| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5989280 | 2824 (49.950) | 26 (0.520) | 13/230 | NT | 1.1% | noncoding (29/87 nt) | PP_mr64 | C4 ncRNA |
| ? | NC_002947 | = 5989327 | 2376 (47.140) | noncoding (76/87 nt) coding (38/399 nt) |
PP_mr64 PP_5247 |
C4 ncRNA hypothetical protein |
|||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3257 total aligned reads displayed.
GGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCA > NC_002947/5989179‑5989475 | ggAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCc < 8:128129‑M2/149‑2 (MQ=255) aaaGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCAccc < 7:151729/146‑1 (MQ=255) aaGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcg < 4:12359‑M2/149‑5 (MQ=255) aGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgc > 8:31617‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcac < 5:219948‑M2/148‑8 (MQ=255) cAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcac < 6:33211‑M2/148‑8 (MQ=255) tctAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACAGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcccaactgcc < 8:228597‑M2/149‑15 (MQ=255) tAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgcc > 8:190906‑M2/1‑133 (MQ=255) ggCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCt < 6:199541/149‑1 (MQ=255) acTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCATGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCtt > 6:263690/2‑149 (MQ=255) tGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgcc < 5:314638‑M2/142‑15 (MQ=255) aCCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCt < 3:236671/147‑1 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt < 8:290431/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGt < 5:138731/149‑1 (MQ=255) aGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTg < 4:340397/149‑1 (MQ=255) ggTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAACGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCGTGCCTTCCTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTg < 1:249838/149‑1 (MQ=255) gTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgc > 2:291093‑M2/1‑121 (MQ=255) gCTGTCGGTTCAGCGTTCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAGAc < 4:228166/149‑1 (MQ=255) cTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTg < 6:170561/139‑1 (MQ=255) tGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACgg < 8:33431/149‑1 (MQ=255) tGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACgg > 3:215983/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACgg > 7:77088/1‑149 (MQ=255) gTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgcc > 1:229847‑M2/1‑115 (MQ=255) tCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACggg < 6:221930/148‑1 (MQ=255) tCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACggg < 7:34855/148‑1 (MQ=255) tCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggt < 1:301771/149‑1 (MQ=255) gtttCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCTGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtgg < 4:307973/147‑1 (MQ=255) cAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTg < 1:66459/148‑1 (MQ=255) gCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCtt > 5:371421/1‑125 (MQ=255) gCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACAGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAg > 4:253495/1‑149 (MQ=255) gCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCATT‑ATAACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCATTATGCGTGGAAACGGTTGTTTGCat > 7:226276/1‑148 (MQ=255) cGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt < 1:178827/149‑1 (MQ=255) cGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt > 4:87232/1‑149 (MQ=255) cGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt < 2:312160/149‑1 (MQ=255) gATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtg > 3:136018/1‑140 (MQ=255) aTCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACACCGCGCACAACTGCCGCGTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGtt > 5:240780/1‑148 (MQ=255) tCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACggg < 2:90202/136‑1 (MQ=255) ggTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATc < 1:86034/149‑1 (MQ=255) 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aaCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGaa < 6:109436/149‑1 (MQ=255) aCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 8:101792/149‑1 (MQ=255) aCCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg > 5:274181/1‑149 (MQ=255) ccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtggt > 3:285634/1‑126 (MQ=255) ccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa > 1:272760/1‑130 (MQ=255) ccGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGt < 2:11724/132‑1 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aGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCa < 5:198517/117‑1 (MQ=255) cTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAAt > 4:277714/1‑149 (MQ=255) tGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc > 2:184076/1‑149 (MQ=255) ccGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATc < 8:71424/147‑1 (MQ=255) cGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTc < 6:134259/149‑1 (MQ=255) gTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTcc > 3:94206/1‑149 (MQ=255) tATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGaaaa < 1:148835/138‑1 (MQ=255) GGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTc < 3:74501‑M1/143‑1 (MQ=255) CAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTg < 7:100212‑M1/85‑1 (MQ=255) aGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacggcgacctggtcagcctagagag < 7:126267‑M2/149‑92 (MQ=255) AGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAg < 5:298599‑M1/117‑1 (MQ=255) TGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTccc > 2:353364‑M1/1‑137 (MQ=255) CGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAAtt < 4:204504‑M1/115‑1 (MQ=255) GCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTccc > 6:307799‑M1/1‑149 (MQ=255) GTGAGGCCTTTTTGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCTGTTTTACACCCGGATCAGAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCATGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAg > 8:263506‑M1/1‑123 (MQ=255) GTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTcccc < 3:109828‑M1/148‑1 (MQ=255) ggCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAacac < 6:350387/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGc > 8:158951/1‑66 (MQ=255) ccGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGggtgg < 2:337803/79‑1 (MQ=255) gTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACcaca < 2:153706/149‑1 (MQ=255) ggCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCcgcgcacaactgccataacggcagcccttcatcacatccgggtttccacacccgatcgctgaaccgacagcgacctggtcagcctagagagctggctttccccggacaatca > 1:34991‑M2/1‑36 (MQ=255) ccTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGc > 3:346178/1‑149 (MQ=255) ccGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCtt > 7:201496/1‑149 (MQ=255) ttGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGc > 5:260380/1‑149 (MQ=255) tGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGT‑GAAACGggt > 3:260408/1‑58 (MQ=255) gCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACcaca < 5:167984/132‑1 (MQ=255) gCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGc < 3:312105/147‑1 (MQ=255) cTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCACCACCACCCAACGCTCTTTCAGACGCt > 5:335517/1‑149 (MQ=255) ctcACCGGGTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGc < 4:152825/148‑1 (MQ=255) tcACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGa > 3:167253/1‑149 (MQ=255) tcACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGa > 5:116194/1‑149 (MQ=255) tcACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGa > 5:72647/1‑149 (MQ=255) aCCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGc < 6:60636/145‑1 (MQ=255) aCCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCAGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTAAATCCTGGAGAAGGAATAGCCATGAAAAGAATCGt > 1:100792/1‑96 (MQ=255) ccGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTc > 6:289044/1‑135 (MQ=255) TTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCa < 1:45042‑M1/149‑1 (MQ=255) TCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTTGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCa > 7:57292‑M1/1‑148 (MQ=255) CACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATcc > 3:51745‑M1/1‑149 (MQ=255) CCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATcccc < 3:194007‑M1/149‑1 (MQ=255) cccGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACaa > 1:21052/1‑114 (MQ=255) ccGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACcacac > 7:318939/1‑111 (MQ=255) | GGGAAAGCCAGCTCTCTAGGCTGACCAGGTCGCTGTCGGTTCAGCGATCGGGTGTGGAAACCCGGATGTGATGAAGGGCTGCCGTTATGGCAGTTGTGCGCGTGAGGCCGTTTGGCCTACCGGCTTGCCTT‑CTCACCGGTTTTCCACCCCGCGCACAACTGCCGCCTTCTGCGTGGAAACGGGTGGTTGCAGTTCAATCCTGGAGAAGGAATTGCCATGAAAAGAATCGTCCCCGATCCACCCCTCCCCAACACCACACAACGCTCTTTCAGCCGCTGCGATGCCGGCCATCCCCCA > NC_002947/5989179‑5989475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |