New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3783024 = | 62 (1.100) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 6.8% | coding (115/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 3783131 = | 53 (1.020) | coding (222/771 nt) | nikD | nickel ABC transporter ATP‑binding protein |
TTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGGCGCGC > NC_002947/3782985‑3783272 | ttGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCgctggctg > 3:12236/1‑148 (MQ=255) gCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCa < 4:12236/149‑1 (MQ=255) aaGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 5:65101/149‑1 (MQ=255) aaGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 4:173560/149‑1 (MQ=255) tGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc > 1:183949/1‑149 (MQ=255) tGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc > 8:10026/1‑149 (MQ=255) cACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 7:10026/147‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGt > 8:104197/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtg > 7:19348/1‑149 (MQ=255) tCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtg > 7:13983/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgc > 8:156103/1‑149 (MQ=255) ggTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc < 2:145101/137‑1 (MQ=255) ggTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAc > 1:145101/1‑137 (MQ=255) tGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgctgc < 2:183949/149‑1 (MQ=255) CCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCa < 8:232479‑M1/148‑1 (MQ=255) cagcggctggccgtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaa > 8:233497‑M2/106‑148 (MQ=255) CAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCaa < 3:226801‑M1/148‑1 (MQ=255) ctggccgtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGa < 1:337877‑M2/26‑1 (MQ=255) ctggccgtcgagcagcagttgtccttgggtgcgggcgaggccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGa > 2:337877‑M2/100‑125 (MQ=255) CTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCcgc < 4:325358‑M1/149‑1 (MQ=255) tGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc > 6:204655/1‑118 (MQ=255) tGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGc < 5:204655/118‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTTCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAg < 4:226801/148‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgct > 7:81578/1‑133 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGtgct < 8:81578/133‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCa < 1:67143/147‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCa < 4:241175/147‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAgc < 8:13983/149‑1 (MQ=255) gCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAgc < 8:19348/149‑1 (MQ=255) aaaTCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAgcgc > 8:136422/1‑149 (MQ=255) tCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCtt < 4:105950/149‑1 (MQ=255) cccTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCtt > 4:283859/1‑148 (MQ=255) aGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAAcc < 7:232479/148‑1 (MQ=255) ccTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGt < 1:137291/147‑1 (MQ=255) ccTTGGCGTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTg < 4:252235/148‑1 (MQ=255) ttGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTgcg > 3:314439/1‑148 (MQ=255) ttGCTCGACCTGCTACCACCTGGACTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACAt > 8:106266/1‑149 (MQ=255) gCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATgg > 2:269423/1‑149 (MQ=255) gACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGgccag > 8:64809/1‑149 (MQ=255) gCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatg > 5:6115/1‑149 (MQ=255) ccaggtggtagcaggtcgagcaagccaaggcagctgagggatttgccagagccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGAGCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatgc < 7:233497‑M2/90‑1 (MQ=255) cTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatgc < 7:64809/149‑1 (MQ=255) accaccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCCGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGCCCAGCCTGGTGCGGCACAACCCGCGCAGCGCCTTGCACCCCGTGCGCAACAGGGCCAgccgtggca > 4:300798/1‑149 (MQ=255) ccaccTGGACTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAgccatgccat < 7:106266/149‑1 (MQ=255) caccTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCCACCCGGTCCGCAACATGGCCAGCCATGACATc > 8:324715/1‑149 (MQ=255) accTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATc > 8:80552/1‑148 (MQ=255) tCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCt > 1:294245/1‑148 (MQ=255) gCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAg < 7:66180/149‑1 (MQ=255) aCCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCACAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAAc > 1:104889/1‑148 (MQ=255) cccAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGa < 2:341725/149‑1 (MQ=255) cccAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGa < 2:294245/149‑1 (MQ=255) ccAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCACCCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAg > 2:162970/1‑149 (MQ=255) ccAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAg < 3:283859/149‑1 (MQ=255) aaGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGc < 6:6115/149‑1 (MQ=255) tgctgcTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAgg < 3:214340/139‑1 (MQ=255) tgctgcTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAgg > 4:214340/1‑139 (MQ=255) tgctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGcgcg > 3:56234/1‑149 (MQ=255) gctCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCgg > 2:174880/1‑149 (MQ=255) tCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGTCATCACCAGCGCgg > 2:281218/1‑147 (MQ=255) tCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCgg > 5:352160/1‑147 (MQ=255) gACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAg > 4:695/1‑148 (MQ=255) gCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACgg > 3:34301/1‑149 (MQ=255) gccgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGgcgc < 7:324715‑M2/140‑1 (MQ=255) cgctggcTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCTATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGgcgcgc < 1:269423‑M2/142‑1 (MQ=255) | TTGCAGCTGCGCCGCGGCGAAGTCTGCACGTTGGTCGGTGCCAGCGGCTCTGGCAAATCCCTCAGCTGCCTTGGCTTGCTCGACCTGCTACCACCTGGCCTCGCCCGCACCCAAGGACAACTGCTGCTCGACGGCCAGCCGCTGGCTGCAAGCAGTGTCAGAGGTCGCCTGACCAGCCTGGTGCTGCAAAACCCGCGCAGCGCCTTCAACCCGGTGCGCAACATGGCCAGCCATGCCATCGAAACGCTCAGGCAACGAGGCATCACCAGCGCGGTAGCACGGGCGCGC > NC_002947/3782985‑3783272 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |