New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5493394 = | 52 (1.010) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 8.0% | coding (622/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
? | NC_002947 | 5493483 = | 43 (0.870) | coding (533/1698 nt) | cobJ | precorrin‑3B C17‑methyltransferase |
GCGAATACTGTGCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACTGGTGGT > NC_002947/5493335‑5493628 | gcgAATACTGTGCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCa < 2:175498/149‑1 (MQ=255) tgtatccgacttgctggcgggtgagtctgtgcgcatcgaaggtaacgccccgtggctGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCa > 7:190920‑M1/58‑147 (MQ=255) tgtatccgacttgctggcgggtgagtctgtgcgcatcgaaggtaacgccccgtggctGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAg > 8:71390‑M1/58‑148 (MQ=255) gAATACTGTGCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGc > 5:302978/1‑149 (MQ=255) tACTGTGCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCAc < 7:126123/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACGACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACggg > 1:185424/1‑149 (MQ=255) tgtgCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACggg > 1:180326/1‑149 (MQ=255) tgCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGc < 3:305778/149‑1 (MQ=255) cAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGt < 6:98016/149‑1 (MQ=255) aGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGtt < 2:44971/149‑1 (MQ=255) ttGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTAcc < 3:62959/149‑1 (MQ=255) ccACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTc > 4:214687/1‑149 (MQ=255) cACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTc > 6:109760/1‑148 (MQ=255) aCCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGa > 1:262527/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGca > 1:221009/1‑149 (MQ=255) gCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGca > 2:282914/1‑146 (MQ=255) cccACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGa > 7:17753/1‑149 (MQ=255) cccACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGa > 6:307834/1‑149 (MQ=255) ccatcaccaccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGAc < 3:218315/149‑1 (MQ=255) ccaccaccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCa > 1:124733/1‑149 (MQ=255) caccaccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCAc < 6:302978/149‑1 (MQ=255) caccaccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCAc > 8:41575/1‑149 (MQ=255) ccaccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCAccc < 2:221009/149‑1 (MQ=255) caccaGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCg > 5:128339/1‑149 (MQ=255) ggCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGc < 2:262527/149‑1 (MQ=255) gcgcGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGc > 4:73236/1‑148 (MQ=255) gggTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTc < 6:128339/149‑1 (MQ=255) ggTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCg < 3:214687/149‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGAt < 5:109760/148‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATa < 2:185424/149‑1 (MQ=255) gATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATa < 2:180326/149‑1 (MQ=255) tCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATAc > 6:325147/1‑148 (MQ=255) ctgcagctggcgcagttgcccgccagcgaagcggcgcagcgcaccatccatgtggggcatcaggcgcgcccggccaaccgcgacgagctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACa > 8:71390‑M2/92‑148 (MQ=255) tgcagctggcgcagttgcccgccagcgaagcggcgcagcgcaccatccatgtggggcatcaggcgcgcccggccaaccgcgacgagctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACa > 7:190920‑M2/91‑147 (MQ=255) cgGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGcttgccttg < 3:73236/149‑1 (MQ=255) cagcgaagcggcgcagcgcaccatccatgtggggcatcaggcgcgcccggccaaccgcgacgagctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCg < 8:190920‑M2/81‑1 (MQ=255) gcgcCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATTCAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGc > 7:247279/1‑148 (MQ=255) gcgcCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGctt > 1:185683/1‑130 (MQ=255) gcgcCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGctt < 2:185683/130‑1 (MQ=255) gcCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCaa > 5:300913/1‑149 (MQ=255) ccTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAAt > 5:265411/1‑149 (MQ=255) gATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCg > 4:187580/1‑140 (MQ=255) gATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCg < 3:187580/140‑1 (MQ=255) gCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATa < 1:282914/148‑1 (MQ=255) gCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAg > 5:172830/1‑149 (MQ=255) tgcgctgcgcCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGtt > 2:236256/1‑148 (MQ=255) gggcatcaggcgcgcccggccaaccgcgacgagctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTcagca < 7:71390‑M2/112‑1 (MQ=255) cgccgcTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAgg > 3:206354/1‑148 (MQ=255) cgcTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAg > 2:274438/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAg > 8:256313/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCACCAGGCAAGTACCGAAg > 7:224070/1‑149 (MQ=255) gcCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACt > 3:271354/1‑149 (MQ=255) cAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACtgg < 8:17753/149‑1 (MQ=255) cAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACtgg < 4:271354/149‑1 (MQ=255) agctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGcggcgg < 2:167873‑M2/104‑1 (MQ=255) agctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGcggcgg > 1:167873‑M2/7‑110 (MQ=255) gctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAACCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACtggtg < 5:307834‑M2/144‑1 (MQ=255) ctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACtggtgg < 7:243948‑M2/145‑1 (MQ=255) ctgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACtggtgg < 6:172830‑M2/145‑1 (MQ=255) tgcAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACTggtggt > 6:64441‑M2/4‑149 (MQ=255) | GCGAATACTGTGCAGATTGCCACCTGCAACGCCCACCACCACCAGGCGCGGGTAGATCAGCAGCTCGTCGCGGTTGGCCGGGCGCGCCTGATGCCCCACATGGATGGTGCGCTGCGCCGCTTCGCTGGCGGGCAACTGCGCCAGCTGCAGCCACGGGGCGTTACCTTCGATGCGCACAGACTCACCCGCCAGCAAGTCGGATACAAAGCGCTTGCCTTGCTCGATGTCGGCCAATGCATAGCCCTGCGGCGGGTTCAGCAGGCAAGTACCGAAGCGCAGCTCGCCACTGGTGGT > NC_002947/5493335‑5493628 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |