New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 616014 | 45 (0.800) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 7.0% | coding (288/651 nt) | ribB | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
? | NC_002947 | = 616042 | 37 (0.680) | coding (260/651 nt) | ribB | 3,4‑dihydroxy‑2‑butanone‑4‑phosphate synthase |
GAAAAACATGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAATGATGTC > NC_002947/615899‑616190 | gAAAAACATGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcgg > 5:41652‑M2/1‑144 (MQ=255) aCATGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTg > 6:14634/1‑149 (MQ=255) aCATGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTCGTGCTGCGGTGCTGGTCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGCCGGTGAAACCTGTGCGGTggcgtgccgg > 8:122954‑M2/1‑139 (MQ=255) aTGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGGGGTGATGCGGCCCTGGGCGCTAACCCCGGGGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGgt < 7:261670/149‑1 (MQ=255) tGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGgtt < 2:78278/149‑1 (MQ=255) gCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGgttg > 8:80102/1‑149 (MQ=255) cccGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGgttgt > 4:319330/1‑148 (MQ=255) ccGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGTGGGCCTGGTTGTTc > 2:352052/1‑149 (MQ=255) ccGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTc < 1:125036/149‑1 (MQ=255) cGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCt < 2:154972/149‑1 (MQ=255) gCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcg < 4:37989‑M2/132‑5 (MQ=255) gCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcg > 3:37989‑M2/1‑128 (MQ=255) tGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGc < 3:319330/149‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAg < 5:100361/148‑1 (MQ=255) cGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTc > 4:102427/1‑148 (MQ=255) tCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTtc > 7:260563/1‑128 (MQ=255) tCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTtc < 8:260563/128‑1 (MQ=255) tCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCcag > 8:86836/1‑149 (MQ=255) aaTGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCcagg < 5:328136/148‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGcc < 5:135198/87‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGcc > 6:135198/1‑87 (MQ=255) tggtgATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCcaggcacagg < 2:32532/149‑1 (MQ=255) gATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGa > 1:13459/1‑149 (MQ=255) gATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGa < 3:102427/149‑1 (MQ=255) gCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGa > 1:22013/1‑149 (MQ=255) gCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGa > 6:135767/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGc > 8:276317/1‑149 (MQ=255) gTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGc < 7:80102/149‑1 (MQ=255) cTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCg < 2:22013/148‑1 (MQ=255) tGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACCGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCt > 6:275225/1‑149 (MQ=255) tGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCACGCTGGTGACGGTGACACCGGTGCCATGGAGGCCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCACGCCCAGGCAGCCGATGCCGCt > 4:208938/1‑149 (MQ=255) tAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATcg > 8:340385/1‑149 (MQ=255) ccccGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGa < 5:275225/149‑1 (MQ=255) cGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAatc < 7:340385/149‑1 (MQ=255) gtgATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATcatcat < 7:86836/149‑1 (MQ=255) tgATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGACAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATAATCATg > 5:272822/1‑149 (MQ=255) aTACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGc < 7:276317/149‑1 (MQ=255) aCCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGCGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCa > 8:160799/1‑149 (MQ=255) cTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCTAGCTGCAGTTCGTCGAc > 6:9278/1‑88 (MQ=255) cTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCTAGCTGCAGTTCGTCGAc < 5:9278/88‑1 (MQ=255) ggCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcggccgaaggtatcaccaccggggttagcgcccaggaccgcatcaccaccattgacgcagcactgcgttccagcgccgaacagcgccatatcgtcagcccggggcatgtttt < 5:183371‑M2/149‑115 (MQ=255) ccgccTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcggccgaaggtatcaccaccggggttagcgcccaggaccgcatcaccaccattgacgcagcactgcgttccagcgccgaacagcgccatatcgt < 7:223476‑M2/129‑97 (MQ=255) ccgccTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTggcggccgaaggtatcaccaccggggttagcgcccaggaccgcatcaccaccattgacgcagcactgcgttccagcgccgaacagcgccatatcgt > 8:223476‑M2/1‑33 (MQ=255) ccTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGAAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCCGc > 5:210765/1‑149 (MQ=255) aaCCGGTGCCGTGGTGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTcggcggc < 1:352052/148‑1 (MQ=255) cGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCCTGGCCATGGTCTGCAGCGGATTGTTCTCggcggcggc > 3:286275/1‑148 (MQ=255) gTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAat > 6:154364/1‑149 (MQ=255) ccGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAatgat < 5:135767/149‑1 (MQ=255) cGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAatgatg > 4:124808/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAATGATGTc < 5:154364/149‑1 (MQ=255) | GAAAAACATGCCCCGGGCTGACGATATGGCGCTGTTCGGCGCTGGAACGCAGTGCTGCGTCAATGGTGGTGATGCGGTCCTGGGCGCTAACCCCGGTGGTGATACCTTCGGCCGCCTCGATGGTGACGGTGAAACCGGTGCCGTGGCGGGCCTGGTTGTTCTGCACCATGGGTGCCAGCTGCAGTTCGTCGACGGTGGCTTCGTCCAGGCACAGGCAGACGATGCCGCTGCAATCGCGAATCATCATGGCCATGGTCTGCAGCGTAATGTTCTCGGCGGCGGCAATGATGTC > NC_002947/615899‑616190 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |