New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5989993 | 5541 (83.810) | 144 (2.290) | 49/266 | 0.3 | 2.6% | intergenic (+305/+44) | PP_5247/ycaC‑III | hypothetical protein/putative hydrolase |
? | NC_002947 | = 5990003 | 5520 (87.920) | intergenic (+315/+34) | PP_5247/ycaC‑III | hypothetical protein/putative hydrolase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 6491 total aligned reads displayed.
CACCCTACACTGATGATTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTGCGCCAGTC > NC_002947/5989845‑5990141 | ccTACACTGATGATTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTccc > 5:31718/1‑148 (MQ=255) cTGATGATTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACa > 2:56838/1‑146 (MQ=255) tgatgaTTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACaga > 3:262774/1‑147 (MQ=255) gatTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAgagc < 3:207900‑M2/149‑5 (MQ=255) gatTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAgagc < 2:269567‑M2/149‑5 (MQ=255) tCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAgagccgg < 2:81411‑M2/149‑8 (MQ=255) cggaacgatgtcgaagggctggctgcactttggtacaagcacattccggagtttcgcaacctgatgaccagctataacgcgctgactgcgtgtaagtaatgtaccacatgcgacgtgcacaaaggCCGGCTGCCTTCAGAGAGAGCCgg > 2:117333‑M1/126‑149 (MQ=255) cgcaacgatgtcgaagggctggctgcactttgctcctaccacattccggattatcgcaacctgatgaccagctataacgcgctgactgcgtgtaagtaatcaaccaccagcaacgtgcacaaaggCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCgg > 5:376253‑M1/126‑149 (MQ=255) gcaacgatgtcgaagggctggctgcactttgttccaaccacattccggattatcgcaacctgatgaccagctataacgcgctgactgcgggtaagtaatcaaccaccagcaacgtgcacaaaggCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGc > 4:42462‑M1/125‑149 (MQ=255) gcaacgatgtcgaagggctggctgcactttgctccaaccacattccggattatcgcaacctgatgaccagctataacgcgctgactgcgggtaagtaatcaaccaccagcaacgtgcacaaaggCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGc > 5:143999‑M1/125‑149 (MQ=255) aGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGc < 1:206861/148‑1 (MQ=255) ccATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTCGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCCCCACacactgtagggagccggtttt > 6:362247‑M1/1‑128 (MQ=255) cATCGTTGGGGTTACTGATCCATTTACTGCCGCTGAATTACTACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTTACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGTCTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGATCCGGCCtt < 8:116232/148‑1 (MQ=255) cATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTTAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCttt < 4:275659/149‑1 (MQ=255) gATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGc < 4:170300/149‑1 (MQ=255) tGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCAc < 4:24949/149‑1 (MQ=255) ggTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCTCTCTGTAGGgagccggtttttt > 6:126891‑M2/1‑128 (MQ=255) ttCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGc < 3:156562/149‑1 (MQ=255) cTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCtgg < 3:52843/149‑1 (MQ=255) cTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCtgg < 5:78763/149‑1 (MQ=255) tGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCtggt > 8:285173/1‑149 (MQ=255) aTCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCtggtg < 7:291258/148‑1 (MQ=255) tCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGc > 1:242198/1‑135 (MQ=255) tCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTggtggt < 8:257811/149‑1 (MQ=255) ccAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGtt > 7:175649/1‑149 (MQ=255) gTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGtt > 4:193897/1‑136 (MQ=255) gTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGCCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACCTTGCTGGTGGTTGAt > 5:11794/1‑149 (MQ=255) aCTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGAtta < 7:142231/148‑1 (MQ=255) aCTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGAtta < 7:56015/148‑1 (MQ=255) gCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGAttactta > 2:296167/1‑149 (MQ=255) cGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTAcc > 6:101023/1‑149 (MQ=255) aaTGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCa < 6:152185/148‑1 (MQ=255) tGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGt > 1:335816/1‑148 (MQ=255) aCAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCa < 2:143440/148‑1 (MQ=255) aCTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAgcgc < 6:30293/149‑1 (MQ=255) cTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAgcgc < 1:100204/148‑1 (MQ=255) cTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGcgcg > 5:17943/1‑149 (MQ=255) cTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTta > 7:239231/1‑148 (MQ=255) cTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTta > 6:330602/1‑148 (MQ=255) ttCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTta > 1:274827/1‑147 (MQ=255) cgcgCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGc > 3:7794/1‑149 (MQ=255) gcgcTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCt > 4:308283/1‑149 (MQ=255) gcTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGGTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTgg < 1:125334/149‑1 (MQ=255) gcTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTgg > 6:252131/1‑149 (MQ=255) cTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGt < 6:219825/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACTGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGAAGTCAGCTCGTTATAGCTGGtca > 8:172245/1‑149 (MQ=255) gggTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCGCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGtcat > 3:182613/1‑149 (MQ=255) gggTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGtc < 4:367050/147‑1 (MQ=255) gctGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCATCAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGtcat > 4:335570/3‑148 (MQ=255) tGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTAccc < 2:199900/120‑1 (MQ=255) gAAACGCTAACAATGTCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGtcatca > 2:380606/1‑147 (MQ=255) gAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAgg > 8:147291/1‑149 (MQ=255) aaaCGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGt > 6:88815/1‑149 (MQ=255) aaaCGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGt > 3:292969/1‑149 (MQ=255) aaaCGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGt > 2:323159/1‑149 (MQ=255) cGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGc < 1:362097/149‑1 (MQ=255) gCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTg < 4:120614/135‑1 (MQ=255) gCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGc > 6:59644/1‑148 (MQ=255) cTAACAATGCCGCCAATACAGGCCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGa < 1:150113/149‑1 (MQ=255) aaCAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTgg > 3:32446/1‑133 (MQ=255) aCAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGa < 5:29114/100‑1 (MQ=255) aCAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAgcgc < 4:90195/121‑1 (MQ=255) aaTGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTg > 3:355524/1‑97 (MQ=255) tGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCg < 5:267925/149‑1 (MQ=255) gccAATACAGGTCTACGACTGGAACAAAGCGCATCAAAAACTCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGGCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAAt < 8:70677/149‑1 (MQ=255) gccAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAAt > 2:35137/1‑149 (MQ=255) gccAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAAt > 1:301924/1‑149 (MQ=255) cAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAAtgt > 4:146512/1‑149 (MQ=255) gcAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGtt < 2:234847/148‑1 (MQ=255) aCAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGtc > 7:263208/1‑120 (MQ=255) cAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGtt < 8:40552/148‑1 (MQ=255) aGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTg > 7:33586/1‑148 (MQ=255) ggTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGa < 8:236086/149‑1 (MQ=255) ggTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGa < 7:85089/149‑1 (MQ=255) gTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAg > 2:173651/1‑149 (MQ=255) aCGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGCGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCaaa < 6:279748/149‑1 (MQ=255) gACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGt < 1:389299/149‑1 (MQ=255) tGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTg < 8:344426/147‑1 (MQ=255) gAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGcagc > 4:6946/1‑149 (MQ=255) gAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGcagc < 4:224675/149‑1 (MQ=255) aCAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGcagcca < 7:213140/149‑1 (MQ=255) aGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGccc > 5:351470/1‑149 (MQ=255) gcgcAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGc > 6:18337/1‑139 (MQ=255) aacaaAAATAACGGCTCCCTACAGAGCGAGCCGGGCTTTGTTCACGTGGCTGGTGGTTGATTACTTACCCTCAGTCAGCGCGTTATAGGTGGTCATCAGGTTGCTATAATCCGGAATGTGGTTGGa < 5:242991/126‑1 (MQ=255) aacaaAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAAtg > 5:49254/1‑118 (MQ=255) caaAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCg < 3:235475/69‑1 (MQ=255) caaAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCAAGCACTTCTACa > 4:10060/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACAt > 7:362971/1‑149 (MQ=255) aaaaaaaCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACAt < 5:213668/149‑1 (MQ=255) aaaaaaCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCagccagcc < 1:66531/139‑1 (MQ=255) aaaCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCt < 6:386977/83‑1 (MQ=255) aaaCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGtt < 1:175052/149‑1 (MQ=255) aCCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGATTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTgc < 8:207914/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCtctctgtagggagccggtttttttgttgcgctttgttccagtcgttgacctgtattggcggcattgttagcgtttcacccgagcgcgaagccagttgtcattcagcggcagtaactggatcaggaaccccatcgatggctga < 7:313745‑M1/149‑143 (MQ=255) cGGCTCtctctgtagggagccggtttttttgttgcgctttgttccagtcgttgacctgtattggcggcattgttagcgtttcacccgagcgcgaagccagttgtcattcagcggcagtaactggatcaggaaccccatcgatggctgaa < 3:105684‑M1/149‑144 (MQ=255) CGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTgcgc < 3:381132‑M1/149‑1 (MQ=255) gCTCtctctgtagggagccggtttttttgttgcgctttgttccagtcgttgacctgtattggcggcattgttagcgtttcacccgagcgcgaagacagttgtcattcagcggcagtaactggatcaggaacccaatcgatggctgaat > 1:94531‑M1/1‑4 (MQ=255) gCTCtctctgtagggagccggtttttttgttgcgctttgttccagtcgttgacctgtattggcggca > 3:130914‑M1/1‑4 (MQ=255) TCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTGCGCCAGt < 8:316108‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTGCGCCAGTc < 7:11566‑M1/149‑1 (MQ=255) | CACCCTACACTGATGATTCAGCCATCGATGGGGTTCCTGATCCAGTTACTGCCGCTGAATGACAACTGGCTTCGCGCTCGGGTGAAACGCTAACAATGCCGCCAATACAGGTCAACGACTGGAACAAAGCGCAACAAAAAAACCGGCTCCCTACAGAGAGAGCCGGCCTTTGTGCACGTTGCTGGTGGTTGATTACTTACCCGCAGTCAGCGCGTTATAGCTGGTCATCAGGTTGCGATAATCCGGAATGTGGTTGGAGCAAAGTGCAGCCAGCCCTTCGACATCGTTGCGCCAGTC > NC_002947/5989845‑5990141 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |