New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 279835 = | 49 (0.870) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 7.6% | coding (414/669 nt) | sctS | sulfur compound ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 279908 = | 50 (0.920) | coding (341/669 nt) | sctS | sulfur compound ABC transporter permease |
GAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGATCAGCGAAGCGGG > NC_002947/279688‑279981 | cacgccgctgctggtgcagctgttcgtcatctatttcggcatgccgcaaatcggcatcgagctggacccgatccccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcg < 2:88992‑M1/1‑1 (MQ=255) cgccgctgctggtgcagctgttcgtcatctatttcggcatgccgcaaatcggcatcgagctggacccgatccccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcGATc > 3:271840‑M1/146‑149 (MQ=255) acTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTCCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGc > 7:52468/1‑149 (MQ=255) ttCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGccc > 1:45216/1‑149 (MQ=255) cgcgGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCtt > 4:197185/1‑149 (MQ=255) ggTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCa < 6:62046/149‑1 (MQ=255) tcgtcatctatttcggcatgccgcaaatcggcatcgagctggacccgatccccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCAcg < 7:333736‑M1/25‑1 (MQ=255) aTCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCAcgcg > 7:245059/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCgg > 2:317600/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCgg > 2:312292/1‑149 (MQ=255) tCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCgg < 8:198270/149‑1 (MQ=255) aattgCGGAACAGCTCGGTCACCTGGATGGGCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCTAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTTGCAACGCGGTTCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCTCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGACg < 8:265390/145‑1 (MQ=255) gCGGATCAGGTCGGGGACCTGTCTGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATg < 8:52468/148‑1 (MQ=255) gCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATg < 8:52205/148‑1 (MQ=255) gCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGc > 2:181874/1‑149 (MQ=255) ggAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTg > 5:97176/1‑149 (MQ=255) gAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTgg < 3:197185/149‑1 (MQ=255) gggCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCtt > 6:165635/1‑149 (MQ=255) gggCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCtt > 5:253553/1‑149 (MQ=255) ccTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCAc > 1:236633/1‑149 (MQ=255) cTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTggcgg > 7:165858/1‑137 (MQ=255) cTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTggcgg < 8:165858/137‑1 (MQ=255) tCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCgg > 3:69335/1‑149 (MQ=255) cccgatccccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGt < 7:19357‑M1/68‑1 (MQ=255) gccgccAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGtc > 1:12829/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGtcgatc < 2:236633/149‑1 (MQ=255) cccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGtcgatcga > 8:19357‑M1/75‑149 (MQ=255) cccgcttcgctgatcggcctgtcgctgaacatggcggcctatatctgcgagatcctgcgcgcagccatttcctcGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGtcgatcg > 8:333736‑M1/75‑148 (MQ=255) gtgtCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAAt < 8:245059/149‑1 (MQ=255) cTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCTGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCGTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCt < 5:352136/148‑1 (MQ=255) cTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAg < 7:19254/139‑1 (MQ=255) cTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAg > 8:19254/1‑139 (MQ=255) ccAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAg > 5:14754/1‑134 (MQ=255) ccAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAg < 6:14754/134‑1 (MQ=255) cAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTgcgcg > 6:342178/1‑147 (MQ=255) aGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCg > 6:70144/1‑122 (MQ=255) aGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCg < 5:70144/122‑1 (MQ=255) tGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCg < 5:165635/149‑1 (MQ=255) gAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGAtctc < 1:210351/147‑1 (MQ=255) gAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGAtctc > 2:210351/1‑147 (MQ=255) tGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGCTCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGata > 2:289647/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGgcc > 7:104123/1‑149 (MQ=255) aGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGgccgc < 6:194126/149‑1 (MQ=255) ggTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCAt > 5:68717/1‑149 (MQ=255) ggTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCAt < 2:45216/149‑1 (MQ=255) gTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTT‑CCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGt > 3:117250/1‑149 (MQ=255) gCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGtt < 1:317600/148‑1 (MQ=255) gCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGtt < 1:312292/148‑1 (MQ=255) cAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCa < 8:104123/149‑1 (MQ=255) aaCGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGa < 8:106443/121‑1 (MQ=255) aaCGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGa > 7:106443/1‑121 (MQ=255) aaCGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAg > 3:78583/1‑149 (MQ=255) ggggcgcAAGGCCGGTGGCAGGCTCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAACTGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACa < 6:343577/146‑1 (MQ=255) aGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGAt > 5:90311/1‑148 (MQ=255) ccTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGATCAGc < 6:97176/149‑1 (MQ=255) gCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGatat > 4:185731/1‑111 (MQ=255) gCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGatat < 3:185731/111‑1 (MQ=255) cAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGATCAGCGAAGCgg > 2:317391/1‑149 (MQ=255) aGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGATCAGCGAAGCggg < 5:342178/149‑1 (MQ=255) | GAACACTTCGAACGTGCGCGCGGTAATCAGCTGGGCTTGGCGGAACAGCTCGGGCACCTGGATGGTCGCCGCCAGGGCGGTGTCCTTTACCAGCGAGATGAAGCTGTTGCCCAGCGGTGGCAACGCGGTGCGCAAGGCCTGTGGCAGGATCGCCCGGCGCATGGCTTGCACGCGGGTCATGCCGATGCTGGCGGCTGCTTCCCACTGGCCCCGGTCGATCGAGGAAATGGCTGCGCGCAGGATCTCGCAGATATAGGCCGCCATGTTCAGCGACAGGCCGATCAGCGAAGCGGG > NC_002947/279688‑279981 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |