| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5989280 | 2824 (49.950) | 26 (0.520) | 13/230 | NT | 1.1% | noncoding (29/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
| ? | NC_002947 | = 5989327 | 2376 (47.140) | noncoding (76/87 nt) coding (38/399 nt) |
PP_mr64 PP_5247 |
C4 ncRNA hypothetical protein |
|||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 4010 total aligned reads displayed.
CCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCA > NC_002947/5989132‑5989428 | cAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGt > 5:131240/1‑149 (MQ=255) cAAGGAATTATCATACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACAAGGTAGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTTTGGAAACCCGGATCCGATGAAGGGCTGCCGTTATGGAAGTTG‑TGAGCGt > 6:98740/1‑149 (MQ=255) aGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGa < 3:238045/149‑1 (MQ=255) aGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGa < 5:206793/149‑1 (MQ=255) aaTTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGc > 3:316981/1‑149 (MQ=255) tCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGttt < 5:330225/149‑1 (MQ=255) tCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGttt > 6:3846/1‑149 (MQ=255) cTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTgg > 4:163531/1‑149 (MQ=255) tACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑c > 4:343803/1‑149 (MQ=255) gCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTtc > 8:31626/1‑149 (MQ=255) gCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTACGCTGACCAGGTCGCTGTCCGTTCAGCGATAGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCtt > 6:246077/1‑148 (MQ=255) cccGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGGGTGGAACCCCGGATGTGAGGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTtcg > 5:188304/1‑148 (MQ=255) ccGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTtctc > 3:191379/1‑149 (MQ=255) ccGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTtct > 6:33055/1‑148 (MQ=255) tGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCGCCgg > 3:107713/1‑149 (MQ=255) tGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCgg > 5:56444/1‑149 (MQ=255) aTTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGtt > 6:200145/1‑149 (MQ=255) tCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTTGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGtttt < 1:80613/148‑1 (MQ=255) 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4:53739/149‑1 (MQ=255) ggCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGa < 6:219948/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGaa < 3:164349/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTATGTCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTTG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGTTTTTCCACAGCTCGCAAAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc < 7:181603/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 2:24968/129‑1 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc > 1:190753/1‑149 (MQ=255) gCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 2:7996/128‑1 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCg > 3:21343/1‑92 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGt > 6:68539/1‑149 (MQ=255) cGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTc > 1:128830/1‑149 (MQ=255) ttATGGCAGGTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc < 8:72076/149‑1 (MQ=255) aTGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTg > 5:94369/1‑116 (MQ=255) ggCAGTTG‑TGCGCGgggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctaga < 5:307089‑M1/149‑136 (MQ=255) GGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACggg < 6:172612‑M1/95‑1 (MQ=255) gCAGTTG‑TGCGCGgggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgac > 5:349665‑M1/1‑13 (MQ=255) GCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATc > 8:135357‑M1/1‑149 (MQ=255) GCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATc < 2:494‑M1/149‑1 (MQ=255) cAGTTG‑TGCGCGgggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagaga < 4:287741‑M1/149‑138 (MQ=255) CAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATcc < 2:210275‑M1/149‑1 (MQ=255) ttG‑TGCGCGgggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagct > 7:203331‑M1/1‑9 (MQ=255) TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggt < 6:115167‑M1/88‑1 (MQ=255) TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc > 8:259002‑M1/1‑137 (MQ=255) GCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCa < 2:111068‑M1/120‑1 (MQ=255) gcggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagctggcttt < 4:243022‑M1/149‑147 (MQ=255) gcggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagaga > 4:262148‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagag > 5:252529‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagc > 3:81809‑M1/1‑3 (MQ=255) gcggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgg < 1:342702‑M1/91‑89 (MQ=255) cggggtggaaaaccggtgagaaggcaagccggtaggccaaacggcctcacgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagctggc < 5:289755‑M1/145‑144 (MQ=255) GTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGga > 1:101974‑M1/1‑103 (MQ=255) | CCAAGGAATTATCCTACACACCGTGTCGACGCCCGTCTGATTGTCCGGGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTG‑TGCGCGTGAGGCCGTTTGG‑CCTACCGGCTTGCCTTCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCA > NC_002947/5989132‑5989428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |