New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5985206 = | 5181 (78.370) | 110 (1.740) | 37/268 | 0.9 | 2.2% | coding (390/405 nt) | PP_5244 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 5985245 = | 4861 (76.840) | coding (351/405 nt) | PP_5244 | AraC family transcriptional regulator | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 5717 total aligned reads displayed.
GGTGGTCGACCAGCAGCACCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGCCA > NC_002947/5985056‑5985354 | tggtCGACCAGCAGCACCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTgc > 2:246721/1‑149 (MQ=255) agtcaacaccggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagcc < 2:363544‑M1/1‑1 (MQ=255) tcaacaccggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagccgc < 1:221497‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaacaccggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagccgc < 7:351758‑M1/3‑1 (MQ=255) tcaacaccggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagccgc > 4:197320‑M1/147‑149 (MQ=255) gACCAGCAGCACCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGGTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCt < 5:237226/148‑1 (MQ=255) acaccggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagcCGCCTg > 1:193866‑M1/144‑149 (MQ=255) ccAGCAGCACCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTgcc < 1:100165/149‑1 (MQ=255) cggcctttcgccgcaggcctggcgcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagcCGCCTgccgc < 8:150547‑M1/10‑1 (MQ=255) cagcaCCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCa < 5:187106/149‑1 (MQ=255) cacGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTCAATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTgccgc > 1:80496/1‑142 (MQ=255) cacGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCtt > 6:17634/1‑149 (MQ=255) acGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTg < 7:290733/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTggg > 2:83892/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTggg > 5:287961/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTggg < 8:356588/149‑1 (MQ=255) gCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTTGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGt < 4:284875/149‑1 (MQ=255) cgtcgtCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGtg < 5:342451/149‑1 (MQ=255) gtcgtcTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGtgg > 7:128184/1‑149 (MQ=255) tGTTCAGGCGCTTGTATTCTGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCGGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGtggctggc < 4:142880/146‑1 (MQ=255) tGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCg < 6:288306/148‑1 (MQ=255) gcctgctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagccgc < 3:221656‑M1/3‑1 (MQ=255) aGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAgg > 6:151909/1‑149 (MQ=255) gcgcTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAggcg > 8:126125/1‑149 (MQ=255) ctggcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagcCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAgg > 2:60452‑M1/112‑148 (MQ=255) gcgcgcatggaaaaggccaagcgcttgcttgcaaccgaggcgcctatcacccacgtgagcctggaatgcggcttttgtgaccaggcccatttcacccgtgctttcagcCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAggcgg > 6:23437‑M1/109‑148 (MQ=255) tAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTgg < 2:166506/123‑1 (MQ=255) tAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGa > 7:19999/1‑147 (MQ=255) aaTCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAg > 6:32229/1‑149 (MQ=255) aTCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAg > 7:228978/1‑148 (MQ=255) agatctcTC‑ATGGTGTTACTTCTTTTGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAATTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGTCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACgg < 4:348713/143‑1 (MQ=255) gTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGCCCAGGCGGCTGAAAGGACggg > 4:228976/1‑149 (MQ=255) ggCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTg < 5:156189/148‑1 (MQ=255) tC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAAt > 5:105409/1‑149 (MQ=255) aTGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATgg > 3:192100/1‑149 (MQ=255) aTGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATgg < 4:320748/149‑1 (MQ=255) aTGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATgg < 4:170535/149‑1 (MQ=255) ggggTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGtggctggc > 3:281211/1‑115 (MQ=255) gggTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGc < 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aCTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGt > 8:324337/1‑148 (MQ=255) ccTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATg > 8:292591/1‑137 (MQ=255) cTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTcac < 6:376666/147‑1 (MQ=255) gttgggATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGcc < 7:153112/135‑1 (MQ=255) gATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGc < 3:110103/129‑1 (MQ=255) gATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCAtt > 5:99660/1‑149 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ccGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGGGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGtt < 1:315290/148‑1 (MQ=255) ccgTGGAAAGGATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCCCCTGCCCACAGGCCTTCGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGAGAAATGGGGCGGGTAACAAAAGCCGCATTCCCGGCTCACGTGGGTGATAGGCTCCTCGGTTg > 2:267473/3‑148 (MQ=255) cGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgc < 7:176205/149‑1 (MQ=255) cGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTg > 1:28339/1‑148 (MQ=255) gTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgc > 4:118290/1‑147 (MQ=255) ggATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCTGGCCTTGGGTGGCTAGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgcaagc < 2:194415/149‑1 (MQ=255) ggATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGGGTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgcaagc < 3:66821/149‑1 (MQ=255) gATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGgcg > 5:262210/1‑134 (MQ=255) gATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgcaagc < 7:256716/148‑1 (MQ=255) aTAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgcaagcaa < 6:204266/149‑1 (MQ=255) cATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCTCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAgcgc < 8:197583/149‑1 (MQ=255) cATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTgcaagcaa < 4:253963/145‑1 (MQ=255) aTTGGTTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCt > 2:221497/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCt > 3:165875/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACAAGGCGGATGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCt > 3:37118/1‑149 (MQ=255) gCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGaaa < 5:133625/63‑1 (MQ=255) cTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGcc > 3:340044/1‑149 (MQ=255) ttAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCt > 2:10162/1‑149 (MQ=255) ttAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCt > 5:317251/1‑149 (MQ=255) ttAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCt > 4:76013/1‑149 (MQ=255) ttAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCCGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCt > 3:309608/1‑149 (MQ=255) aGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCtttt < 2:300639/149‑1 (MQ=255) aGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCtttt < 6:99660/149‑1 (MQ=255) gAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTg < 1:57980/141‑1 (MQ=255) gtgtCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCg < 8:174708/86‑1 (MQ=255) gtgtCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATg > 2:132657/1‑149 (MQ=255) tgtCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATgc > 5:37590/1‑149 (MQ=255) tCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGt > 1:251656/1‑103 (MQ=255) tGCGCCTGGCGCCAGGCCTTTGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGGAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGC < 4:52599‑M1/149‑1 (MQ=255) tGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGC > 3:137784‑M1/1‑149 (MQ=255) tGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGC > 8:230615‑M1/1‑149 (MQ=255) CGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGCca > 8:50765‑M1/1‑149 (MQ=255) | GGTGGTCGACCAGCAGCACCACGGCGTCGTCTTTGTTCAGGCGCTTGTAATCGGGTTGGCTC‑ATGGGGTGACTCCTTGGGTTGGGATAACGGGCCGGCACTGTCCGCAGGGGTTATACCGGTGGATAGCATTGGCTTAAGAAAGTGTCTGCGCCTGCCGCCAGGCCTTGGGTGGCTGGCCGACCAGGCGGCTGAAAGCACGGGTGAAATGGGCCTGGTCACAAAAGCCGCATTCCAGGCTCACGTGGGTGATAGGCGCCTCGGTTGCAAGCAAGCGCTTGGCCTTTTCCATGCGCGCCA > NC_002947/5985056‑5985354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |