New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5205778 = | 51 (0.900) | 4 (0.070) | 4/246 | NT | 7.6% | coding (655/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 5205848 = | 49 (0.910) | coding (585/1209 nt) | PP_4586 | hypothetical protein |
TAGCCCCTCGCCACATGCCGTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTC > NC_002947/5205700‑5205995 | ttcgatcgcccgaccggctggatgcttgccggcgacctgtgcagccgccgcgctcgcctgggcgagaccgaagtgaccGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACg > 8:32670‑M1/79‑149 (MQ=255) gatcgcccgaccggctggatgcttgccggcgacctgggcagccgccgcgctcgcctgggcgagaccgaagtgaccGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGt > 6:312506‑M1/76‑148 (MQ=255) ccTCGCCACATGCCGTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCAc > 3:74653/1‑149 (MQ=255) cTCGCCACATGCCGTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACt < 8:275565/149‑1 (MQ=255) cTCGCCACATGCCGTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACt > 6:36371/1‑149 (MQ=255) gTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGcc > 5:361821/1‑147 (MQ=255) gTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGcc > 4:176726/1‑147 (MQ=255) tCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAg > 5:140173/1‑149 (MQ=255) aCGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACTCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGc < 8:109440/149‑1 (MQ=255) aCGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGc < 5:36371/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGa < 6:361821/149‑1 (MQ=255) gcgcCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGa < 4:74653/149‑1 (MQ=255) gcCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAgc > 4:318958/1‑149 (MQ=255) aCCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCgcggcg > 7:212576/1‑149 (MQ=255) agcagcTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑cc < 2:274957/149‑1 (MQ=255) agcTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAg < 5:90950/149‑1 (MQ=255) cTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGATGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGt < 3:17429/149‑1 (MQ=255) tGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGcggcgg > 3:156746/1‑137 (MQ=255) tGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGcggcgg < 4:156746/137‑1 (MQ=255) ggCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGcc < 6:140173/149‑1 (MQ=255) ggTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGc > 5:12214/1‑148 (MQ=255) gTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGc > 2:55417/1‑147 (MQ=255) ttACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCggcggc < 6:131192/130‑1 (MQ=255) ttACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCggcggc > 5:131192/1‑130 (MQ=255) cgcgGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCAGGCACGCAt > 3:276596/1‑149 (MQ=255) gggAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCa < 6:12214/149‑1 (MQ=255) acaGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGTCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGt > 3:145881/1‑149 (MQ=255) cTTGTCGTTGTGGCCAGCCTAATGTGAGCAAGGGCAGGCGGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCggg < 4:276596/149‑1 (MQ=255) tGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTg > 7:145870/1‑114 (MQ=255) tGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTg < 8:145870/114‑1 (MQ=255) gTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATc > 1:354801/1‑148 (MQ=255) accgtggccgcgccggtggggcagggcatgcggcgcatggacagcctgaccttgctcacattcgtctggccacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATc > 6:312506‑M2/74‑148 (MQ=255) ttGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCg > 7:147136/1‑148 (MQ=255) ttGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCg > 4:315868/1‑148 (MQ=255) cgtggccgcgccggtggggcagggcatgcggcgcatggacagcctgaccttgctcacattcgtctggccacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CACAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGaa > 8:32670‑M2/72‑149 (MQ=255) GTGTCCAGACGAATGTCAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGCCGCGGCCACGGTCACATCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑ccc > 6:292333‑M1/1‑110 (MQ=255) GTGGCCAGACGATTGTGAGCAAGGTCTGGCTGTCCATGCGCCGCATTCCCTGCCCCACCGCCGCGGGCTCTGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑ccc < 5:292333‑M1/110‑1 (MQ=255) GTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGaa < 2:265205‑M1/148‑1 (MQ=255) aGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGgcgc > 5:30672/1‑149 (MQ=255) gACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTGCCCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGgcgc < 1:265205/149‑1 (MQ=255) tgAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGtt < 1:55417/148‑1 (MQ=255) aGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCCCCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTc < 6:41946/149‑1 (MQ=255) aaGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGTCGCGACACGTTGTCGAt < 6:150401/149‑1 (MQ=255) aaGGGCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGAt < 6:155911/149‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAg < 5:8274/129‑1 (MQ=255) ggTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAg > 6:8274/1‑129 (MQ=255) ggTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGc > 6:148041/1‑149 (MQ=255) cggcgcatggacagcctgaccttgctcacattcgtctggccacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGaaa < 7:32670‑M2/105‑1 (MQ=255) gCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACt > 2:68476/1‑149 (MQ=255) tCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTccc < 5:148041/149‑1 (MQ=255) cATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCt > 5:207548/1‑149 (MQ=255) ccctgcccCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCgg > 5:150963/1‑149 (MQ=255) ctgcccCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGc > 4:239363/1‑148 (MQ=255) ctcacattcgtctggccacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCa < 5:312506‑M2/129‑1 (MQ=255) ccccACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCagg < 1:68476/149‑1 (MQ=255) ccACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCaggag > 8:213355/1‑149 (MQ=255) cACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCaggagg > 1:183706/1‑149 (MQ=255) cGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGttt < 6:352452/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTc > 1:82823/1‑149 (MQ=255) cgcgGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGa < 6:30672/149‑1 (MQ=255) gcgGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGAt < 3:315868/149‑1 (MQ=255) ggccacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGc < 6:207548‑M2/143‑1 (MQ=255) cacGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCTGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGctct > 3:315950‑M2/4‑149 (MQ=255) cGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTc < 3:239363‑M2/148‑1 (MQ=255) cGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTc < 4:145881‑M2/148‑1 (MQ=255) | TAGCCCCTCGCCACATGCCGTCACGCGCCCCGACCAAGAGCAGCTTGGGCGGGTTACGCGGGAACACAGCTTGTAGTTGTGGCCAGACGAATGTGAGCAAGGTCAGGCTGTCCATGCGCCGCATGCCCTGCCCCACCGGCGCGGCCACGGTCACTTCGGTCTCGCCCAGGCGAGCGCGGCGGCTG‑CCCAGGTCGCCGGCAAGCATCCAGCCGGTCGGGCGATCGAACAGGCGCGACACGTTGTCGATGCGAAACTTCCCCTTGCCGATGCGCGGCCAGGAGGTTTCGATGCTCTTC > NC_002947/5205700‑5205995 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |