| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1403673 = | 54 (0.960) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 7.3% | coding (2009/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer |
| ? | NC_002947 | 1403710 = | 50 (0.930) | coding (1972/2067 nt) | PP_1228 | methyl‑accepting chemotaxis transducer | |||||
CGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCTGCAGTGCCGGTAGTGC > NC_002947/1403562‑1403857 | cggtgatcagcgacatgaacttgcagatagcctcggcggcggaagagcagagtgcggtggccgaggaagtgaaccgtaacgtggccggcattcgagacgtgacagaatcacTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCccagccag > 3:180154‑M1/112‑149 (MQ=255) ggtgcCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGt < 3:147219/149‑1 (MQ=255) tgatcagcgacatgaacttgcagatagcctcggcggcggaagagcagagtgcggtggccgaggaagtgaaccgtaacgtggccggcattcgagacgtgacagaatcacTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGa > 2:215068‑M1/109‑149 (MQ=255) ccTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGAtt > 4:310437/1‑149 (MQ=255) tGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCt > 1:313412/1‑149 (MQ=255) tCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGt > 5:303388/1‑149 (MQ=255) ctTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAAATGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCATTGATAATGTCACGtctc > 4:88415/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 6:339022/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCg > 4:309281/1‑148 (MQ=255) cgcgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCACAGCCAGTGATTCTGTCCCGGCTCGAAt > 8:225130/1‑149 (MQ=255) gcgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATg < 3:333111/149‑1 (MQ=255) gcgGGCACGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAAt < 3:309281/148‑1 (MQ=255) cgGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGc < 1:265336/149‑1 (MQ=255) gggcacgCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGcc > 7:248367/7‑149 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGt > 8:259456/1‑149 (MQ=255) gcgAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCt < 6:316953/122‑1 (MQ=255) gcgAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCt > 5:316953/1‑122 (MQ=255) gatgagGCCCTGACAGGCTAGACGCGAATCTGCTCCATGAGCGCCTGCTGGTGGTTGGGCAGCCGGTTCTGGGCTTGGATTATGCGTGCCGATTGATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACg < 6:357423/146‑1 (MQ=255) aaGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACgg < 1:341097/149‑1 (MQ=255) gagGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCCGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGGTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACgggt < 7:225130/149‑3 (MQ=255) ggaagagcagagtgcggtggccgaggaagtgaaccgtaacgtggccggcattcgagacgtgacagaatcacTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGt > 3:134974‑M1/72‑110 (MQ=255) ggaagagcagagtgcggtggccgaggaagtgaaccgtaacgtggccggcattcgagacgtgacagaatcacTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGt < 4:134974‑M1/39‑1 (MQ=255) gCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCAc < 4:236269/149‑1 (MQ=255) cTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGTTTCACTTc < 1:315600/149‑1 (MQ=255) tAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGcc > 3:1532/1‑119 (MQ=255) tAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGcc < 4:1532/119‑1 (MQ=255) gACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCg > 7:301347/1‑149 (MQ=255) cgcgAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGcggcgg > 6:162608/1‑142 (MQ=255) gcgAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCAc > 2:207431/1‑149 (MQ=255) gAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGtt > 8:303429/1‑127 (MQ=255) gAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGtt < 7:303429/127‑1 (MQ=255) gAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCActc > 3:2191/1‑149 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGTCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑Gctc < 3:88415/147‑1 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑Gctct < 1:207431/148‑1 (MQ=255) cATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTcc < 8:248367/148‑1 (MQ=255) cATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTcc < 7:259456/148‑1 (MQ=255) aGCGCCTGCGGCTGGTTGGCCAGCCGGGGCAGGTCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCCTCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGGCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTccgccg < 7:85282/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTccgccgcc > 2:216501/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAgg > 2:132485/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAgg < 6:303388/149‑1 (MQ=255) ctgctgGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCt < 3:310437/148‑1 (MQ=255) ctgctgGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTa < 2:313412/149‑1 (MQ=255) ttCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCt < 1:216501/149‑1 (MQ=255) tCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCt > 3:343750/1‑148 (MQ=255) aGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGAt > 3:255379/1‑149 (MQ=255) tcactggctgggcaggccgatgaatcggcacgcatcagccaGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCa > 2:215068‑M2/42‑149 (MQ=255) ggCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCa > 6:272627/1‑149 (MQ=255) ggCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCa > 6:72723/1‑149 (MQ=255) actggctgggcaggccgatgaatcggcacgcatcagccaGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTcc < 4:134974‑M2/71‑1 (MQ=255) actggctgggcaggccgatgaatcggcacgcatcagccaGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTcc > 3:134974‑M2/40‑110 (MQ=255) ctggctgggcaggccgatgaatcggcacgcatcagccaGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCg > 3:180154‑M2/39‑149 (MQ=255) GATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTc < 6:200100‑M1/127‑1 (MQ=255) GATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTc > 5:200100‑M1/1‑127 (MQ=255) aTGCGTGCCGACTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTCTCACGGCTCGAATGCCGGCCACGTTACGCTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTCATCACCGCCACGGc < 4:2191/149‑1 (MQ=255) ccggCCGATCCCTCCGCCGGCCCAGCCAGCGCTTCTGTCCCGTCTCGACTGCCGGCCACGTTACGGGTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTc < 8:301347/146‑1 (MQ=255) gTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCg > 4:237058/1‑149 (MQ=255) tGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGc < 4:255379/149‑1 (MQ=255) gCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGc > 5:43883/1‑148 (MQ=255) gCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCACTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAACTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCACGc > 1:110256/1‑148 (MQ=255) ttCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATAc < 5:339022/149‑1 (MQ=255) aTCGTCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCt < 2:216430/149‑1 (MQ=255) ccagccagTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCTGCAGTGCCgg > 2:122567/1‑149 (MQ=255) agccaGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCTGAGGAGCTTCCGCCGCCGAGGCTATATGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCTGCAGTGCCg > 1:292395‑M2/6‑149 (MQ=255) aGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCTGCAGTGCCGGTAGTGc > 3:172593‑M2/2‑149 (MQ=255) | CGGTGCCTGTCAGGGCCTCTTCGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCCTGACAGGCTAGACGCGAAACTGCTCCATCAGCGCCTGCTGCTGGTTGGCCAGCCGGTTCAGGGCTTGGCTGATGCGTGCCGATTCATCGGCCTGCCCAGCCAGTGATTCTGTCACGTCTCGAATGCCGGCCACGTTACGGTTCACTTCCTCGGCCACCGCACTCT‑‑‑GCTCTTCCGCCGCCGAGGCTATCTGCAAGTTCATGTCGCTGATCACCGCCACGGCCTCGCCAATACGCTGCAGTGCCGGTAGTGC > NC_002947/1403562‑1403857 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |