New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 99850 | 45 (0.800) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.8% | coding (559/651 nt) | PP_0094 | 5'‑nucleotidase |
? | NC_002947 | = 99924 | 40 (0.750) | coding (485/651 nt) | PP_0094 | 5'‑nucleotidase |
CTGATGCAAATCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGATTTCGCGGGCGAACT > NC_002947/99776‑100071 | cTGATGCAAATCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGAtcatca < 2:156483/149‑1 (MQ=255) aaaTCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAgggtttg < 4:61105‑M2/149‑8 (MQ=255) aaTCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGATTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTgc > 7:9651/1‑149 (MQ=255) aTCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTgcg > 3:200328/1‑149 (MQ=255) gCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCgg < 4:200328/149‑1 (MQ=255) aCCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTc > 2:218607/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGt < 2:330545/147‑1 (MQ=255) gCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGccc < 6:4962/149‑1 (MQ=255) gAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCct > 8:36190/1‑148 (MQ=255) gTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCcttctt < 1:47734/149‑1 (MQ=255) tGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCttcttc < 3:61105/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATcc < 3:222482/149‑1 (MQ=255) cttctGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCaaa < 7:90635/146‑1 (MQ=255) cttctGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCaaa > 8:90635/1‑146 (MQ=255) tGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGt < 6:232100/119‑1 (MQ=255) tGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGt > 5:232100/1‑119 (MQ=255) ccATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAAt < 7:36190/148‑1 (MQ=255) ccATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATc < 6:101294/149‑1 (MQ=255) tctTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCTGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGACCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGa > 6:30424/1‑148 (MQ=255) cccGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGTGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGAcc < 1:211454/146‑1 (MQ=255) cGGCTCCCAAACCCGTACCCCCCCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCTGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCttgtt > 6:301701/1‑149 (MQ=255) cGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAgggtttgggagccgggaagagctgatggcagaagaacccgctttccacttcgccacggtag < 7:29313‑M2/149‑62 (MQ=255) ggCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCttgttg < 8:9651/149‑1 (MQ=255) ccAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAgggtttgggagccgggaagagctgatggcagaagaacccgctttccacttcgccacggtagccgatt < 5:348843‑M2/149‑68 (MQ=255) cACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGcgcg < 4:281033/137‑1 (MQ=255) cACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGcgcg > 3:281033/1‑137 (MQ=255) cACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGtt > 2:172872/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCg < 3:58461/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCg > 5:234081/1‑144 (MQ=255) cccGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCAAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGAGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCt > 8:206950/1‑149 (MQ=255) cgcgcgcCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGtga < 7:206950/147‑1 (MQ=255) cgcgcCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCTGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTgatgat < 5:30424/149‑1 (MQ=255) cgcgcCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTgatgat < 1:218607/149‑1 (MQ=255) gcgcCGATCAGTGCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATc < 6:330554/149‑1 (MQ=255) gcgcCGATCAGGTCATGCTTGTGGTCCCCGATCATCAg > 5:287008‑M2/1‑37 (MQ=255) gcgcCGATCAGGTCATGCTTGTGGTCCCCGATCATCAg < 6:287008‑M2/38‑2 (MQ=255) gcgcCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAgggtttgggagccgggaagagctgatggcagaagaacccgctttccacttcgccacggtagccgatttgcatcaggcttttatcaaggcttgagcgccagcagggctgcttt > 6:348843‑M2/1‑37 (MQ=255) gcCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCg > 5:197466/1‑148 (MQ=255) cGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAAc > 5:370/1‑149 (MQ=255) gTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTAACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCaaact > 3:11707/1‑147 (MQ=255) aTGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCttgtt < 6:169788/84‑1 (MQ=255) aTGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCttgtt > 5:169788/1‑84 (MQ=255) gCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGaa < 6:123750/124‑1 (MQ=255) gCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGaa > 5:123750/1‑124 (MQ=255) ggTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGAtt > 7:104568/1‑149 (MQ=255) tCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCAc > 4:28880/1‑110 (MQ=255) tCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCAc < 3:28880/110‑1 (MQ=255) ccGATCACCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTg > 6:195134/1‑111 (MQ=255) ccGATCACCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTg < 5:195134/111‑1 (MQ=255) tcaGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGa < 4:299239/131‑1 (MQ=255) tcaGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGa > 3:299239/1‑131 (MQ=255) tcaGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGATTTCGTGGGCGAAc > 2:211591/1‑149 (MQ=255) tcaGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGATTTCGCGGGCGAAc > 6:148556/1‑149 (MQ=255) caGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATc < 4:57683/97‑1 (MQ=255) caGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATc > 3:57683/1‑97 (MQ=255) aGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGATTTCGCCCGCGaaat < 8:104568/148‑3 (MQ=255) | CTGATGCAAATCGGCTACCGTGGCGAAGTGGAAAGCGGGTTCTTCTGCCATCAGCTCTTCCCGGCTCCCAAACCCGTACCCCACCGCGACGGCCTGCAGCCCGTTGCTGCGCGCGCCGATCAGGTCATGCTTGCGGTCCCCGATCATCAGGGTTTGCGCCGGGTCCAGCCCTTCTTCATCCAGCAAATGGCGAATCAGCTCGACCTTGTTGGTGCGCGTGCCGTCCAGTTCACTGCCGTAGATCACCTTGAAGTGATGATCGAACGCAAAGTGCCGAGCGATTTCGCGGGCGAACT > NC_002947/99776‑100071 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |