New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1024432 | 42 (0.740) | 4 (0.070) | 4/250 | NT | 8.7% | coding (715/1380 nt) | opdP | glycine‑glutamate dipeptide porin |
? | NC_002947 | = 1024441 | 43 (0.780) | coding (706/1380 nt) | opdP | glycine‑glutamate dipeptide porin |
TTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGTCGAATTCAGCGCTGTGCAGGAACGCG > NC_002947/1024284‑1024580 | ttGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCC > 2:190266‑M1/1‑149 (MQ=255) gtagtaGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCcgg > 5:24669/1‑149 (MQ=255) gtagtTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCcggcgg > 1:122711/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTg < 1:355585‑M2/149‑2 (MQ=255) gCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCagcaccgccggca > 7:286138‑M1/1‑135 (MQ=255) tCAGGCTGAGCACTGAGCTGTCGCAGAGGACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTACTAGAACTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGATGGCACTGTCGGtt > 1:205161/1‑149 (MQ=255) aGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTc < 3:48049/149‑1 (MQ=255) ggCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTcc < 5:272675/149‑1 (MQ=255) gAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGc > 2:259403/1‑149 (MQ=255) cTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTg < 1:259403/149‑1 (MQ=255) cgcTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGgcg < 4:203514/149‑1 (MQ=255) cgcTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCAGCACCGCCggcatcaactaccagccgttcaagagc > 8:286138‑M2/1‑121 (MQ=255) cGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTAc > 5:269332/1‑149 (MQ=255) ccGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGCCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTc < 2:355585/149‑1 (MQ=255) cacaTGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGc < 6:269332/149‑1 (MQ=255) aTGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTg > 6:117313/1‑136 (MQ=255) aTGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTg < 5:117313/136‑1 (MQ=255) ggCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTg < 1:190266/148‑1 (MQ=255) gcCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCCGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGGGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGa < 6:344195/149‑1 (MQ=255) gcCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGa < 6:353228/149‑1 (MQ=255) agtagtACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGACGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGctc > 8:225447/1‑149 (MQ=255) agtaCTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGt > 4:348685/1‑149 (MQ=255) taCTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTc > 5:284920/1‑149 (MQ=255) cTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCgg < 6:11255/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGGTGGTAGTTGATGCCGGCGGGGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTAc < 5:287171/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGt < 6:24669/147‑1 (MQ=255) gTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTAc > 3:338350/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTAc > 6:13739/1‑149 (MQ=255) ccAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGt < 3:267563/148‑1 (MQ=255) agcaGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACTGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCTGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGATTCTCTGTTCGGTACGTgtc < 2:205161/146‑3 (MQ=255) aGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGc < 6:228443/149‑1 (MQ=255) cTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCAGCACCGCCggcatcaactaccagccgt < 3:44018‑M2/88‑20 (MQ=255) cTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCAGCACCGCCggcatcaactaccagccgt > 4:44018‑M2/1‑69 (MQ=255) ccTTGGAGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCGGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTc > 7:84608/1‑148 (MQ=255) ggtggCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGaa < 2:122711/147‑1 (MQ=255) ggtggCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAgg > 5:125255/1‑149 (MQ=255) gtggCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGGCGAAgg < 4:338350/148‑1 (MQ=255) cAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGt > 3:69377/1‑149 (MQ=255) gCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGa > 6:95892/1‑149 (MQ=255) gTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATg < 3:348685/147‑1 (MQ=255) aCTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCt > 7:191471/1‑147 (MQ=255) cTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAg > 8:69748/1‑149 (MQ=255) cTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCCGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGa < 8:84608/148‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAgg < 3:154054/147‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGGCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAgg < 6:284920/147‑1 (MQ=255) gCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCggcggtgctggcatcaactaccagccgttcaagagcctgagtaccagcctgtacgccaccaaggtcgaggacttctggaaccagtactacttcggcgccaaccatgtgctcggcgacagcg > 8:286138‑M1/1‑27 (MQ=255) gCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGt < 4:69377/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGGTAGTTGATGCCggcggtgctggcatcaactaccagccgttcaagagcctgagtaccagcctgtacgccaccaaggtcgag < 3:44018‑M1/88‑70 (MQ=255) aCGGCTGGTAGTTGATGCCggcggtgctggcatcaactaccagccgttcaagagcctgagtaccagcctgtacgccaccaaggtcgag > 4:44018‑M1/1‑19 (MQ=255) aCGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAgg > 2:311485/1‑83 (MQ=255) aCGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAgg < 1:311485/83‑1 (MQ=255) aCGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGTCGAATTCa > 6:134025/1‑149 (MQ=255) tAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGTCGAATTCAGCGCtgtg > 6:191612/1‑149 (MQ=255) tGCCGGCGGTGCTggcatcaactaccagccgttcaagagcctgagtaccagcctgtacgccaccaaggtcgaggacttctggaaccagtactacttcggcgccaaccatgtgctcggcgacagcgcagtgctcagcctgagcaccggc > 7:286138‑M2/1‑13 (MQ=255) tGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGTTGAATTCAGCGCTGTGCAGGAAc < 7:225447/149‑1 (MQ=255) cagcaccgccggcatcaactaccagccgttcaagagcctgagtaccagcctgtacgccaccaaggtcgaggacttctggaaccagtactacttcggcgccaaccatgtgctcggcgacagcgcagtgctcagcctgagcaccggcctga < 1:355585‑M1/149‑149 (MQ=255) | TTGTAGTAGTTCAGGCCGGTGCTCAGGCTGAGCACTGCGCTGTCGCCGAGCACATGGTTGGCGCCGAAGTAGTACTGGTTCCAGAAGTCCTCGACCTTGGTGGCGTACAGGCTGGTACTCAGGCTCTTGAACGGCTGGTAGTTGATGCCGGCGGTGCTGGCACGGTCGGTTTCCACGCCGGTGGCGCTGTACTCGCTGCGGAACTTGCTGAGGCTCTGTTCGGTACGTGGCGAGACGCGGTCGAAGGTGCCCAGGTCGATGCTGAGGTTGTCGAATTCAGCGCTGTGCAGGAACGCG > NC_002947/1024284‑1024580 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |