New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1910312 | 34 (0.600) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 8.0% | coding (500/1341 nt) | PP_1710 | phthalate permease family MFS transporter |
? | NC_002947 | = 1910353 | 37 (0.690) | coding (459/1341 nt) | PP_1710 | phthalate permease family MFS transporter |
CTTACCTTCTTGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGCCGAACAGTGAGGCGA > NC_002947/1910168‑1910459 | cTTACCTTCTTGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGcc < 4:171086/149‑1 (MQ=255) acattcttGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGACACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAg > 7:153465/4‑149 (MQ=255) aCCTTCTTGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCa < 1:181522/148‑1 (MQ=255) cttcttGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGGCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAgg > 5:35120/1‑148 (MQ=255) gCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGc > 3:290624/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACAt < 8:193576/148‑1 (MQ=255) cGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAAGAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGt < 3:186384/149‑1 (MQ=255) gggTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTa < 5:162422/149‑1 (MQ=255) gggTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTa < 2:233016/149‑1 (MQ=255) ggTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACg > 5:29107/1‑146 (MQ=255) ggTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAg < 6:29107/149‑1 (MQ=255) cACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCa < 6:290106/149‑1 (MQ=255) cACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCa < 1:341490/149‑1 (MQ=255) cAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGc > 5:221489/1‑122 (MQ=255) cAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGc < 6:221489/122‑1 (MQ=255) aGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGcatggccagcagcatctacgtatgtggccagtacctgggcacc > 5:171002‑M1/1‑106 (MQ=255) acacGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGcatggccagcagcatctacgtatgtggccagtacctgggcaccgcgc < 6:171002‑M1/149‑48 (MQ=255) cacGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGccgcgct < 1:339582‑M2/149‑8 (MQ=255) gacgCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGGCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTcgc < 6:35120/149‑1 (MQ=255) gacgCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACATCGCGGcatggccagcagcatctacgtatgtggccagtacctgggcaccgcgctgtt < 5:288726‑M1/149‑52 (MQ=255) gacgCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTcgc < 2:339582/149‑1 (MQ=255) gATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACAGACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAAc > 6:157570/1‑148 (MQ=255) cGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATAcc < 1:141233/149‑1 (MQ=255) ccAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGCGCGGGGCACCATACCGt > 3:36241/1‑148 (MQ=255) gACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAAcc > 1:206475/1‑149 (MQ=255) gACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAAcc > 8:81777/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCa > 2:307872/1‑149 (MQ=255) gTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGt > 1:223205/1‑149 (MQ=255) tAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACgg > 8:150406/1‑144 (MQ=255) tAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACgg < 7:150406/144‑1 (MQ=255) cGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCggg < 3:311247/149‑1 (MQ=255) gcCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGcc > 3:54917/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTc > 3:334338/1‑148 (MQ=255) gtggtCTCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAAGAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCAt < 4:298048/149‑1 (MQ=255) ggtCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATgg < 2:223205/149‑1 (MQ=255) gcACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAg < 7:81777/149‑1 (MQ=255) cGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGcc > 2:64151/1‑148 (MQ=255) gTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGCCGaa < 4:290624/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGccgcgatgttcaccggtgcgctgctgtggctggcgaccacctatgactggcgccacgtgttctacagcaccggtctggtcggcatcctgttcggcgtc < 5:288726‑M2/149‑99 (MQ=255) aaCAGCGCGGGGCACTGTTACTGGCCACTTACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACAATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGCCGAACa < 8:153465/148‑1 (MQ=255) aGCGCGGcatggccagcagcatctacgtatgtggccagtacctgggcaccgcgctgttcaccggtgcgctgctgtggctggcgaccacctatgactggcgccacgtgttctacagcaccggtctggtcggcatcctgttcggcgtcgtg < 1:339582‑M1/149‑143 (MQ=255) gcgcGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGccgcgctgttcaccggtgcgctgctgtggctggcgaccacctatgactggcgccacgtgttctacagcaccggtctggtcggcatcctgttcggcgtcgtgt < 6:171002‑M2/149‑103 (MQ=255) cgcgGTTCCCAGGTACTGTCCACTTACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGCCGAACAGTGAgg < 4:54917/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGccgcgctgttcaccggtgcgctgctgtggctggcgaccacctatgactggcgccacgtgttctacagcaccggtctggtcggcatcctgttcggcgtcgtgtggct > 5:171002‑M2/1‑43 (MQ=255) | CTTACCTTCTTGCAGTTCAGCGGGTCGCGGTACAGCACCAGCCACACGACGCCGAACAGGATGCCGACCAGACCGGTGCTGTAGAACACGTGGCGCCAGTCATAGGTGGTCGCCAGCCACAGCAGCGCACCGGTGAACAGCGCGGTGCCCAGGTACTGGCCACATACGTAGATGCTGCTGGCCATGCCGCGCTCGCGAGCGGGGAACCATACCGTAACCGCACGGCTGTTGGCCGGGAAGGCCGGGGCCTCCATGGCGCCGACCGCCAGGCGCAGGCCGAACAGTGAGGCGA > NC_002947/1910168‑1910459 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |