New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5175709 = | 42 (0.740) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.8% | coding (512/945 nt) | PP_4551 | alpha/beta family hydrolase |
? | NC_002947 | 5175751 = | 57 (1.050) | coding (554/945 nt) | PP_4551 | alpha/beta family hydrolase |
ACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTGGCTCGATCTGCT > NC_002947/5175562‑5175856 | aCCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGCAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATgg > 4:18098/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATgg < 5:139617/148‑1 (MQ=255) ctgctgCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGtt < 6:92246/149‑1 (MQ=255) cATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCtt > 1:9511/1‑149 (MQ=255) cATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCtt > 3:342948/1‑149 (MQ=255) aTCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTc < 7:116567/149‑1 (MQ=255) cacaGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCgg > 3:208138/1‑149 (MQ=255) gCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACg > 8:28071/1‑149 (MQ=255) cGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAg > 7:240571/1‑149 (MQ=255) aTCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGcc < 8:229656/149‑1 (MQ=255) tCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGccc < 7:28071/149‑1 (MQ=255) gCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGc > 6:208262/1‑149 (MQ=255) atcgagccacaactggttggtgcagcgaaagccgcacaacgggtcattcacgtactgatcgacctcgcccgggtcgcggctgagccagtcgaaggccgtgcGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACgg > 8:79345‑M1/102‑149 (MQ=255) aCTACCCACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTc < 5:84958/149‑1 (MQ=255) tACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACg > 6:305731/1‑141 (MQ=255) tACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACg < 5:305731/141‑1 (MQ=255) aCCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCGGGCGCCACGGGCCCCTGGGCAAGAGTTCACAGATACAATGGTTGTCCTTAGGTTCGTTGAACCACGCCGTCAAGCCCCACCGCACGGccataga > 1:94114/1‑143 (MQ=255) ccAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGCCAACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTAGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGaat > 6:14452/1‑147 (MQ=255) cGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCTGCTGATTGCCCGGATGGAGTCCTGGCGCGAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACTCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTc < 5:14452/149‑1 (MQ=255) ggCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGGTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCa < 2:317859/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTAATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGcc > 1:71936/1‑149 (MQ=255) cTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGCAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGa < 3:18098/149‑1 (MQ=255) gTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGCTCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTAAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCCCCAcc > 3:19065/1‑149 (MQ=255) tACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGAccc > 7:207382/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTCCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCg > 8:308222/1‑149 (MQ=255) cGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCggg < 2:94114/149‑1 (MQ=255) ccgcacaacgggtcattcacgtactgatcgacctcgcccgggtcgcggctgagccagtcgaaggccgtgcGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACg < 4:97560‑M1/47‑1 (MQ=255) ccgcacaacgggtcattcacgtactgatcgacctcgcccgggtcgcggctgagccagtcgaaggccgtgcGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACg > 3:97560‑M1/71‑117 (MQ=255) cgcgGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTc > 6:344301/1‑149 (MQ=255) cTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTCCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCa < 7:308222/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGt > 2:87957/1‑149 (MQ=255) cccGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGa < 5:26263/109‑1 (MQ=255) cccGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGa > 6:26263/1‑109 (MQ=255) ctggCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGc < 1:66616/128‑1 (MQ=255) ctggCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGc > 2:66616/3‑130 (MQ=255) ggcgtgAGGCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAAt < 8:240571/144‑1 (MQ=255) cTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGa > 4:53975/1‑149 (MQ=255) ccagtGGCCCCTGGCGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGt > 6:343828/5‑149 (MQ=255) tGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTtgtg > 8:89006/1‑149 (MQ=255) ccAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCt > 4:112237/1‑149 (MQ=255) ggCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGt > 8:104120/1‑120 (MQ=255) ggCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGt < 7:104120/120‑1 (MQ=255) ccACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTg < 5:208262/149‑1 (MQ=255) gCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCaccaac > 6:131047/1‑149 (MQ=255) aaGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCaccaacca < 3:53975/149‑1 (MQ=255) tGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCCACCagtagt > 4:144893/1‑149 (MQ=255) cACTAATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTgg < 2:71936/149‑1 (MQ=255) cTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTGGCt < 7:89006/149‑1 (MQ=255) aaTGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTGGCTCGATctg > 6:222004/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCCACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTTCACCAACCACTTGTGGATCGATctgc > 6:202706/1‑149 (MQ=255) tGGTTGTCATTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTGGCTCGATctgct > 1:40798/1‑149 (MQ=255) | ACCTGCTGCATCACAGTGGCAGCCTGCACGGGGCGATCCTTAGCGGTTCCAACTACCAACCGGCCGTGCTGTACCGCTTTGCGCGGCTGATTGCCCGGCTGGAGTCCTGGCGCCAGGGGCCACTGGGCAAGAGTGCACTGATCGAATGGTTGTCCTTCGGTTCGTTCAACAACGCCTTCAAGCCCAACCGCACGGCCTTCGACTGGCTCAGCCGCGACCCGGGCGAGGTCGATCAGTACGTGAATGACCCGTTGTGCGGCTTTCGCTGCACCAACCAGTTGTGGCTCGATCTGCT > NC_002947/5175562‑5175856 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |