New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5989267 = | 2914 (51.540) | 23 (0.460) | 18/230 | NT | 0.92% | noncoding (16/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
? | NC_002947 | 5989342 = | 2376 (47.140) | coding (53/399 nt) | PP_5247 | hypothetical protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 3098 total aligned reads displayed.
CTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCATTATTCACCGTGAAC > NC_002947/5989194‑5989490 | tAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTgccg > 1:274851/1‑149 (MQ=255) gCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCtt < 4:264383/149‑1 (MQ=255) gCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCtt > 6:159965/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt > 5:232282/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt > 2:287787/1‑149 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGAGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAGCTGCCGCCTTCTGCGTg > 1:204381/1‑149 (MQ=255) ggTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTg > 7:310789/1‑148 (MQ=255) ggTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAACGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCGTGCCTTCCTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTg < 1:249838/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCTGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGa < 4:32612/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTgg > 3:10611/1‑148 (MQ=255) cGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGaaa < 6:194914/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAAc < 4:75154/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACg < 4:132160/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggt < 6:306644/149‑1 (MQ=255) tCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggt > 8:310392/1‑149 (MQ=255) gTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtggt > 2:113998/1‑149 (MQ=255) cAGCGATCGGGTGTTGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCATTTGGGCGCGGGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCGT‑CTCACCGGTCTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGtt < 1:84124/148‑1 (MQ=255) cAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTg < 5:309827/148‑1 (MQ=255) aGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa < 1:174839/149‑1 (MQ=255) aGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa < 5:159965/149‑1 (MQ=255) gCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAg < 5:111636/149‑1 (MQ=255) cGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt > 2:148982/1‑149 (MQ=255) gggTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAAt > 5:128021/1‑149 (MQ=255) ggTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa > 5:210502/1‑141 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTGACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTgg < 7:176143/149‑1 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTgg < 5:366420/149‑1 (MQ=255) tgGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg < 7:261218/148‑1 (MQ=255) ggAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTg > 5:348090/1‑134 (MQ=255) ggAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 4:231373/1‑147 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGTCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 5:330759/148‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGtt < 6:349248/132‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt > 8:5083/1‑137 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 1:121453/148‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 3:270109/148‑1 (MQ=255) gAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga < 1:229251/148‑1 (MQ=255) aCCCGGATGT‑TATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 7:126336/149‑1 (MQ=255) aCCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 2:225462/149‑1 (MQ=255) ccGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACgg > 8:222771/1‑121 (MQ=255) ccGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAgg > 8:28445/1‑148 (MQ=255) ccGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAgg > 7:151355/1‑148 (MQ=255) cGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGaa < 5:291711/149‑1 (MQ=255) ggATGT‑GATGAAGGTCTTGCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAt < 4:211977/149‑1 (MQ=255) ggATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAt > 3:248809/1‑149 (MQ=255) aTGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTg < 6:288142/149‑1 (MQ=255) aTGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTg < 2:5205/149‑1 (MQ=255) aTGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGACGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTACTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAAGCCTGGAGAAGGAATTg > 4:4803/1‑149 (MQ=255) tgt‑gATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGTCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGc > 4:161786/1‑149 (MQ=255) tgt‑gATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGc < 3:323727/149‑1 (MQ=255) tgt‑gATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGc < 6:61295/149‑1 (MQ=255) gt‑gATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGc > 8:331497/1‑148 (MQ=255) atgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCAt < 6:258513/148‑1 (MQ=255) tgaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATg > 3:62036/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGa > 2:181363/1‑148 (MQ=255) gaAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGa > 6:212980/1‑148 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGaa > 6:127608/1‑133 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 6:332018/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 5:252766/149‑1 (MQ=255) gggCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCAt > 8:118234/1‑143 (MQ=255) gCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 2:248794/1‑125 (MQ=255) gCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGaa > 3:128298/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc > 5:268809/1‑149 (MQ=255) gCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGtt < 7:71298/114‑1 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc < 8:71424/147‑1 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc < 2:332108/147‑1 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGt < 1:63000/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGa > 3:178707/1‑149 (MQ=255) GGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGc > 7:100840‑M1/1‑102 (MQ=255) TTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc > 2:307739‑M1/1‑140 (MQ=255) TGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc > 8:259002‑M1/1‑137 (MQ=255) CGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAtt > 3:204504‑M1/1‑115 (MQ=255) CGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTcc > 5:95860‑M1/1‑149 (MQ=255) CGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTcccc > 3:294708‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAAtcgtcccgggg < 1:303858‑M1/136‑5 (MQ=255) aGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAaca > 5:185945/1‑149 (MQ=255) aGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGACGCCTTCTGAGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCCACCCTCCCCAaca > 7:94155/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAAcacc < 4:297837/149‑1 (MQ=255) cTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAtt > 7:289353/1‑97 (MQ=255) cTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCGCCCCTCCCCAACACCACACAACGct > 1:143571/1‑149 (MQ=255) cTACCGGCTTGACTT‑CTCACCGGT‑TTTCAACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATACTGGAGAAGTAATTGCCATGAAAACAATCGACACAGAACCAACCCTCCCAAAAACCACACAACGct > 8:148368/1‑149 (MQ=255) tACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGctc > 8:181280/1‑149 (MQ=255) ggCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGACATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTc < 7:335501/149‑1 (MQ=255) gCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCa < 1:328036/149‑1 (MQ=255) ttGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTc > 6:371159/1‑107 (MQ=255) cTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTc > 1:34731/1‑118 (MQ=255) tt‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTAGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCAACCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTg > 5:5782/1‑149 (MQ=255) t‑ctcACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTCCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGc > 3:81658/1‑149 (MQ=255) tcACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGa > 1:39013/1‑149 (MQ=255) aCCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACGACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTATTTCAGCCCCTGCGATg > 7:53494/1‑149 (MQ=255) aCCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCAGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTAAATCCTGGAGAAGGAATAGCCATGAAAAGAATCGt > 1:100792/1‑96 (MQ=255) cGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGcc > 3:159508/1‑149 (MQ=255) gT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTTGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCCCTTTCAGCCGCTGCGATGCCgg < 7:225895/149‑1 (MQ=255) gT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGACTTCTGCGTTGAAACGGGTGGTCGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCTCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCgg < 4:186334/149‑1 (MQ=255) t‑tttCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACTCTCTTTAAGACGCTGCGATGCCgg > 3:226156/1‑148 (MQ=255) CCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACCCCCCACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATc < 3:353833‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATccc > 2:83430‑M1/1‑149 (MQ=255) ccGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCa < 6:238665/149‑1 (MQ=255) cacaactgccGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCattatt < 2:353359‑M2/139‑1 (MQ=255) caactgccGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCATTATTCa < 4:10785‑M2/141‑1 (MQ=255) aactgccGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCATTATTCAc < 2:207929‑M2/142‑1 (MQ=255) actgccGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCATTATTCAcc < 7:200706‑M2/143‑1 (MQ=255) | CTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGT‑GATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGT‑TTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCATTATTCACCGTGAAC > NC_002947/5989194‑5989490 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |