New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3146296 = | 51 (0.900) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.1% | coding (719/987 nt) | PP_2761 | ribose ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 3146335 = | 44 (0.820) | coding (758/987 nt) | PP_2761 | ribose ABC transporter permease |
TTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTCTGCTGCTGATCGGCTGGAATTTC > NC_002947/3146188‑3146480 | cgttgagaaatagcacaccgagcagtgtaccgggtacgttgacccggttgtgcaggctcaacgtggcaccgatgaagaccgcaccgatggcattcatcaggaacgcatTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCaa > 7:273196‑M1/109‑148 (MQ=255) ggCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAAt < 5:341162/147‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGcc > 1:348606/1‑149 (MQ=255) aCTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCtgatg > 2:91356/1‑148 (MQ=255) gtggCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAAt < 6:304634/147‑1 (MQ=255) gtggCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATg < 1:91356/148‑1 (MQ=255) gcgcGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCAt < 5:52327/149‑1 (MQ=255) gcgcGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCAt < 8:10441/149‑1 (MQ=255) gcgTTATTCGGGACTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg > 3:286966/1‑149 (MQ=255) gcgTTATTCGCGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGGGTGCATCGCCAGGGCCTTTGCCACCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCg < 8:47592/149‑1 (MQ=255) ttATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTg > 3:90120/1‑149 (MQ=255) aTTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCg > 8:305208/1‑149 (MQ=255) gggCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTc < 7:111743/148‑1 (MQ=255) gggCCTAGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGCACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCt > 6:205219/1‑149 (MQ=255) gcgcAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCg < 8:20129/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCg < 3:222828/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCGACGTATCGCTG‑CCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGt < 7:290470/149‑1 (MQ=255) aGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGcc < 3:51454/149‑1 (MQ=255) gTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGtt > 2:275703/1‑148 (MQ=255) tCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGc > 1:77916/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGc < 3:57494/149‑1 (MQ=255) cccTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGc < 1:275703/147‑1 (MQ=255) cTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACaa > 6:161104/1‑149 (MQ=255) tGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCATGGTGACCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAAc > 6:273877/1‑149 (MQ=255) ggTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAAc > 4:196743/1‑148 (MQ=255) ggTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAAc < 3:196743/148‑1 (MQ=255) gtgtTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCAt < 4:219001/107‑1 (MQ=255) gtgtTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCAt > 3:219001/1‑107 (MQ=255) gCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCg < 2:348606/148‑1 (MQ=255) tttGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTa > 5:250227/1‑148 (MQ=255) cccgCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAAc < 1:81512/135‑1 (MQ=255) cccgCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAAc > 2:81512/4‑138 (MQ=255) ttGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTaca > 8:213534/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTacac < 5:161104/148‑1 (MQ=255) cgcgcTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTacaccgagca < 4:286966/149‑7 (MQ=255) tGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGtgtg > 7:218541/1‑149 (MQ=255) gCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTAttt < 4:90120/149‑1 (MQ=255) gCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTAttt > 6:281361/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCGGCCATGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCa < 5:273877/148‑1 (MQ=255) ttgccggacatcggcgcgtaggcgttcaccgtggccggcaATGCGTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACg > 7:273196‑M2/41‑148 (MQ=255) TGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGt < 4:289036‑M1/148‑1 (MQ=255) ggacatcggcgcgtaggcgttcaccgtggccggcaATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTAttt > 6:228885‑M2/36‑136 (MQ=255) ggacatcggcgcgtaggcgttcaccgtggccggcaATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTAttt < 5:228885‑M2/101‑1 (MQ=255) GCCACGGTGAACACCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGc < 2:65316‑M1/149‑1 (MQ=255) ccACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACg > 7:132791/1‑146 (MQ=255) ccACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACg < 8:132791/146‑1 (MQ=255) cGGTGAACGCCTACTCGGCGCTGGCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAAc < 6:250227/149‑1 (MQ=255) tGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGgtgt > 2:15099/1‑121 (MQ=255) tGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGgtgt < 1:15099/121‑1 (MQ=255) aaCGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGCAACGGCCAACGGTc < 7:305208/148‑1 (MQ=255) gCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTctgct > 5:3807/1‑149 (MQ=255) cTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTctgctgc < 3:1816/149‑1 (MQ=255) aTGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTCTGCTGCTGATCGGCTg < 1:65316/149‑1 (MQ=255) gcaATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTCTGCTGCTGATCGGCTGGAATttc > 2:110732‑M2/4‑149 (MQ=255) | TTGGCAGCCAGCCACTGGTGGCGCGTTATTCGGGCCTGGCGCAGCGACGTATCGCTGCCCTGGTGTTCATCGCCAGTGCCTTTGCCAGCGCGCTGGCGGGCATTCTGCTGCCGGCCACGGTGAACGCCTACGCGCCGATGTCCGGCAATGCCTTCCTGATGAATGCCATCGGTGCGGTCTTCATCGGTGCCACGTTGAGCCTGCACAACCGGGTCAACGTACCCGGTACACTGCTCGGTGTGCTATTTCTCAACGTAACGGCCAACGGTCTGCTGCTGATCGGCTGGAATTTC > NC_002947/3146188‑3146480 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |