New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4901030 = | 50 (0.880) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (494/1533 nt) | PP_4309 | NCS1 family transporter |
? | NC_002947 | 4901076 = | 37 (0.680) | coding (540/1533 nt) | PP_4309 | NCS1 family transporter |
ATCAGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGA > NC_002947/4900885‑4901170 | atcaGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATagcag < 1:323154/148‑1 (MQ=255) tcaGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGcc > 6:227364/1‑149 (MQ=255) tcggccttgcaggacatgaacaccgcccgcgcggcgacggtcagcaggatcccaggcccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccaggatcccccgctgcaccagcccgatcgacccgaaacacaccCAGcc > 4:95441‑M1/145‑149 (MQ=255) caGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGcc > 7:52781/1‑148 (MQ=255) aGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTa > 5:166360/1‑149 (MQ=255) ccGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATagc < 2:275642/141‑1 (MQ=255) ccGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATagc > 1:275642/1‑141 (MQ=255) ccGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTAc > 2:69210/1‑148 (MQ=255) cGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGa < 2:45521/149‑1 (MQ=255) gCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGAc > 3:242456/1‑149 (MQ=255) cATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGAc > 8:340829/1‑148 (MQ=255) ttGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCAc < 7:8463/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACa < 7:36158/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACa < 1:210524/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACa < 2:296129/149‑1 (MQ=255) cGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGACGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACa < 1:89133/147‑1 (MQ=255) cACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCgg < 8:52781/149‑1 (MQ=255) cACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCg < 5:227364/148‑1 (MQ=255) aCGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGc < 7:340829/149‑1 (MQ=255) aCGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGc < 5:299743/149‑1 (MQ=255) gcgcAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTc > 2:240501/1‑149 (MQ=255) tCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctg < 1:240501/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATagcag < 7:266959/108‑1 (MQ=255) cGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATagcag > 8:266959/1‑108 (MQ=255) gcTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctggg < 1:69210/149‑1 (MQ=255) tGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGgtg > 8:111147/1‑149 (MQ=255) aggatcacaggcccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccagtatcactatttttaacagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGgtg > 2:60683‑M1/100‑149 (MQ=255) gTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTc < 4:242456/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTc < 2:187072/149‑1 (MQ=255) gTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTc < 6:37820/149‑1 (MQ=255) cccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccaggatcaccagctgcaccagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctgg < 1:349038‑M1/47‑1 (MQ=255) cccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccaggatcaccagctgcaccagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctgg > 2:349038‑M1/89‑135 (MQ=255) atcgccatcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGAt > 4:225812/1‑149 (MQ=255) tcgccatcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATc > 5:154128/1‑149 (MQ=255) catcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctggc > 4:155308/1‑149 (MQ=255) cgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctggctgg > 2:186692/1‑149 (MQ=255) cGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggct > 2:351706/1‑113 (MQ=255) cGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggct < 1:351706/113‑1 (MQ=255) cAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCt < 3:155308/149‑1 (MQ=255) aGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCAGTTTGGACGCAAATAGCAGCCTACGACCACGAAAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTg > 7:111934/1‑149 (MQ=255) acctacctGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGc < 1:186692/149‑1 (MQ=255) cctGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTAc < 6:154128/148‑1 (MQ=255) tGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCt < 1:123037/144‑1 (MQ=255) tGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCt > 2:123037/1‑144 (MQ=255) ggCATCGGTAGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctgg > 5:220340/1‑118 (MQ=255) ggCATCGGTAGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctgg < 6:220340/118‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTTCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTTGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATgg < 6:114892/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGCCCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGCGCCAGGGCTGGGTGTGGTTCGTGTCGATCTGGCTGGGGCAGCTGGTGCTCCTGGACTACGGCATgg > 8:299477/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGga < 7:111147/149‑1 (MQ=255) gctg‑cGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTgc > 5:341840/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATg < 7:291166/132‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATg > 8:291166/1‑132 (MQ=255) gctCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACg > 7:331435/1‑122 (MQ=255) gctCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACg < 8:331435/122‑1 (MQ=255) ccgccgTTTGGCAGTAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCttt > 2:181760/1‑149 (MQ=255) cgccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTg > 3:165127/1‑149 (MQ=255) cgccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTg < 6:166360/149‑1 (MQ=255) ccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGcc > 8:289283/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCgg < 7:289283/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGGCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCgg < 6:341840/149‑1 (MQ=255) gCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGa > 6:316432/1‑149 (MQ=255) | ATCAGCCGCATTGCCTTCGGCATCCACGGCGCGCAGATCCCGGCGCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTG‑CGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGA > NC_002947/4900885‑4901170 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |