New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5601631 | 44 (0.780) | 3 (0.060) | 3/238 | NT | 7.6% | coding (1851/5418 nt) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
? | NC_002947 | = 5601675 | 32 (0.610) | coding (1807/5418 nt) | PP_4924 | subtilase family serine protease |
TCAGCAAGCTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCA > NC_002947/5601483‑5601778 | tCAGCAAGCTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCC < 8:20162‑M1/149‑1 (MQ=255) tCAGCAAGCTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCC > 6:159272‑M1/1‑149 (MQ=255) aaGCTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTc > 4:307187/1‑149 (MQ=255) cTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTcgcg < 7:109050/149‑1 (MQ=255) gCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCccac > 6:62207/1‑149 (MQ=255) cccGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCccac > 1:115211/1‑148 (MQ=255) ccGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCccacca > 2:65562/1‑149 (MQ=255) ccTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGc < 2:115211/149‑1 (MQ=255) cTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCa > 4:238356/1‑149 (MQ=255) cTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCa > 4:119755/1‑149 (MQ=255) cTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCa < 3:73572/149‑1 (MQ=255) cTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCa < 3:307187/149‑1 (MQ=255) tgaAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGTCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTc < 7:40846/149‑1 (MQ=255) tgaAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTc < 8:97517/149‑1 (MQ=255) tgaAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTc > 6:139368/1‑149 (MQ=255) gaAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCg > 4:14222/1‑149 (MQ=255) aaaaCTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGc < 1:65562/149‑1 (MQ=255) aaaCTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATTATGTCCGTACCCCGCACGCCTTGCTCGATTGTCAGCCCTGCCTTGTCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCACCACGATCAGTGCCGTGTCTCTCCCACCATTGCCCTGCATGTTAGc < 5:342112/148‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGcc > 6:306119/1‑148 (MQ=255) gcgTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGGTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAAtcgt < 5:326770/149‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCa < 4:75736/138‑1 (MQ=255) aCCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCa > 3:75736/1‑138 (MQ=255) aCCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCATCGCTgg > 3:349456‑M2/1‑147 (MQ=255) cgccgcTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacac < 1:169670‑M1/145‑45 (MQ=255) cgccgcTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacac > 2:169670‑M1/1‑101 (MQ=255) gcTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTggcactga > 5:139368‑M2/1‑141 (MQ=255) cTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgat < 6:165559‑M1/149‑54 (MQ=255) cTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTggcactgat > 3:119755‑M2/1‑140 (MQ=255) gCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCAc < 5:312068/149‑1 (MQ=255) tgatgTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAAt < 5:62207/149‑1 (MQ=255) tgTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATAc < 3:14222/148‑1 (MQ=255) gTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACAt > 7:78276/1‑149 (MQ=255) tCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACAtc < 3:65800/149‑1 (MQ=255) cTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTggca > 4:345754‑M2/1‑126 (MQ=255) cTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTggca < 3:345754‑M2/130‑5 (MQ=255) aCCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTATCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACAtcgtcg < 6:156041/148‑1 (MQ=255) ccccGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGcc < 4:270651/98‑1 (MQ=255) ccccGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGcc > 3:270651/1‑98 (MQ=255) gcccgccTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTcgcccgcc > 2:298078/1‑149 (MQ=255) cgcgATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGa < 5:306119/148‑1 (MQ=255) aTGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGgt < 3:238356/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCG‑CCCGCCGTGATAGGTGTtg < 1:298078/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtg < 3:269251/149‑1 (MQ=255) tCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtg > 3:218669/1‑149 (MQ=255) tCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtg < 3:342957/149‑1 (MQ=255) aGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtgc < 8:78276/148‑1 (MQ=255) cGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCAACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCAGTGATAACGAATTCATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGAGAGGTGTTGCTgcct > 4:251177/1‑148 (MQ=255) ccATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtg < 7:329342/134‑1 (MQ=255) ccATGTTCAGCCAAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTtg > 8:329342/1‑134 (MQ=255) tGTTCAGCCCAACGCCATTCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTCATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCaccaacc < 7:275354/149‑1 (MQ=255) tGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCATGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCaccaacc < 5:159272/149‑1 (MQ=255) aGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGcc > 7:3184/1‑148 (MQ=255) ccccACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCCGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCcg > 3:97537/1‑149 (MQ=255) ccACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCcgcg > 7:29968/1‑149 (MQ=255) ccACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCcgcg < 8:3184/149‑1 (MQ=255) aTCAGTGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaaggacatcatcgccag > 3:119755‑M1/1‑9 (MQ=255) aTCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaaggacatcatcgccag < 6:165559‑M2/149‑97 (MQ=255) tCAGTGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaaggacatcatcgccagc > 5:139368‑M1/1‑8 (MQ=255) tGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaag < 3:345754‑M1/130‑127 (MQ=255) tGCCagcgacgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaag > 4:345754‑M1/1‑4 (MQ=255) tGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGAca > 1:128350/1‑148 (MQ=255) ccagcgatgattgggcgaacatgcagggcaatggtgggcgcgacacggcactgatcgtgggggagcatggcgttgggctgaacatggccaaggccgggctgaccatcgcgcaaggcgggcggggtaaggacatcatcgccagcggcggt > 3:349456‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCAGCAAGCTGTCGCCCGAGCCGCCCTTGATGAAAACTCCGCGTTGACCGCCGCTGGCGATGATGTCCTTACCCCGCCCGCCTTGCGCGATGGTCAGCCCGGCCTTGGCCATGTTCAGCCCAACGCCATGCTCCCCCACGATCAGTGCCGTGTCGCGCCCACCATTGCCCTGCATGTTCGCCCAATCGTCGCTGGCACTGATCACGAATACATCGTCGCCCGCCCCGCCGTGATAGGTGTTGCTGCCACCGCCACCAACCAGCCAACTGCCCTCTGGGGCCGCGGTCAAGACATCA > NC_002947/5601483‑5601778 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |