New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1105875 | 57 (1.010) | 3 (0.050) | 3/250 | NT | 6.0% | coding (355/1326 nt) | hisD | histidinol dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 1105936 | 38 (0.690) | coding (416/1326 nt) | hisD | histidinol dehydrogenase |
CAGCGCGAGGCCCTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGCTGCCTGCATCGCTGGT > NC_002947/1105788‑1106078 | cAGCGCGAGGCCCTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGGGCGCACTCATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGGACACCGAGGCCGACGGCACCGGGCTCGGCCAGAAGGGCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCggg < 8:257287/149‑1 (MQ=255) cgAGGCCCTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCa < 2:100617/149‑1 (MQ=255) ggCCCTGGAAACGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCCCGCGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAg < 8:336471/148‑1 (MQ=255) cccTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGcg > 5:105456/1‑149 (MQ=255) ccTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCATGTATGTGCCGGGCGGCAAGGagt > 4:86568/1‑149 (MQ=255) cTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGcgtc < 1:286776/149‑1 (MQ=255) gAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTa > 8:269032/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCAGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTa > 3:237884/1‑149 (MQ=255) gccgccAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCcgtc > 4:132202/1‑149 (MQ=255) cAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCgg < 7:269032/149‑1 (MQ=255) aCCGTGTGCGCATTTATCTCGAGCGGCAGAATCAGGATGCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGGCAGATGGTCACCCCGCTGGACGGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTg < 8:158510/149‑1 (MQ=255) aCCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTg > 6:209674/1‑149 (MQ=255) tttATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGcc < 1:323803/149‑1 (MQ=255) aTCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGcc > 5:157643/1‑146 (MQ=255) aTCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGcc < 6:157643/146‑1 (MQ=255) gCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAgg > 5:337553/1‑149 (MQ=255) aGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTTTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGcc < 3:132202/149‑1 (MQ=255) cTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACt > 5:167182/1‑148 (MQ=255) tGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCTGCAAGGCGTCGTAc < 6:299645/96‑1 (MQ=255) tGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTAc > 5:299645/1‑96 (MQ=255) aGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGcggcctcggtgtactgccaggaatcctgcttctgccgctcgtgataaatgcgcacacggttggcggccttttc < 3:117200‑M2/149‑74 (MQ=255) aGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAgtg < 6:167182/149‑1 (MQ=255) aGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAgtg > 5:364833/1‑149 (MQ=255) gTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAgtgg < 7:295332/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGcggcctcggtgtactgccaggaatcctgcttctgccgctcgtgataaatgcgcacacggttggcggccttttccagggc < 4:277389‑M2/149‑80 (MQ=255) ccGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGAtg > 7:67310/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGAtggt < 5:108124/149‑1 (MQ=255) ggCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGAtggtgg < 6:364833/149‑1 (MQ=255) gCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATggtggt < 8:67310/149‑1 (MQ=255) gACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTCGTGATGGTGGTGcc < 7:305395/149‑1 (MQ=255) gACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCGGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGGCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGcc < 4:296219/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGAcccc > 5:312507/1‑149 (MQ=255) tGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCgg < 5:209674/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGTCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCggg > 2:68244/1‑149 (MQ=255) ttCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGGCTGTATGTGCCGGGCGGCTAGGCGTCGTAGCCGTCGTGGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGGC‑ATGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGGCGTCGCCGCggg < 2:153885/147‑1 (MQ=255) gCCAGAAGGTCACCCCTCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTTGTGCCGACCCCGCGGGGTGAg < 3:86568/149‑1 (MQ=255) ggTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGcggcctcggtgtactgccaggaatcctgcttctgccgctcgtgataaatgcgcacacggttggcggccttttccagggcctcgcgctggaccggggtaatacgggtcagc > 4:117200‑M2/1‑39 (MQ=255) gTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGa < 8:87654/149‑1 (MQ=255) aCCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCt < 4:237884/149‑1 (MQ=255) gCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGctgcct < 6:337553/147‑1 (MQ=255) cTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGctgc < 2:41536/143‑1 (MQ=255) cTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGctgc > 1:41536/1‑143 (MQ=255) tgtgCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGTCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGCTGCCTGCATCGCTg < 1:68244/149‑1 (MQ=255) gCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCCAAAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGCTGCCTGCATCGCTGgt > 1:98376/1‑149 (MQ=255) | CAGCGCGAGGCCCTGGAAAAGGCCGCCAACCGTGTGCGCATTTATCACGAGCGGCAGAAGCAGGATTCCTGGCAGTACACCGAGGCCGACGGCACCGTGCTCGGCCAGAAGGTCACCCCGCTGGACCGTGCTGGCCTGTATGTGCCGGGCGGCAAGGCGTCGTACCCGTCGTCGGTGCTGATGAACGCCATCCCGGCC‑AAGGTTGCCGGCGTGACTGAAGTGGTGATGGTGGTGCCGACCCCGCGGGGTGAGGTCAACGAGCTGGTACTGGCGGCTGCCTGCATCGCTGGT > NC_002947/1105788‑1106078 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |