New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 515444 = | 49 (0.880) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.9% | coding (298/648 nt) | coq | 2‑nonaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol hydroxylase |
? | NC_002947 | 515527 = | 50 (0.960) | coding (215/648 nt) | coq | 2‑nonaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol hydroxylase |
ACCTGATGTTCGGTAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCGGCAATATGACG > NC_002947/515296‑515591 | acCTGATGTTCGGTAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCAcca < 4:186069/149‑1 (MQ=255) acCTGATGTTCGGTAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCAcca < 7:109850/149‑1 (MQ=255) cttgctgcccttcagcggccaacccacccggccatcgccggccatcgtccagccagacgctgacctggacgagcagcaggcccgtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAg < 3:102679‑M1/2‑1 (MQ=255) tgcccttcagcggccaacccacccggccatcgccggccatcgtccagccagacgctgacctggacgagcagcaggcccgtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAGGCCAg < 3:106970‑M1/7‑1 (MQ=255) gcccttcagcggccaacccacccggccatcgccggccatcgtccagccagacgctgacctggacgagcagcaggcccgtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAGGCCAgg < 6:2080‑M1/8‑1 (MQ=255) ttCGGTAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCAccaggccagg < 7:123096/148‑1 (MQ=255) tAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATcc < 3:77186/149‑1 (MQ=255) gcggcgACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCa < 6:31872/148‑1 (MQ=255) gcgACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCActtc > 5:213907/1‑149 (MQ=255) gaAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGAt < 6:265756/137‑1 (MQ=255) gaAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGAt > 5:265756/1‑137 (MQ=255) gaAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCt > 3:160705/1‑149 (MQ=255) gCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTcgg > 6:101895/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCActtc > 7:136341/1‑139 (MQ=255) ccAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCActtc < 8:136341/139‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTcggcgg > 4:121172/1‑149 (MQ=255) aCCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTc > 6:364500/1‑149 (MQ=255) ccTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTcc < 6:213907/149‑1 (MQ=255) cTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCa > 4:175296/1‑149 (MQ=255) ttGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCActtct > 5:30304/1‑129 (MQ=255) ttGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCActtct < 6:30304/129‑1 (MQ=255) gTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCAt < 8:196655/147‑1 (MQ=255) catcgtccagccagacgctgacctggacgagcagcaggcccgtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCatggtc < 1:15064‑M1/44‑3 (MQ=255) aCCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTgc < 3:117340/148‑1 (MQ=255) gCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCggg < 5:101895/149‑1 (MQ=255) tGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCt > 7:123048/1‑149 (MQ=255) gcCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTgg < 4:160705/149‑1 (MQ=255) cGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTcggcg < 7:160208/104‑1 (MQ=255) cGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTcggcg > 8:160208/1‑104 (MQ=255) cGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAgg < 3:175296/149‑1 (MQ=255) aCATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGggcctgg > 5:121532/1‑149 (MQ=255) gCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGggc > 7:323448/1‑141 (MQ=255) gCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGggc < 8:323448/141‑1 (MQ=255) cgtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGTCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCtt > 2:15064‑M1/66‑149 (MQ=255) gtcatattgccgggctgatgcgcatcaaccataccggtgaagtctgcgcccaggcgttgtaccaAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTg > 6:57481‑M1/65‑149 (MQ=255) gTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTgg > 6:118794/1‑148 (MQ=255) gTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTggg > 8:138147/1‑149 (MQ=255) cACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGa > 5:72669/1‑149 (MQ=255) aCGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGAc < 3:121172/149‑1 (MQ=255) aCGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGAc < 6:72669/149‑1 (MQ=255) gggTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCAcc > 5:82879/1‑149 (MQ=255) gggTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCAcc < 7:58954/149‑1 (MQ=255) ggTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTa < 7:97924/124‑1 (MQ=255) ggTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTa > 8:97924/1‑124 (MQ=255) gTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGggcctggc < 7:98949/116‑1 (MQ=255) gTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGggcctggc > 8:98949/1‑116 (MQ=255) gTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCgg > 3:76997/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCgg > 2:188376/1‑89 (MQ=255) gCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCgg < 1:188376/89‑1 (MQ=255) ttCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGtt > 5:2080/1‑149 (MQ=255) ttCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGt < 2:113067/148‑1 (MQ=255) cAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTg < 5:364500/148‑1 (MQ=255) gCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCa > 3:203958/1‑149 (MQ=255) aaTGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCGACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAAAGCCTGGCCGCAGACTTGAGCGGTATGGGTGATgcgcct > 4:303899/1‑145 (MQ=255) gcTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCg > 4:57401/1‑149 (MQ=255) tGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTa > 2:192442/1‑126 (MQ=255) tGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTa < 1:192442/126‑1 (MQ=255) gCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCGGCAatat > 2:355129/1‑149 (MQ=255) aCCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACt < 8:139122/56‑1 (MQ=255) aCCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCGGCAATATGa > 6:112615/1‑149 (MQ=255) caggccaggTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCGGCAATATGACg < 8:123048/149‑1 (MQ=255) | ACCTGATGTTCGGTAGCGGCGACGAAGCCCAGGCTGACCTTGTCGCTGACCAGCCCGGCCAGTGCGCCAATGCCGAACGACATGCCGTAGAACAGAGGGTTGAGCACGCTCGGGTGGCTGTTCAGCTGGCGAATGCGCTGTTCGCACCAGGCCAGGTGATCCACTTCTTCCTCGGCGGCATGCTCCATGGCCTTGCGCACTTCGGGCAGCTTGGCGGTCAGGGCCTGGCCTTGGTACAACGCCTGGGCGCAGACTTCACCGGTATGGTTGATGCGCATCAGCCCGGCAATATGACG > NC_002947/515296‑515591 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |