New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1410031 = | 54 (0.980) | 5 (0.090) | 4/246 | NT | 9.6% | coding (701/1059 nt) | nadA | quinolinate synthase iron‑sulfur cluster subunit |
? | NC_002947 | 1410076 = | 42 (0.790) | coding (746/1059 nt) | nadA | quinolinate synthase iron‑sulfur cluster subunit |
ATCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATT > NC_002947/1409886‑1410169 | tgcgcacagctgcggcatgccgcgccgttgccggcggtgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGAt > 1:171944‑M1/146‑149 (MQ=255) aTCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGAt > 5:195400/1‑149 (MQ=255) aGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAg < 6:195400/149‑1 (MQ=255) gCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTgg > 4:5657/1‑149 (MQ=255) cAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGc < 2:346114/145‑1 (MQ=255) cAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGc > 1:346114/1‑145 (MQ=255) ccGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGc < 8:40495/135‑1 (MQ=255) ccGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGc > 7:40495/1‑135 (MQ=255) ccGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGt < 3:5657/148‑1 (MQ=255) ccGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTg < 1:117002/149‑1 (MQ=255) gACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTggg > 3:274077/1‑149 (MQ=255) aCATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTgg < 1:60940/135‑1 (MQ=255) aCATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTgg > 2:60940/1‑135 (MQ=255) ggACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACcagccagc < 4:274077/149‑1 (MQ=255) tgggggcttcgacgaattccttgtccgggcacaactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATC‑AGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGa > 7:112411‑M1/109‑149 (MQ=255) ccTGCCTCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTGGGGGGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCaa < 8:288048/148‑1 (MQ=255) ccTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGACCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAg < 1:69764/149‑1 (MQ=255) gTTCACGAAGAGGTCAAGGCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCa < 5:223381/149‑1 (MQ=255) ttCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGcc > 2:154734/1‑146 (MQ=255) gAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTccac < 6:50778/119‑1 (MQ=255) gAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTccac > 5:50778/1‑119 (MQ=255) tCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGaa > 5:41355/1‑148 (MQ=255) cAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGc > 2:29738/1‑143 (MQ=255) cAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGc < 1:29738/143‑1 (MQ=255) cAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAAc > 7:292881/1‑148 (MQ=255) aaGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAg > 8:260561/1‑87 (MQ=255) aaGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAg < 7:260561/87‑1 (MQ=255) tCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGAc > 6:38823/1‑134 (MQ=255) tCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGAc < 5:38823/134‑1 (MQ=255) aactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATc > 7:144094‑M1/77‑120 (MQ=255) aactgctgcatcttgtagaagatgccgcggtcggtggcgacgatgaaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATc < 8:144094‑M1/44‑1 (MQ=255) gcgcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCt < 8:292881/149‑1 (MQ=255) gcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCtt > 1:269307/1‑148 (MQ=255) gcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCtt > 2:326511/1‑148 (MQ=255) gcCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTc < 2:269307/149‑1 (MQ=255) tGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTc > 5:205835/1‑90 (MQ=255) tGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTc < 6:205835/90‑1 (MQ=255) tGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGCTCAAGGCTGCCCAGCCCCTGCCGCACAAAGCCTTCATCGTCGCCa > 8:96385/1‑149 (MQ=255) aCATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCAccagc < 7:102480/95‑1 (MQ=255) aCATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCAccagc > 8:102480/1‑95 (MQ=255) aaGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCaccgaccg > 7:36738/1‑149 (MQ=255) gcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCaccga < 6:238078/141‑1 (MQ=255) gcTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCaccga > 5:238078/1‑141 (MQ=255) tACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtctt < 2:187512/149‑1 (MQ=255) tACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtctt < 7:96385/149‑1 (MQ=255) aCCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtcttc > 2:245108/1‑149 (MQ=255) aCCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtctt > 8:310883/1‑148 (MQ=255) aCCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtctt < 7:310883/148‑1 (MQ=255) cccGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtcttc > 1:266173/1‑148 (MQ=255) cccGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtcttc < 2:266173/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCTGCAATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtcttct < 6:165921/148‑1 (MQ=255) ccGGATGCTGCAATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCAtcttct > 5:165921/1‑148 (MQ=255) cGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTAc < 1:326511/149‑1 (MQ=255) cGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATgca < 5:358563/148‑1 (MQ=255) aaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCtgt > 2:282587‑M1/32‑82 (MQ=255) aaggttttgttcggcagggtctgggcagcctTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCtgt < 1:282587‑M1/52‑2 (MQ=255) tGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTtg > 4:27214/1‑149 (MQ=255) cccGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGa > 4:157141/1‑149 (MQ=255) aGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAg < 1:245108/149‑1 (MQ=255) gTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAgg < 1:154734/149‑1 (MQ=255) ccGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAAtt > 5:266932/1‑149 (MQ=255) | ATCCAGAAGCAAACCGGTGCCGACATGCTGCTGTGGGACGGTGCCTGCATCGTTCACGAAGAGTTCAAGTCGCGCCAGTTGGCTGACATGAAGGCGCTGTACCCGGATGCTGCGATCCTGGTGCACCCCGAGTCGCCGGAAGCGGTGATCGAGCTGGCCGACGCGGTGGGCTCCACCAGCCAGCTGATCAAGGCTGCCCAGACCCTGCCGAACAAAACCTTCATCGTCGCCACCGACCGCGGCATCTTCTACAAGATGCAGCAGTTGTGCCCGGACAAGGAATT > NC_002947/1409886‑1410169 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |