New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2403799 = | 54 (0.960) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 7.2% | coding (426/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
? | NC_002947 | 2403860 = | 54 (1.040) | coding (487/1209 nt) | PP_2106 | ammonium transporter |
ATTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTC > NC_002947/2403713‑2404008 | aTTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGa < 3:12335/149‑1 (MQ=255) cGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTg > 5:65675/1‑149 (MQ=255) gcgcGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTc > 1:325126/1‑149 (MQ=255) gTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtgg < 3:97040/149‑1 (MQ=255) ttCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTgtggt < 2:326895/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGtggtgg < 1:182728/148‑1 (MQ=255) gTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGAGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTggtggt < 6:168557/149‑1 (MQ=255) gCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTa > 1:125285/1‑148 (MQ=255) cGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTacac > 1:344416/1‑149 (MQ=255) cGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTacac < 2:151138/149‑1 (MQ=255) gcTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCtgtg < 7:223514/129‑1 (MQ=255) gcTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCtgtg > 8:223514/1‑129 (MQ=255) gcTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATgggggg > 1:324793/1‑149 (MQ=255) tACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGggct > 7:177494/1‑149 (MQ=255) gATCGTGGCGTTCGTCTATGCGTTCTTCGAGGGTGGGGTGTGGTACGGTAATCTGGACCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGGCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGgctggcg < 8:76874/148‑1 (MQ=255) gATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGgctggcg < 2:325126/148‑1 (MQ=255) tGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGctggcgctggcg > 1:144943/1‑149 (MQ=255) tGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGctggcgctggcg < 2:125285/149‑1 (MQ=255) ttCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGt > 8:118177/1‑149 (MQ=255) gTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCt > 7:111302/1‑149 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATgggg > 1:83578/1‑118 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATgggg < 2:83578/118‑1 (MQ=255) tCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGt < 2:144943/146‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCCCGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACCCGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGTCGGGGGTGTTGc > 8:327858/1‑146 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGggctg > 8:75169/1‑120 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGggctg < 7:75169/120‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTgg < 2:324793/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTgg < 4:2646/149‑1 (MQ=255) gTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTGCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGGGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGc < 7:327858/146‑1 (MQ=255) ttcGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGgcgc > 3:7759/1‑149 (MQ=255) tgtggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTg < 8:251798/149‑1 (MQ=255) ggtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGc < 2:344416/149‑1 (MQ=255) gtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCg > 6:144301/1‑149 (MQ=255) gtgtggAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCg > 6:77870/1‑149 (MQ=255) gtggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCgg > 6:192525‑M2/62‑148 (MQ=255) tggaacggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTa > 3:95863‑M2/61‑149 (MQ=255) GAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTTGGCGCGCGCCGTGGGCGGTAcc < 5:362613‑M1/149‑1 (MQ=255) GAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTAcc < 4:254121‑M1/149‑1 (MQ=255) AACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGt < 7:301157‑M1/116‑1 (MQ=255) AACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGt > 8:301157‑M1/1‑116 (MQ=255) acggtgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACcgc < 5:192525‑M2/93‑1 (MQ=255) ACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACcgc > 6:65675‑M1/1‑149 (MQ=255) GGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGACTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGa < 5:336331‑M1/149‑1 (MQ=255) tgcgccgaagcgtgcctgcagccaagcctgtaggcccagattaccgttccacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATg < 4:95863‑M2/97‑1 (MQ=255) TAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATg < 4:166151‑M1/149‑1 (MQ=255) aaTCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGACTGGCTGGCGCTggcgg > 5:17181/1‑106 (MQ=255) aaTCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGACTGGCTGGCGCTggcgg < 6:17181/106‑1 (MQ=255) aTCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATgg < 5:77870/148‑1 (MQ=255) aTCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATgg < 6:362613/148‑1 (MQ=255) tGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGt > 1:160825/1‑149 (MQ=255) ggCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGt < 3:254121/147‑1 (MQ=255) ggCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGACTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGttt < 6:336331/149‑1 (MQ=255) aCAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGc > 5:93260/1‑125 (MQ=255) aCAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGc < 6:93260/125‑1 (MQ=255) aCAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtggtgg > 1:165011/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtggtgg < 8:177494/148‑1 (MQ=255) gCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCttt > 3:281018/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCttt > 3:321633/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTgcgc > 3:46418/1‑148 (MQ=255) tGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtgg > 2:324557/1‑135 (MQ=255) tGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtgg < 1:324557/135‑1 (MQ=255) tGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCa > 3:280995/1‑149 (MQ=255) aCGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCa > 8:107466/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtggt < 1:249422/125‑1 (MQ=255) ttCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTtggt > 2:249422/1‑125 (MQ=255) cGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTcc < 3:166151/147‑1 (MQ=255) cgcACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCttt < 7:64924/126‑1 (MQ=255) cgcACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCttt > 8:64924/1‑126 (MQ=255) cacGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTggg < 2:165011‑M2/146‑1 (MQ=255) cACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCCGATGGGGGGATGCATGCCGATGGCGGCGGTGCTTTTGATGGGCGCCCGCCGTGGCCGGTACCGCGAGGGGCGTTTGTTGGCTTTTGCGCCAGCGTCAATTCCCTTGATGgccgtgg > 1:48506/1‑144 (MQ=255) acGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCCCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGc > 7:251809‑M2/3‑149 (MQ=255) gACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTc > 4:145576/1‑149 (MQ=255) | ATTGCCGAGCGGGCGCGGTTCGTGCCGCAGTTGTGCGCTACGGCGTTGATCGTGGCGTTCGTCTATCCGTTCTTCGAGGGTGTGGTGTGGAACGGTAATCTGGGCCTACAGGCTTGGCTGCAGGCACGCTTCGGCGCACCGTTCCACGACTTTGCCGGGTCTGTGGTGGTACACGCC‑ATGGGGGGCTGGCTGGCGCTGGCGGCGGTGCTGTTGCTGGGCGCGCGCCGTGGGCGGTACCGCGATGGGCGTTTGGTGGCTTTTGCGCCATCGAGCATTCCCTTTCTGGCGCTGGGCTC > NC_002947/2403713‑2404008 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |