New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4670530 = | 49 (0.870) | 4 (0.070) | 4/244 | NT | 8.1% | coding (862/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
? | NC_002947 | 4670606 = | 44 (0.820) | coding (938/1470 nt) | nuoN | NADH‑quinone oxidoreductase subunit N |
TCTCCCCTGCTGCCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGATGCCCTGTAC > NC_002947/4670459‑4670754 | tctcCCCTGCTGCCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTg > 5:81884/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTgg > 1:237711/1‑144 (MQ=255) ctgctgCCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTgg < 2:237711/144‑1 (MQ=255) gcCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGtt > 2:311632/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGtt < 3:161288/148‑1 (MQ=255) ccAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGtt < 1:68104/148‑1 (MQ=255) cagcagCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGGCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTgg > 4:128278/1‑149 (MQ=255) cggcgTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGtt < 7:100545/141‑1 (MQ=255) cggcgTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGtt > 8:100545/1‑141 (MQ=255) gcgTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCa > 6:184235/1‑147 (MQ=255) gcgTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCa < 5:184235/147‑1 (MQ=255) gcgTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAg > 4:313339/1‑148 (MQ=255) tCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGc > 7:72385/1‑149 (MQ=255) cAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAACCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTGGGTCGCCAGCAAGGGcc < 4:282561/149‑1 (MQ=255) aGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCt < 8:28234/149‑1 (MQ=255) cGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGccc > 8:289150/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTg > 2:251880/1‑148 (MQ=255) ggCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGaa < 4:347740/148‑1 (MQ=255) gCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAg < 1:182063/148‑1 (MQ=255) gTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCAt < 7:59765/149‑1 (MQ=255) ttGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGc < 3:128278/149‑1 (MQ=255) ccGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGtt > 8:107550/1‑149 (MQ=255) tAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTAc < 6:81884/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCCTCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTg < 8:72385/149‑1 (MQ=255) cTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTgg > 7:297627/1‑149 (MQ=255) tGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTAc > 5:81103/1‑149 (MQ=255) aTTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCATGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGt < 1:251880/149‑1 (MQ=255) aTTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGt > 3:15583/1‑149 (MQ=255) ttGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTg < 8:272660/149‑1 (MQ=255) ttGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTg < 7:107550/149‑1 (MQ=255) ggtaaccgaagtgggcgatggacgagtaacccagcagacgcttgaggttgctctgggtcagcgccagcaggttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGAt > 4:227431‑M2/77‑149 (MQ=255) GTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATc > 5:322929‑M1/1‑149 (MQ=255) ACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCAcc > 7:289150‑M1/1‑149 (MQ=255) ccgaagtgggcgatggacgagtaacccagcagacgcttgaggttgctctgggtcagcgccagcaggttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGt > 2:354581‑M2/72‑132 (MQ=255) ccgaagtgggcgatggacgagtaacccagcagacgcttgaggttgctctgggtcagcgccagcaggttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGt < 1:354581‑M2/61‑1 (MQ=255) tgGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTgg < 8:44222/69‑1 (MQ=255) cgcTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTTCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTggg < 5:368162/148‑1 (MQ=255) tGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGcc > 3:204221/1‑149 (MQ=255) ccAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGgc > 4:266301/1‑142 (MQ=255) ccAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGgc < 3:266301/142‑1 (MQ=255) agagCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGc > 5:81319/1‑149 (MQ=255) aaGCGTCTTTCGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCAcc < 1:303389/147‑1 (MQ=255) aaGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCt < 4:93016/149‑1 (MQ=255) ctgGGTTACCCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTc > 2:170769/1‑149 (MQ=255) gTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCa < 6:81103/149‑1 (MQ=255) cTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATAcg > 4:154109/1‑149 (MQ=255) tCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGtc > 1:73844/1‑123 (MQ=255) tCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGtc < 2:73844/123‑1 (MQ=255) tCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATAcgg > 5:303606/1‑149 (MQ=255) gTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGgc > 8:118170/1‑109 (MQ=255) gTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGgc < 7:118170/109‑1 (MQ=255) gtcagcgccagcaggttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGcc < 3:227431‑M2/129‑1 (MQ=255) cATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGcc > 8:33870/1‑149 (MQ=255) ccACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACg > 1:142937/1‑149 (MQ=255) cGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTc < 1:74691/115‑1 (MQ=255) cGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTc > 2:74691/1‑115 (MQ=255) cGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGAt < 4:204221/148‑1 (MQ=255) gttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGATGcc < 3:285953‑M2/143‑1 (MQ=255) ttaccTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGATGccc < 8:297627‑M2/144‑1 (MQ=255) cTGGTCATCGCGTTGGTCGCCATAAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACATGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTACGGCGACAACACCCAAATGTCAACGACATACGGCAGCCGTGACGCcgaagccaagaa > 7:227759‑M2/2‑144 (MQ=255) tGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGATGCCCTGTAc > 3:257769/1‑149 (MQ=255) | TCTCCCCTGCTGCCAGCAGCGGCGTGCTCAGCACCGTATTGGCGGTGATTGCCGTAGCCTCGATCCTGATTGGTAACCTGCTGGCGCTGACCCAGAGCAACCTCAAGCGTCTGCTGGGTTACTCGTCCATCGCCCACTTCGGTTACCTGGTCATCGCGTTGGTCGCCAGCAAGGGCCTGGCCCTGGAAGCCATGGGCGTTTACCTGGTCACCTACGTGATCACCAGCCTGGGCGCCTTCGGCGTCATCACCCTCATGTCCTCGCCATACGGCGGCCGTGACGCCGATGCCCTGTAC > NC_002947/4670459‑4670754 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |