258487 | 49 (1.010) | coding (670/1212 nt) | PP_4635 | trans‑2‑enoyl‑CoA reductase |
CGCCACATTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGATGATGGTG > NC_002947/5258344‑5258629 | cGCCACATTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCcacgg < 8:28766‑M2/149‑6 (MQ=255) caTTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGa < 1:82384/149‑1 (MQ=255) caTTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGa < 3:296137/149‑1 (MQ=255) caTTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGa < 7:28766/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAgc < 7:305973/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAgc < 5:551/149‑1 (MQ=255) ccgccTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTc < 4:172912/149‑1 (MQ=255) ccgccTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTc < 1:148415/149‑1 (MQ=255) ccTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGc < 1:117275/149‑1 (MQ=255) ttcacttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCca > 8:115650‑M2/1‑125 (MQ=255) ttcacttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCca < 7:115650‑M2/127‑3 (MQ=255) acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTa > 7:181435/1‑148 (MQ=255) acttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTa > 6:301765/1‑148 (MQ=255) cttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACa > 3:60282/1‑149 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAgcgc > 8:227635/1‑134 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAgcgc < 7:227635/134‑1 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCa < 7:55750/143‑1 (MQ=255) ttcacCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCa > 8:55750/1‑143 (MQ=255) ttCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGccagccag > 8:31747/1‑149 (MQ=255) gTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCAt < 5:137426/149‑1 (MQ=255) gTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCAAGTACATTGGCGCCCGCCAGCGCAt > 2:210733/1‑149 (MQ=255) gACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATc > 1:186574/1‑149 (MQ=255) gACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATc < 4:60282/149‑1 (MQ=255) aCGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATcc < 6:154128/149‑1 (MQ=255) aCGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATc > 4:70339/1‑148 (MQ=255) gCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCcac < 7:201865/149‑1 (MQ=255) ggCGTTTTCGTCCTGGACCTGGTTGGCGTGGCCCTGTGCACCGTGCCTGTAGATCGGCCAGGTTATTTCGCTGCCTAAATTGCTGACGGCAACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAg < 1:256132/147‑1 (MQ=255) ggCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgc > 2:193792/1‑123 (MQ=255) ggCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGgc < 1:193792/123‑1 (MQ=255) gTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCa < 7:31747/149‑1 (MQ=255) gTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCa < 8:181435/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTg > 2:241596/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtga > 2:188936/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAt < 5:301765/147‑1 (MQ=255) ttGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgac > 8:178853/1‑149 (MQ=255) ggcctggccCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacg < 1:241596/148‑1 (MQ=255) gcctggccCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCCCGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACCGTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCGGGCCCCCCAggccggt > 7:210178/1‑149 (MQ=255) gcctggccCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTTGCCCCCCAtgacggt > 7:213878/1‑149 (MQ=255) actggcaCGGTGCACTGGGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtg > 7:262721/2‑149 (MQ=255) ctggccCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtga > 8:253977/1‑149 (MQ=255) gccCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtgacgg > 5:29956/1‑149 (MQ=255) aGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaat < 3:266826‑M2/149‑94 (MQ=255) tGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtga < 2:276988/140‑1 (MQ=255) tGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtga > 1:276988/1‑140 (MQ=255) cACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaat < 6:165091‑M2/145‑94 (MQ=255) cACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaat > 5:165091‑M2/1‑52 (MQ=255) gTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAAttt > 2:266369/1‑149 (MQ=255) aGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGc > 5:276759/1‑149 (MQ=255) ggCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCcacggtgcactgggccaggccaagcaggacctggacgaaaccgccctgcgtctgaaccagaagctggccggtgaagtgaaaggcggcgccaatgtggcggtgctcaagtcggt > 4:266826‑M2/1‑35 (MQ=255) aGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtgacg < 8:138591/119‑1 (MQ=255) aGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCAtgacggtgacg > 7:138591/1‑119 (MQ=255) atatCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCTGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGa > 4:289089/1‑148 (MQ=255) gCTGCCGATATAGCTGACGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTg < 2:139269/148‑1 (MQ=255) cTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGTTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGc > 7:203130/1‑149 (MQ=255) ccGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTc < 1:188936/149‑1 (MQ=255) gCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGatgatg < 2:186574/148‑1 (MQ=255) gCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGatgatg < 3:7612/148‑1 (MQ=255) gCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGATGATgg > 2:159460/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGatgatg > 1:62617/1‑146 (MQ=255) tGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGatgatg < 2:62617/146‑1 (MQ=255) tGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGATGATGgtg > 8:154537/1‑149 (MQ=255) | CGCCACATTGGCGCCGCCTTTCACTTCACCGGCCAGCTTCTGGTTCAGACGCAGGGCGGTTTCGTCCAGGTCCTGCTTGGCCTGGCCCAGTGCACCGTGCCAGTAGATCGGCCAGGTGATATCGCTGCCGATATAGCTGAAGGCCACGGTGCGAGCGCCTTCGGCCAGTACATTGGCGCCAGCCAGCGCATCGATCCACAGCTGCCAGTCCTGGCCACCCATGACGGTGACGGTATCGGCAATTTCCTGCTCGGTGGCCGGCTCGATGCTGGCCTCGATGATGGTG > NC_002947/5258344‑5258629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |