| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 6133582 = | 51 (0.900) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 5.6% | coding (271/2010 nt) | copA‑II | copper resistance protein A |
| ? | NC_002947 | 6133624 = | 53 (0.980) | coding (229/2010 nt) | copA‑II | copper resistance protein A | |||||
CAGTAGGTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGTGCCTGT > NC_002947/6133434‑6133726 | cAGTAGGTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGtt > 8:327096/1‑149 (MQ=255)cAGTAGGTGACGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCCTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCAGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGACGAGCCAGTGGAAGGAGGTGTCCTGATGCAAGCGGtt > 3:277082/1‑149 (MQ=25) aGTAGGTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTg < 7:33557/149‑1 (MQ=255) gccggtctgggctgtgaccagccctggccaaccgaatgttctgacaggcaccgattttgatctctacatcggtgagttgccggtcaacattaccggcactgtacgtacagcgatggcaatcaacggctccattcccgggcccatccTgc > 2:73267‑M1/147‑149 (MQ=255) gTAGGTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTgc < 8:140344/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTgcgc < 6:184524/148‑1 (MQ=255) ctgctgGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGc < 5:256881/148‑1 (MQ=255) gctgGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGt > 2:20088/1‑148 (MQ=255) ttGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAACGTGACGGTATc > 1:303263/1‑149 (MQ=255) aCTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGccc < 4:19402/149‑1 (MQ=255) gTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGCTGTCCTGCTGCAAGCCGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTcgc > 1:143820/1‑149 (MQ=255) gaatgttctgacaggcaccgattttgatctctacatcggtgagttgccggtcaacattaccggcactgtacgtacagcgatggcaatcaacggctccattcccgggcccatccTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCgcgc < 5:91042‑M1/35‑1 (MQ=255) tCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCa > 2:130927/1‑149 (MQ=255) aTACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCTGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAgc > 4:161644/1‑149 (MQ=255) aTACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAgc > 2:119705/1‑149 (MQ=255) aTACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAgc > 5:102909/1‑149 (MQ=255) ataccGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCa < 2:188666/145‑1 (MQ=255) acaggcaccgattttgatctctacatcggtgagttgccggtcaacattaccggcactgtacgtacagcgatggcaatcaacggctccattcccgggcccatccTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAg > 6:91042‑M1/104‑146 (MQ=255) acaggcacagattttgatctctacatcggtgagttgccggtcaacattaccggcactgtacgtacagcgatggcaatcaacggctccattcccgggcccatccTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGAt > 3:264070‑M1/104‑149 (MQ=255) ggCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCgg < 6:102909/149‑1 (MQ=255) gATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGaa > 8:149826/1‑149 (MQ=255) cATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGc > 8:327583/1‑137 (MQ=255) cATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGc < 7:327583/137‑1 (MQ=255) cATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAg < 7:5958/149‑1 (MQ=255) cATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAg > 3:71227/1‑149 (MQ=255) aGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGAtt < 7:327096/147‑1 (MQ=255) ggCCCGGCTCGCCGTGCAGGTTCGGCGGCAGGATGATGCGGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGcc < 8:30396/149‑1 (MQ=255) ggCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGtt > 4:34079/1‑142 (MQ=255) ggCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGtt < 3:34079/142‑1 (MQ=255) gCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCa > 3:125088/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCa > 2:86298/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTgt < 1:86298/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATgg > 1:140801/1‑125 (MQ=255) cGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTgtacg > 6:336366/1‑148 (MQ=255) aTGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGtt > 6:360661/1‑125 (MQ=255) aTGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGtt < 5:360661/125‑1 (MQ=255) gTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGc > 4:96181/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGc > 8:272258/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCgg > 3:330613/1‑148 (MQ=255) gCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATg < 3:161644/149‑1 (MQ=255) gCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATg < 7:272258/149‑1 (MQ=255) cAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGt < 2:303263/149‑1 (MQ=255) cAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGt < 4:125088/149‑1 (MQ=255) atgatgCCGTGCCAGTGGTTGGAGGTGTCCTGCTGGTAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGa < 4:277082/148‑1 (MQ=255) gatgCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCG‑CCTCCCCCCAGCCCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCAAAGCTGTACGTACAGTTCCGGTAAAGTTTACCgg > 8:15069/1‑149 (MQ=255) cGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTa < 7:106155/134‑1 (MQ=255) cGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTa > 8:106155/1‑134 (MQ=255) cAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCAcc < 7:149826/149‑1 (MQ=255) tggatggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGATATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACAGGCAACTCACCGAt > 1:265450/1‑149 (MQ=255) tggatggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGGGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGAt < 4:71227/149‑1 (MQ=255) gatggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATg > 1:122906/1‑148 (MQ=255) gatggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATg > 1:268819/1‑148 (MQ=255) atggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATg > 5:103196/1‑147 (MQ=255) tggaGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTag < 1:20088/149‑1 (MQ=255) gtgtCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGAt > 7:237138/1‑148 (MQ=255) gtgctgcAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTTAGGGTAT‑GGCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAAt < 7:15069/147‑1 (MQ=255) ctgcAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCg < 3:96181/148‑1 (MQ=255) cAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGt < 8:237138/147‑1 (MQ=255) aaGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGt < 6:249354/146‑1 (MQ=255) aaGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGTgag > 5:249354/1‑147 (MQ=255) ttGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGTGCCTGt > 5:197993/1‑146 (MQ=255) | CAGTAGGTGCCGTTCTGCTGGACCTTGAACTTGTACTCATACATGCCGTCTGGGGCGATGCCATGGAAGCTCAGGCCCGGCACGCCGTCCATGTTCGCCGGCAGGATGATGCCGTGCCAGTGGATGGAGGTGTCCTGCTGCAAGCGGTTGCGCACACGCAGCGTGACGGTATCGCCCTCGCGCCAGCGCAGGATGGGCCCGGGAATGGAGCCGTTGATTGCCATCGCTGTACGTACAGTGCCGGTAATGTTGACCGGCAACTCACCGATGTAGAGATCAAAATCGGTGCCTGT > NC_002947/6133434‑6133726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |