| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1745692 = | 59 (1.040) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 5.4% | coding (69/546 nt) | PP_1543 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1745729 = | 50 (0.940) | coding (32/546 nt) | PP_1543 | hypothetical protein | |||||
AGCCGATGATGTAGGCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTAAAATCACAGCATTGTGGC > NC_002947/1745544‑1745836 | cttctgtattgagccccaactaaatcacggcaggcaaatggccacaatgctgtgattttaaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtacctcaatgcaagtctatccctccactgtcaccaagctg < 6:203119‑M1/1‑1 (MQ=255)cttctgtattgagccccaactaaatcacggcaggcaaatggccacaatgctgtgattttaaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtaccgcaatgcaagtcgagacctccactgtcaccaagctg > 8:202223‑M1/149‑149 (MQ=255) ctgtattgagccccaactaaatcacggcaggcaaatggccacaatgctgtgattttaaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtaccgcaatgcaagtcgagacctccactgtcaccaagctgct < 8:157276‑M1/3‑1 (MQ=255) gTAGGCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATACCACATACCTACAAATTAGGCGTGACAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGAAGGTGATCTTGCCCTTGAAGGGCTCAATGTCTTAGAGGTTGACTCTGATCGGGt > 2:61141/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTcc < 3:126136/148‑1 (MQ=255) gCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAg < 2:228081/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAg < 8:102795/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGgcgc < 6:157766/149‑1 (MQ=255) cTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGgcgc > 3:153988/1‑149 (MQ=255) cTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGgcgc < 2:55123/149‑1 (MQ=255) gCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCa < 8:17587/148‑1 (MQ=255) gCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCa < 6:316510/148‑1 (MQ=255) cAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGt > 5:260510/1‑149 (MQ=255) agaagaACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGt > 8:65301/1‑148 (MQ=255) gaagaaCTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGa < 1:20777/149‑1 (MQ=255) aagaaCTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTTATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGAt < 7:65301/149‑1 (MQ=255) agatCTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATc < 5:8896/149‑1 (MQ=255) agaaCTGGCCGATGGTCAGTCCATCCAACATACCGCCCCAGTAGTCGTGCCACGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGTTGATCTTGCCCTTGCAGGTCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCTGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATc < 1:61141/149‑1 (MQ=255) gaaCTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGAGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCATAGTCTTGGAGGTAGACGCTGATCGGGGCCAGGCCGTCGGGGGCAGTGag > 6:216441/1‑146 (MQ=255) cTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATcagca < 5:111474/149‑1 (MQ=255) agggccacaatgctgtgattttaaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtaccgcaatgcaagtcgagacctccactgtcaccaagctGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATcagca > 3:158686‑M1/112‑149 (MQ=255) gCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCACAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCATCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGTGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGAAGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATcagcagag > 4:229380/1‑147 (MQ=255) cGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATca > 4:318210/1‑141 (MQ=255) cGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATca < 3:318210/141‑1 (MQ=255) gATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTgg < 6:260510/149‑1 (MQ=255) cAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAg > 1:206148/1‑149 (MQ=255) aGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGt > 4:302520/1‑149 (MQ=255) tCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGa < 4:192557/146‑1 (MQ=255) tCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGa > 3:192557/1‑146 (MQ=255) cacaTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAg > 4:196450/1‑144 (MQ=255) cacaTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAg < 3:196450/144‑1 (MQ=255) aaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtaccgcaatgcaagtcgagacctccactgtcaccaagctGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTg < 4:141115‑M1/43‑1 (MQ=255) aaacagccaccatgccgcatccggccacggagggcggcgcatgcatggagtaccgcaatgcaagtcgagacctccactgtcaccaagctGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTg > 3:141115‑M1/90‑132 (MQ=255) acaTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAACTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGCTGACAGTGGAGGtctc > 6:196633/1‑148 (MQ=255) aTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCg < 3:96525/108‑1 (MQ=255) aTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCg > 4:96525/1‑108 (MQ=255) aTACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGAc > 6:68572/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCATTAGGCGTGCCATGGTTTGTCGTAGCAGCTGACGTTTATCTTGCACTTGCATGGATCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCATGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCATCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTg < 3:229380/149‑1 (MQ=255) acGCCCCAGTATGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGGCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACtt < 3:96339/147‑1 (MQ=255) cGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGc < 5:216441/149‑1 (MQ=255) gCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCa > 6:120238/1‑149 (MQ=255) ccAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTg < 5:133451/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCgg > 3:330125/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGc > 8:148590/1‑138 (MQ=255) gCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGc < 7:148590/138‑1 (MQ=255) gCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCg > 1:328859/1‑144 (MQ=255) gCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCg < 2:328859/144‑1 (MQ=255) gCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCcat > 3:55325/1‑149 (MQ=255) ccAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCcat < 1:44331/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCcat > 2:44331/1‑148 (MQ=255) cAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATca < 6:36305/100‑1 (MQ=255) gTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGTGATCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGAAAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGAGGTAATCCATGCATGCTCCGccc > 5:203119/1‑149 (MQ=255) gcagcTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTcc < 3:302520/149‑1 (MQ=255) gcTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGAAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTg > 7:13805/1‑149 (MQ=255) tGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATg > 4:60541/1‑149 (MQ=255) tGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATg > 5:339172/1‑149 (MQ=255) aTCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGc < 4:153988/148‑1 (MQ=255) ccTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCAtggt > 6:137482/1‑149 (MQ=255) gggCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCAt > 6:224854/1‑139 (MQ=255) gggCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCAt < 5:224854/139‑1 (MQ=255) gCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGttt > 7:304255/1‑148 (MQ=255) gCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTa < 5:68572/149‑1 (MQ=255) ggTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTa > 4:306210/1‑134 (MQ=255) ggTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTa < 3:306210/134‑1 (MQ=255) ggTAGACGCTGATCGGGGCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGGCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTAAAATCACAGCATtgt < 8:304255/149‑1 (MQ=255) aGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTAAAATCACAGCATTGTGGc > 3:114502/1‑149 (MQ=255) aCGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCt > 1:159817/1‑124 (MQ=255) aCGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCt < 2:159817/124‑1 (MQ=255) | AGCCGATGATGTAGGCGTCGTGCAGCTTGCAGAAGAACTGGCCGATGGTCAGGCCATCCCACATACCGCCCCAGTAGGCGTGCCAGGTTTTGTCGTAGCAGCTGACGGTGATCTTGCCCTTGCAGGGCTCAAAGTCTTCGAGGTAGACGCTGATCGGGTCCAGGCCTTCGGCGCCAGTGATCAGCAGCTTGGTGACAGTGGAGGTCTCGACTTGCATTGCGGTACTCCATGCATGCGCCGCCCTCCGTGGCCGGATGCGGCATGGTGGCTGTTTAAAATCACAGCATTGTGGC > NC_002947/1745544‑1745836 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |