| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2642094 = | 58 (1.030) | 6 (0.110) | 6/248 | NT | 9.7% | coding (357/1407 nt) | PP_2312 | lytic transglycosylase family protein |
| ? | NC_002947 | 2642131 = | 56 (1.030) | coding (394/1407 nt) | PP_2312 | lytic transglycosylase family protein | |||||
CGCCGACGACCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCTGATCCAGCAGGT > NC_002947/2641992‑2642270 | cgccgACGACCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGa > 4:345702/1‑149 (MQ=255)cgccgACGACCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGa > 2:302183/1‑149 (MQ=255)cgccgACGACCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGa > 7:230545/1‑149 (MQ=255) acgacCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTc < 3:345702/149‑1 (MQ=255) cacggtacgccctgacagctgttcgaccttgctgaaacttcgctcgcctttgcgcccgaccagcatcagcggcacctggtcgagtatcggtgcactGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCgcagca > 8:42774‑M1/97‑134 (MQ=255) cacggtacgccctgacagctgttcgaccttgctgaaacttcgctcgcctttgcgcccgaccagcatcagcggcacctggtcgagtatcggtgcactGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCgcagca < 7:42774‑M1/38‑1 (MQ=255) gacCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGa > 4:125895/1‑149 (MQ=255) aCAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAgg < 7:182738/149‑1 (MQ=255) aCAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCACTGCACCGATACTCGACCAgg > 5:216997/1‑149 (MQ=255) aGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTg > 3:331597/1‑149 (MQ=255) ccAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGc > 4:133012/1‑149 (MQ=255) ccAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGc < 3:332762/149‑1 (MQ=255) ccctgacagctgttcgaccttgctgaaacttcgctcgcctttgcgcccgaccagcatcagcggcacctggccgcgccgggcgaGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGt < 1:100640‑M1/60‑1 (MQ=255) ccctgacagctgttcgaccttgctgaaacttcgctcgcctttgcgcccgaccagcatcagcggcacctggccgcgccgggcgaGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGt > 2:100640‑M1/84‑143 (MQ=255) aGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGAc < 4:110192/137‑1 (MQ=255) aGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGAc > 3:110192/1‑137 (MQ=255) cTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGAt < 4:44204/149‑1 (MQ=255) aaGCTCATCCCGGGGGCGAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCGGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCt < 6:216997/149‑1 (MQ=255) aaGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGc < 3:16143/148‑1 (MQ=255) cTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGt > 3:69886/1‑149 (MQ=255) tCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTc > 3:248220/1‑149 (MQ=255) aTCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTc < 4:58068/147‑1 (MQ=255) aTCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCgg > 1:145809/1‑149 (MQ=255) cgcgGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTc > 4:233251/1‑119 (MQ=255) cgcgGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTc < 3:233251/119‑1 (MQ=255) cgcgGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGgcgc < 2:215454/149‑1 (MQ=255) ggCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAg > 6:68398/1‑149 (MQ=255) cAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgcg < 3:74157/149‑1 (MQ=255) cAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgc > 2:214353/1‑148 (MQ=255) aaGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgcga < 3:125895/149‑1 (MQ=255) agcaccAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTCCCCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCGTGCCCCCACTACGGGGAGCGGTGTCCGCAGCAGTCCACCGATACTCGACCAGGCGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgcgag < 8:234120/144‑1 (MQ=255) aGGAACAGTTGCTGGGCGCCCGGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgcgag < 3:16130/149‑1 (MQ=255) ggAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCTCAGCATTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCTCAAAGgcgagc < 2:220440/149‑1 (MQ=255) gAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGgcgagc > 4:343603/1‑148 (MQ=255) aCAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGaa < 7:30022/149‑1 (MQ=255) aCAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGaa < 4:331597/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCCCTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGtt < 8:142026/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTc < 8:194868/148‑1 (MQ=255) cttggCGACGTGGCCCGCGGCGTGGGTGACCTGGCTGCGCCGGGCTATCTGCTTGACCCGACTACTGTTAGCGGTTTCGGCATCAGTGGAGCTATACTCTAGCAGGTGGCGGTGATGCTGGTCGGTCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCa < 4:238390/145‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCa < 4:69886/148‑1 (MQ=255) cTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCa < 4:248220/148‑1 (MQ=255) tGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAg > 3:41042/1‑148 (MQ=255) gcCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGt < 3:133012/149‑1 (MQ=255) ccGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTc < 1:198917/133‑1 (MQ=255) ccGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTc > 2:198917/1‑133 (MQ=255) ccGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGc > 4:212473/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGc > 3:338834/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGc > 3:29092/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAgg < 2:216090/149‑1 (MQ=255) ggTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGc < 2:295787/148‑1 (MQ=255) ggTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCg > 7:51056/1‑149 (MQ=255) acctggtcgagtatcggtgcactgctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagc‑TCGC‑CCG‑‑GCGCGGCCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAggg < 1:100640‑M2/83‑1 (MQ=255) acctggtcgagtatcggtgcactgctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagc‑TCGC‑CCG‑‑GCGCGGCCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAggg > 2:100640‑M2/61‑143 (MQ=255) gcgcCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGCTACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAg < 2:213117/97‑1 (MQ=255) gcgcCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCt < 1:156455/149‑1 (MQ=255) gggCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAcca < 5:68398/149‑1 (MQ=255) tgctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagcAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTg > 8:42774‑M2/39‑134 (MQ=255) tgctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagcAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTg < 7:42774‑M2/96‑1 (MQ=255) gctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagcAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAccagtgc > 8:283070‑M2/38‑147 (MQ=255) ctgcggacaccgctcaccgtagtggggtcaagcagcAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAccagtgccag > 2:132583‑M2/37‑149 (MQ=255) CTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAccagtgcca > 6:357879‑M1/1‑145 (MQ=255) CTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAccagtgcca < 5:357879‑M1/145‑1 (MQ=255) cccACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCgg > 6:177708/1‑149 (MQ=255) cACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGc > 1:270864/1‑149 (MQ=255) cACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGc > 8:24977/1‑149 (MQ=255) aCTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGcc > 7:338898/1‑149 (MQ=255) cGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGc < 2:145809/147‑1 (MQ=255) gTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCTGAt > 8:3471/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTCGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCTGATCCAGCAGGt > 3:246422/1‑148 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGcc > 6:81036/1‑105 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGcc < 5:81036/105‑1 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAc < 2:222652/110‑1 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGAc > 1:222652/1‑110 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCt < 8:111705/134‑1 (MQ=255) cGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCt > 7:111705/1‑134 (MQ=255) | CGCCGACGACCAACAGATCCAGCTAAAGCTCATCCCGCGGGCCAAGGAACAGTTGCTGGGCGCCCTGGCCCGCGGCGAGGGTGACCTGGCCGCGCCGGGCGAGCTGCTTGACCCCACTACGGTGAGCGGTGTCCGCAGCAGTGCACCGATACTCGACCAGGTGCCGCTGATGCTGGTCGGGCGCAAAGGCGAGCGAAGTTTCAGCAAGGTCGAACAGCTGTCAGGGCGTACCGTGGCCCTGACCAGTGCCAGTGCCGCCGGGCCGCTGATCCAGCAGGT > NC_002947/2641992‑2642270 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |