| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5989267 = | 2914 (51.540) | 23 (0.460) | 18/230 | NT | 0.92% | noncoding (16/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
| ? | NC_002947 | 5989342 = | 2376 (47.140) | coding (53/399 nt) | PP_5247 | hypothetical protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 4088 total aligned reads displayed.
GTTCACACCAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGAT > NC_002947/5989119‑5989415 | gTTCACACCAATCCCTAGGAATTATCCTACACACAGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGGTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGTTGTGGAAACCCGGATGTTATGAAGGGCTGCCGTTATG < 6:277533‑M1/149‑1 (MQ=255)gTTCACACCAATCCCAAGTAATTATCCTACAGACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAATGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATG < 7:57321‑M1/149‑1 (MQ=255) tCACACCAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGG > 8:10168‑M1/1‑148 (MQ=255) acggtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggcttaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCa > 4:70611‑M1/146‑149 (MQ=255) ccaccAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCGGATTGTCGGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGAAGCACAGGTCGCTGTCGGTTAAGCGATCGGGGTGGGAAACCCGGAAGTGAGGAAGGGCTCCAGTTATGGCAG > 6:188831‑M1/2‑149 (MQ=255) gtgaataatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAGtt > 1:101273‑M1/143‑149 (MQ=255) acCAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTT > 8:192418‑M1/1‑149 (MQ=255) acCAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTT > 2:311061‑M1/1‑149 (MQ=255) cAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGG > 5:75243‑M1/1‑142 (MQ=255) aTCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGT > 6:95198‑M1/1‑144 (MQ=255) aatgggggatggccggcatcgcagcggctgaaagagcgttgtgtggtgttggggaggggtggatcggggacgattcttttcatggcaattccttctccaggattgaactgcaaccacccgtttccacgcagaaggcGGCAGTTGTgcgc < 5:221505‑M1/13‑1 (MQ=255) cAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt > 3:234929/1‑149 (MQ=255) cAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt > 6:255630/1‑149 (MQ=255) cAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGG < 2:20693‑M1/136‑1 (MQ=255) aaGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt > 3:337858/1‑148 (MQ=255) aaGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGt > 7:31617/1‑148 (MQ=255) aaGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTg < 1:57653/149‑1 (MQ=255) ggAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAg > 4:235383/1‑149 (MQ=255) 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8:163413/1‑135 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 3:127107/1‑148 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 2:171276/1‑148 (MQ=255) ggAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTCCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGc < 1:29564/73‑1 (MQ=255) gtaaCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGTCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 7:201765/146‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 6:62900/148‑1 (MQ=255) aCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 6:328011/149‑1 (MQ=255) ccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAgg > 4:28443/1‑148 (MQ=255) tgatgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCa < 6:350592/149‑1 (MQ=255) tgatgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCa > 1:320531/1‑149 (MQ=255) gatgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCTGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg < 2:339865/133‑1 (MQ=255) atgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGtt < 4:185138/118‑1 (MQ=255) atgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCAt < 3:159195/148‑1 (MQ=255) tgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCAt < 5:340648/147‑1 (MQ=255) tgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATg > 3:210376/1‑148 (MQ=255) tgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCAACGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATg > 2:249090/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGgaga > 8:127041/1‑134 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGa > 3:287219/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCATGGAGAAGGAATTGCCATGa > 4:158092/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTACTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAttctgggcg > 1:128646/1‑141 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 5:261048/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGCCGGTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 2:7947/149‑1 (MQ=255) cTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAAt > 6:302900/1‑149 (MQ=255) gTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTcc < 7:25892/149‑1 (MQ=255) gcggcaGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagccta > 6:37986‑M2/3‑63 (MQ=255) tGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGa > 8:275174/1‑149 (MQ=255) GGCAGTTGTGCGCTTGATGCAGTTTGTCCTAACTGCTTGCCTTCTCACCGTTTTTCCACACCGCTCACAACTGCCGCCTTCTTCGTGGAAACGGGTGTTTGCAGTTCAATCCTTGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGa > 3:76021‑M1/1‑148 (MQ=255) | GTTCACACCAATCCCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGAT > NC_002947/5989119‑5989415 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |