| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2727126 | 50 (0.880) | 3 (0.050) | 3/252 | NT | 5.2% | coding (196/627 nt) | PP_2388 | LysE family transporter |
| ? | NC_002947 | = 2727175 | 61 (1.100) | coding (147/627 nt) | PP_2388 | LysE family transporter | |||||
AGCCCGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGAT > NC_002947/2726981‑2727273 | aGCCCGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCTTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCGCATGGTTCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATggcgg < 1:44747/148‑1 (MQ=255) cccGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCAc < 1:16945/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTg < 4:287153/149‑1 (MQ=255) cgccgcGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTg < 7:119426/149‑1 (MQ=255) gcgcCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGa < 3:197243/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGga < 5:14771/148‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGga > 6:14771/1‑148 (MQ=255) ttGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCa > 2:89301/1‑149 (MQ=255) tGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTgg < 8:76634/119‑1 (MQ=255) tGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTgg > 7:76634/1‑119 (MQ=255) gTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCa > 7:265384/1‑149 (MQ=255) tCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCatcactggtgctgatcggcgcggcagcgtggatcatcctcac > 8:68347‑M1/1‑107 (MQ=255) gggTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGACGATGATc < 5:164793/118‑1 (MQ=255) gggTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGACGATGATc > 6:164793/1‑118 (MQ=255) gCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCatcactggtgctgatcggcgcggcagcgtggatcatcctcaccagtgccgccat < 7:68347‑M1/149‑55 (MQ=255) cTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCCGCACCAGTGATGCCCAGt > 8:201267/1‑149 (MQ=255) tGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGtt > 2:239559/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCatcactggggctgatcggcgcggcagcgtggatcatcctcaccagtgccgccatcga < 1:234574‑M1/147‑58 (MQ=255) cAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTgg > 8:92290/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGt > 8:249238/1‑149 (MQ=255) ggCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑Gc < 4:100535/149‑1 (MQ=255) gTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGa > 2:92459/1‑149 (MQ=255) cTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGAcggc > 7:223718/1‑149 (MQ=255) ccACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATg > 8:67249/1‑149 (MQ=255) cACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATgg > 1:233135/1‑149 (MQ=255) aCGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGc > 8:93360/1‑149 (MQ=255) aCGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGc < 1:239559/149‑1 (MQ=255) gCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCtt < 8:265384/149‑1 (MQ=255) gCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGc > 5:184207/1‑149 (MQ=255) ccGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGcc < 8:223718/149‑1 (MQ=255) cGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCg > 1:362238/1‑149 (MQ=255) gATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATgc < 6:26319‑M2/105‑3 (MQ=255) gATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATgc > 5:26319‑M2/1‑103 (MQ=255) gATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATTCCCAGTTGGT‑GCCGAcg < 3:299552/121‑1 (MQ=255) gATGAACAGGCAGACCAGCAGGCTCAAGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCCGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCACCACCAGTGATGCCCAGAAGGT‑GCCGAcg > 4:299552/1‑121 (MQ=255) aaCAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAggc > 6:91897/1‑149 (MQ=255) cAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAggcgg > 3:314593/1‑149 (MQ=255) cAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAggcgg > 8:170557/1‑149 (MQ=255) gCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg < 7:92290/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGAAGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCg > 6:178534/1‑149 (MQ=255) gCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGGCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAg < 2:76187/149‑1 (MQ=255) cagcagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGTGCGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGAcggcg > 1:43984/1‑110 (MQ=255) cagcagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGAcggcg < 2:43984/109‑1 (MQ=255) agcagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGTTGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGtt < 3:22671/149‑1 (MQ=255) agcagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGTACCAGTGATGCCCAGTTGGTCGCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAgtgt < 1:89301/149‑1 (MQ=255) agcagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGtt > 5:13159/1‑149 (MQ=255) cagGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGa > 8:202641/1‑149 (MQ=255) cTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGAt < 2:362238/149‑1 (MQ=255) aTGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAg > 6:313024/1‑149 (MQ=255) aTGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCAccggg > 8:169920/1‑149 (MQ=255) gT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCAccgggccgg < 7:169920/146‑1 (MQ=255) gT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGa < 7:202641/148‑1 (MQ=255) gT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGa < 5:91897/148‑1 (MQ=255) gT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAg > 8:207536/1‑149 (MQ=255) t‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCCCCAGTGATgccatcgacaagacatggctcagcaccatgagcctgctgggctgcctgttcatcggctacattgccgtgggcacgctgagggacgccctg < 1:234574‑M2/147‑91 (MQ=255) cGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAg > 2:254022/1‑104 (MQ=255) cGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAg < 1:254022/104‑1 (MQ=255) gATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTgg > 1:350146/1‑149 (MQ=255) aTGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATgccatcgacaagacatggctcagcaccatgagcctgctgggctgcctgttcatcggctacattgccgtgggcacgctgagggacgccctgcaggc < 7:68347‑M2/149‑96 (MQ=255) gcggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACTCCCGGCCCGGTGGTGGcact < 2:233135/149‑4 (MQ=255) gcggcACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGAt < 7:207536/149‑1 (MQ=255) gCatcactggtgctgatcggcgcggcagcgtggatcatcctcaccagtgccgccatcgacaagacatggctcagcaccatgagcctgctgggctgcctgttcatc < 6:26319‑M1/105‑104 (MQ=255) gCatcactggtgctgatcggcgcggcagcgtggatcatcctcaccagtgccgccatcgacaagacatggctcagcaccatgagcctgctgggctgcctgttcatc > 5:26319‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGCCCGCCGCGCCCAGCCTTGGGGGCCTCGCTCGCTGCGTCTGACGCGGGTGCCTGCAGGGCGTCCCTCAGCGTGCCCACGGCAATGTAGCCGATGAACAGGCAGCCCAGCAGGCTCATGGTGCTGAGCCATGTCTTGT‑CGATGGCGGCACTGGTGAGGATGATCCACGCTGCCGCGCCGATCAGCACCAGTGATGCCCAGTTGGT‑GCCGACGGCGGTGAACATGGCCTTGCGCGAGCCGGAGGCGGCCGCAGTGTTGACGATCAGTGCCACCACCGGGCCGGGAGTGGCGAT > NC_002947/2726981‑2727273 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |