New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4901030 = | 50 (0.880) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.6% | coding (494/1533 nt) | PP_4309 | NCS1 family transporter |
? | NC_002947 | 4901076 = | 37 (0.680) | coding (540/1533 nt) | PP_4309 | NCS1 family transporter |
GCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGTACTTCAAGGCCGA > NC_002947/4900929‑4901219 | gcTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctggg < 1:69210/149‑1 (MQ=255) tGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGgtg > 8:111147/1‑149 (MQ=255) aggatcacaggcccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccagtatcactatttttaacagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGgtg > 2:60683‑M1/100‑149 (MQ=255) gTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTc < 2:187072/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTc < 4:242456/149‑1 (MQ=255) gTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTc < 6:37820/149‑1 (MQ=255) cccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccaggatcaccagctgcaccagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctgg < 1:349038‑M1/47‑1 (MQ=255) cccggcaaaggcctcgtaacggcgcaccatctccatgccgtaggccaggatcaccagctgcaccagccagatcgacacgaaacacaccCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCctgggctgg > 2:349038‑M1/89‑135 (MQ=255) atcgccatcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGAt > 4:225812/1‑149 (MQ=255) tcgccatcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATc > 5:154128/1‑149 (MQ=255) catcgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctggc > 4:155308/1‑149 (MQ=255) cgccTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctggctgg > 2:186692/1‑149 (MQ=255) cAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCt < 3:155308/149‑1 (MQ=255) aGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCAGTTTGGACGCAAATAGCAGCCTACGACCACGAAAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTg > 7:111934/1‑149 (MQ=255) acctacctGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGc < 1:186692/149‑1 (MQ=255) cctGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTAc < 6:154128/148‑1 (MQ=255) tGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCt < 1:123037/144‑1 (MQ=255) tGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCt > 2:123037/1‑144 (MQ=255) ggCATCGGTAGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctgg < 6:220340/118‑1 (MQ=255) ggCATCGGTAGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATctgg > 5:220340/1‑118 (MQ=255) aTCGGTGGTGCTGCGGGTGCTTCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTTGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATgg < 6:114892/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGCCCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGCGCCAGGGCTGGGTGTGGTTCGTGTCGATCTGGCTGGGGCAGCTGGTGCTCCTGGACTACGGCATgg > 8:299477/1‑149 (MQ=255) tCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGga < 7:111147/149‑1 (MQ=255) gctgcGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTgc > 5:341840/1‑149 (MQ=255) gTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATg < 7:291166/132‑1 (MQ=255) gTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATg > 8:291166/1‑132 (MQ=255) gctCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACg < 8:331435/122‑1 (MQ=255) gctCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACg > 7:331435/1‑122 (MQ=255) ccgccgTTTGGCAGTAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCttt > 2:181760/1‑149 (MQ=255) cgccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTg < 6:166360/149‑1 (MQ=255) cgccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTg > 3:165127/1‑149 (MQ=255) ccgTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGcc > 8:289283/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCgg < 7:289283/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGGCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCgg < 6:341840/149‑1 (MQ=255) gCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGa > 6:316432/1‑149 (MQ=255) cacccagcccaggctcgacaggccgaggatgctgtcgtggtcgtaggctgGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGTTAAAAATAGTGATACTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCct > 2:60683‑M2/51‑149 (MQ=255) ccagcccaggctcgacaggccgaggatgctgtcgtggtcgtaggctgGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCggg < 1:349038‑M2/88‑1 (MQ=255) ccagcccaggctcgacaggccgaggatgctgtcgtggtcgtaggctgGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCggg > 2:349038‑M2/48‑135 (MQ=255) AGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGa < 8:35639‑M1/149‑1 (MQ=255) AGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGa < 8:30142‑M1/149‑1 (MQ=255) aCCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCGGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTcgcc < 8:111934/149‑1 (MQ=255) cACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTcgccg > 2:232667/1‑148 (MQ=255) aCAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGTCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTg < 1:181760/149‑1 (MQ=255) tCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGtt > 1:51871/1‑148 (MQ=255) tCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGGGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTGACGAGGCGTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGtt > 6:345381/1‑148 (MQ=255) ccTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGt < 4:165127/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGTACt > 7:40647/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCtg < 6:226493/101‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCtg < 6:221379/101‑1 (MQ=255) ccTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCtg > 5:226493/1‑101 (MQ=255) ccTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCtg > 5:221379/1‑101 (MQ=255) ccTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGGGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGTACTTCAAgg > 2:202593/1‑149 (MQ=255) ctgggcggggGGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGTACTTCAAGGc < 7:299477/149‑1 (MQ=255) ggctgGGTGTGTTTCGGGTCGATCGGGCTGGTGCAGCGGGGGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGGGATCCTGCTGACCGTCGCCGCGCGGGCGGTGTTCATGTCCTGCAAGGCCGa > 4:95441‑M2/6‑149 (MQ=255) | GCTGATCCGTGCCGTCATCGCCATCGCCTGGTTCGGCATCCAGACCTACCTGGCATCGGTGGTGCTGCGGGTGCTGCTCACCGCCGTTTGGCCGCAAATAGCAGCCTACGACCACGACAGCATCCTCGGCCTGTCGAGCCTGGGCTGGGTGTGTTTCGTGTCGATCTGGCTGGTGCAGCTGGTGATCCTGGCCTACGGCATGGAGATGGTGCGCCGTTACGAGGCCTTTGCCGGGCCTGTGATCCTGCTGACCGTCGCCGCACTGGCGGTGTTCATGTACTTCAAGGCCGA > NC_002947/4900929‑4901219 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |