New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1748689 = | 52 (0.920) | 5 (0.090) | 5/246 | NT | 8.6% | intergenic (‑22/‑310) | PP_1548/PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 1748732 = | 57 (1.060) | intergenic (‑65/‑267) | PP_1548/PP_5744 | hypothetical protein/hypothetical protein |
CCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGT > NC_002947/1748546‑1748835 | ctccggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑Attt < 1:195831‑M1/5‑1 (MQ=255) cagTCGGCAGCGGCGACGTAGATGGCGGCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGGGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGTCCTTTCTTGCCGAACTGTTTTCCATGCATGGGGTGTTGGTCCGTGGGGTTT‑TTTTc < 4:232345/147‑1 (MQ=255) gTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTccc < 1:212120/149‑1 (MQ=255) cggcagccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑ATTTc > 5:51595‑M1/142‑147 (MQ=255) agccaccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcgtgctgagcaacaccG‑ATTTCCCGTCt < 8:335029‑M1/12‑1 (MQ=255) caccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑a > 8:290257‑M1/135‑136 (MQ=255) caccgctctttaaaaaccagcagatgagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑a < 7:290257‑M1/2‑1 (MQ=255) aGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 3:201544/1‑148 (MQ=255) aGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 4:101196/1‑148 (MQ=255) aGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 4:158155/1‑148 (MQ=255) aGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 5:4656/1‑148 (MQ=255) aGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGAGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 1:285280/1‑148 (MQ=255) gAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGcc > 6:225943/1‑147 (MQ=255) gAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCaa < 4:343958/149‑1 (MQ=255) aGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACTGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAg < 6:11084/148‑1 (MQ=255) ggCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCAGCCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAgg > 1:255145/1‑149 (MQ=255) gagccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGa < 1:70787‑M1/39‑1 (MQ=255) agccaccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑ATTTCCCGTCTCGGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGaa > 1:204540‑M1/109‑149 (MQ=255) gCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCgg < 2:255145/149‑1 (MQ=255) gCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCgg < 1:223524/149‑1 (MQ=255) accaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCgg > 2:70787‑M1/105‑149 (MQ=255) ccaggcgccgagttaatccggcgattgagttctggtggacgttacgcaacgtagcaagcttcctcgctcgacatgtcggcccgcaggcttgctgagcaacaccG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGgt > 7:335029‑M1/104‑149 (MQ=255) cATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCTGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGgtgt < 1:349086/147‑1 (MQ=255) cATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGgtgt < 7:73627/147‑1 (MQ=255) aTCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGc > 1:139018/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTGCCTTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTc < 1:270056/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTc < 7:169558/148‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCa < 3:101196/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCa < 2:139018/149‑1 (MQ=255) tCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCa < 7:169790/139‑1 (MQ=255) tCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCa > 8:169790/1‑139 (MQ=255) cca‑ccTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCg < 6:4656/149‑1 (MQ=255) cagCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACAt > 4:293914/3‑149 (MQ=255) cATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTc < 4:108584/149‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgag < 5:225943/148‑1 (MQ=255) gCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgag < 2:285280/148‑1 (MQ=255) ggCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGc > 2:40017/1‑149 (MQ=255) gCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCt < 1:40017/149‑1 (MQ=255) cACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGtt < 4:128296/76‑1 (MQ=255) cACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGtt > 3:128296/1‑76 (MQ=255) aCGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgagcga > 5:110056/1‑137 (MQ=255) aCGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgagcga < 6:110056/137‑1 (MQ=255) cGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgagcg < 5:371099/135‑1 (MQ=255) cGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTcgagcg > 6:371099/1‑135 (MQ=255) gACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCgg > 2:329514/1‑118 (MQ=255) gACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCgg < 1:329514/118‑1 (MQ=255) gCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTaa < 4:201544/147‑1 (MQ=255) gCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGATCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAAc > 5:163988/1‑148 (MQ=255) cGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTc > 4:26131/1‑149 (MQ=255) cGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTc > 4:21286/1‑149 (MQ=255) gAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTc > 1:349310/1‑148 (MQ=255) aaCAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTcca > 7:282109/1‑149 (MQ=255) gTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGATG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTccac > 3:188548/1‑146 (MQ=255) tCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGc < 8:295908/98‑1 (MQ=255) tCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGc > 7:295908/1‑98 (MQ=255) ccAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACt < 3:158155/148‑1 (MQ=255) cAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTc > 2:227652/1‑148 (MQ=255) aaGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCaa > 7:93216/1‑149 (MQ=255) aGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAAt < 3:293914/149‑1 (MQ=255) gCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATc > 5:186349/1‑149 (MQ=255) cGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGgc < 2:349310/149‑1 (MQ=255) gTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCtgg > 6:76000/1‑149 (MQ=255) gTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCtgg > 3:164240/1‑149 (MQ=255) ttG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGATCTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCaggc < 8:282109/149‑2 (MQ=255) | CCGTCGGCAGCGGCGACGTAGAAGGCGCCGTAGACGATCGCCTGCATCAGGTCGCGGTTCTGAACCA‑CCTGCATTGCAGCGCGGGCTTCACGACCTTTCTTGCCGAACAGTTTTCCAAGCATGGGGTGTTGCTCCGTGGGGTTG‑ATTTCCCGTCT‑GGCCCTGTTGCCAAGGCCAGCCAGTGAAATCGGTGTTGCTCAGCAAGCCTGCGGGCCGACATGTCGAGCGAGGAAGCTTGCTACGTTGCGTAACGTCCACCAGAACTCAATCGCCGGATTAACTCGGCGCCTGGT > NC_002947/1748546‑1748835 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |