| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5199395 | 58 (1.030) | 4 (0.070) | 4/248 | NT | 6.6% | coding (682/912 nt) | PP_4579 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | = 5199429 | 57 (1.050) | coding (716/912 nt) | PP_4579 | LysR family transcriptional regulator | |||||
TGCGTCGCTGGCCGAACTTGGGCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTG > NC_002947/5199247‑5199541 | tGCGTCGCTGGCCGAACTTGGGCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGC < 1:313689‑M1/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCGAACTTGGGCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTgc < 2:241535/149‑1 (MQ=255) gCCGAACTTGGGCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCAGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGa > 2:192435/1‑149 (MQ=255) ggCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGc < 7:12608/149‑1 (MQ=255) ggCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCGGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTgg < 6:285472/148‑1 (MQ=255) tcaacaCCTACTCGAAGAATTCACGCCCCCACCAGGAGTTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGTGGGCAGCGGCACCACGGTTGAATTGGGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTa < 8:148189/149‑1 (MQ=255) catcaCCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTAc > 3:106385/1‑149 (MQ=255) tcaCCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCggtagcgcgccaatgccaaagccgtcgcgcaacag > 5:178655‑M1/1‑114 (MQ=255) cACCTTCTCGAAGAATTAACCGCCGCACCAGGAGGTCCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAAATGTGTGAACTCGGTGGCGGAGATTACACGGCTGTTGCGAGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCgc < 8:143746‑M2/149‑3 (MQ=255) cTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCggtagcgcgccaatgccaaagccgtcgcgcaacagccgg < 6:178655‑M1/149‑40 (MQ=255) ttCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGgc > 4:93330/1‑149 (MQ=255) cGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCtt < 3:329381/121‑1 (MQ=255) cGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCtt < 3:334598/121‑1 (MQ=255) cGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCtg > 1:50433/1‑149 (MQ=255) cGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTAAAATACGTTGCTCCGATTAACATTATATTAATAGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCtg > 8:47130/1‑149 (MQ=255) cGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTAAAATACGTGGCTGCGATTAACAGTATATAGAGCGACGGCtt > 4:334598/1‑121 (MQ=255) gaagaaTTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTgcgc < 5:12347/112‑1 (MQ=255) gaagaaTTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTgcgc > 6:12347/1‑112 (MQ=255) gaagaaTTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCtgg > 5:143107/1‑149 (MQ=255) aagaaTTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTg < 5:172994/121‑1 (MQ=255) aagaaTTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTg > 6:172994/1‑121 (MQ=255) cGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCggtagcgcgccaatgccaaagccgtcgcgcaacagc < 6:142722‑M1/126‑37 (MQ=255) cGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCggtagcgcgccaatgccaaagccgtcgcgcaacagc > 5:142722‑M1/1‑90 (MQ=255) ggaggTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCgg‑‑g < 6:143107/149‑1 (MQ=255) gatgTGCTTTGCTTGGTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGTATTTTGTCAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACGGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCgg < 7:143746/144‑1 (MQ=255) gaggTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCgg‑‑gg > 7:129687/1‑149 (MQ=255) aggTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGc < 3:140867/149‑1 (MQ=255) aGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCAGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGCGCCGG‑‑GGCGAGCTg < 1:192435/147‑1 (MQ=255) tgcAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGctgctg > 8:239484/1‑149 (MQ=255) cAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTgg > 5:184853/1‑148 (MQ=255) aGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGaa < 7:280507/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAggg > 1:39549/1‑149 (MQ=255) cGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTTAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTg > 2:51377/1‑149 (MQ=255) gCAGAGGCACCTCGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGt < 4:246333/142‑1 (MQ=255) gCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGt > 3:246333/1‑142 (MQ=255) cacGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGGGAGGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAgccgccgcc > 1:300521/1‑147 (MQ=255) cacGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGc < 3:93330/149‑1 (MQ=255) cacGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGc > 6:188907/1‑149 (MQ=255) cacGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGc < 7:47130/149‑1 (MQ=255) cacGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTAACCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGc > 8:77466/1‑149 (MQ=255) cGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCt < 4:106385/149‑1 (MQ=255) gTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCtt > 3:83991/1‑148 (MQ=255) ttGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCtt > 3:134875/1‑147 (MQ=255) gAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAgccgc > 1:270586/1‑134 (MQ=255) gAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAgccgc < 2:270586/134‑1 (MQ=255) gAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGc > 1:81106/1‑149 (MQ=255) aTTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtg > 7:98559/1‑149 (MQ=255) ttGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtgg > 3:315859/1‑149 (MQ=255) ttGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtgg > 5:36794/1‑149 (MQ=255) gtgtgAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtggt < 6:184853/148‑1 (MQ=255) tgtgAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtggtgg > 7:50554/1‑149 (MQ=255) gtgAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtggtggt > 6:214196/1‑149 (MQ=255) gAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCtggtggtgg > 4:263167/1‑149 (MQ=255) aaCTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGgtggc > 2:315831/1‑149 (MQ=255) aCTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATg > 6:51815/1‑75 (MQ=255) cTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGgtggcgt < 3:263167/149‑1 (MQ=255) cTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGgtggcgt < 6:36794/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGgtggcgtgg < 2:39549/148‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCACTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCtt > 3:121359/1‑130 (MQ=255) ggTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCACTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCtt < 4:121359/130‑1 (MQ=255) gcggcgATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGa < 2:81106/148‑1 (MQ=255) cgATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCggg < 2:50433/149‑1 (MQ=255) gATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGc > 3:297708/1‑104 (MQ=255) gATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGc < 4:297708/104‑1 (MQ=255) ccGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCgccgggtaatcgccgccaccgagttcacacaattcaaccgtggtgcctctgcccccgcagcctgcagcaagctcagcacctcctggtgcggccgtgaattcttcgagaag < 6:178655‑M2/149‑111 (MQ=255) ccGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGt > 2:310043/1‑149 (MQ=255) cGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCGGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGtt > 1:332364/1‑149 (MQ=255) ggCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTg < 1:51377/149‑1 (MQ=255) gcggtagcgcgccaatgccaaagccgtctcgcaacagccgtgtaatctccgccaccgagttcacacatttcaaccgtggtgcctctgcccccgcagcctgcagcaagctcaggacctcctggtgcggcggttaattcttcgagaaggtg < 8:143746‑M1/149‑148 (MQ=255) gCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCgccgggtaatcgccgccaccgagttcacacaattcaaccgtggtgcctctgcccccgcagcctgcagcaagctcagcacctcctggtgcg > 5:142722‑M2/1‑36 (MQ=255) gCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCgccgggtaatcgccgccaccgagttcacacaattcaaccgtggtgcctctgcccccgcagcctgcagcaagctcagcacctcctggtgcg < 6:142722‑M2/126‑91 (MQ=255) cTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCgccgggtaatcgccgccaccgagttcacacaattcaaccgtggtgcctctgcccccgcagcctgcagcaagctcagcacctcctggtgcggccgtgaattcttcgagaaggtga > 5:178655‑M2/1‑35 (MQ=255) | TGCGTCGCTGGCCGAACTTGGGCGCGAGCGCATCATCACCTTCTCGAAGAATTCACGGCCGCACCAGGAGGTGCTGAGCTTGCTGCAGGCTGCGGGGGCAGAGGCACCACGGTTGAATTGTGTGAACTCGGTGGCGGCGATTACCCGGCTGTTGCGCGACGGCTTTGGCATTGGCGCGCTACCGCCGGCGCTGGTGGATGCCGAGTTGGGCCGG‑‑GGCGAGCTGGTGCTGCTGGAAGGGTTGCAGCCGCCGCCGAGCCTTGAGCTGGTGGTGGCGTGGCAGACCGGGGTGGCGTTG > NC_002947/5199247‑5199541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |