New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1600438 = | 44 (0.790) | 8 (0.150) | 6/244 | NT | 16.5% | coding (746/2292 nt) | bglX | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
? | NC_002947 | 1600489 = | 39 (0.740) | coding (695/2292 nt) | bglX | beta‑D‑glucoside glucohydrolase |
GCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGCGAAATGCTTGAC > NC_002947/1600290‑1600580 | ttcGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAgcg > 1:42108/3‑149 (MQ=255) gTCACGGGCGACGCCGTGGAGAATAAGCTCCTGGATGGCACAGTGGTCGATGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGCAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGcca > 4:68585/1‑149 (MQ=255) tCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGccac > 5:181656/1‑149 (MQ=255) gcgctcgttccagggcagcagcccggccaaccccgacagcatcatggccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgataggtgcctgccgaaaatgtacaacgactacctgcccc < 4:50351‑M1/5‑3 (MQ=255) cgctcgttccagggcagcagcccggccaaccccgacagcatcatggccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGccac > 6:156610‑M1/144‑148 (MQ=255) ctcgttccagggcagcagcccggccaaccccgacagcatcatggccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCAt < 6:364385‑M1/8‑1 (MQ=255) gACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGc > 4:219857/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGc > 1:177719/1‑148 (MQ=255) ccagggcagcagcccggccaaccccgacagcatcatggccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacgggcgatatgagccggccgaaaatgtacaccgactacctGCCACCATCCCGcc < 6:15575‑M1/14‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCAc < 7:110424/149‑1 (MQ=255) gCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCAc < 2:40973/149‑1 (MQ=255) ccGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCAcc < 5:90766/149‑1 (MQ=255) aTCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCg > 2:287103/1‑148 (MQ=255) cccggccaaccccgacagcatcatggccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCATCACGCCACCGGCACCCg < 7:242978‑M1/25‑1 (MQ=255) aGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTTAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATc > 4:239844/1‑149 (MQ=255) aTGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAgcgcggc > 1:126242/1‑149 (MQ=255) tGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAgcgcggcg < 2:126242/149‑1 (MQ=255) gCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAgcgcggcgcg < 2:116576/149‑1 (MQ=255) cACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGa > 8:155100/1‑149 (MQ=255) ccGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATa < 5:240034/149‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAggg < 3:219857/149‑1 (MQ=255) gccatcgtcaagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGc > 5:15575‑M1/99‑149 (MQ=255) gCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCAGGGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTgg > 1:282183/1‑148 (MQ=255) cccatcgtcaagcatttcgccttggatggcgccggggaacgcgggcgcgactagaacacgggcgatatgagcctgccgaaaatgtacaaccactacctCCCACCATCACGCCACGGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGc > 7:313897‑M1/99‑149 (MQ=255) cccatcgtcaagcatttcgcctagtatggggccgtcgaaggcgggcgcgactacaacacgggcgatatgagcctgccgatattgtacaacgactacctGCCACGATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGTGTGGc > 8:242978‑M1/99‑149 (MQ=255) aagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAgg < 6:146668‑M1/54‑1 (MQ=255) aagcatttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAgg > 5:146668‑M1/90‑143 (MQ=255) aCGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTTAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGt < 3:239844/148‑1 (MQ=255) aCGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCTGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGtt < 1:10097/149‑1 (MQ=255) cGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTg < 1:287103/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGt < 6:81981/149‑1 (MQ=255) atttcgccttgtatggcgccgtggaaggcgggcgcgactacaacacggtcgatatgagcctgccgaaaatgtacaacgactacctGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGt > 5:364385‑M1/86‑149 (MQ=255) gAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACAttt > 6:130172/1‑149 (MQ=255) aGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAgg > 8:59807/1‑131 (MQ=255) aGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAgg < 7:59807/131‑1 (MQ=255) ccccACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCgg < 6:181656/149‑1 (MQ=255) cccACTCATTGCGCAGCACGTCGTTCATCAGCCA‑GCTGATCGAGGTGCACGGTACGCCGTTGATCCAGATCAGCGCCACCATCACGCCACCCGCACCCGCATCGAGCCCGGCGCGATACGCAGGCAGGTAGACGTTGTACATTTTCgg > 2:149773/1‑148 (MQ=255) ccTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCgg < 1:270422/142‑1 (MQ=255) ccTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCgg > 2:270422/1‑142 (MQ=255) agcagGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGAc < 2:177719/149‑1 (MQ=255) ggTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCgtg > 3:151044/1‑149 (MQ=255) tCGTTCATCTGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGtgtt < 2:282183/149‑1 (MQ=255) gTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGtgttg > 3:50351/1‑148 (MQ=255) atcaGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTc < 1:353076/149‑1 (MQ=255) aGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGTGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTcgcg > 4:163767/1‑149 (MQ=255) tgtTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCt > 4:53466/1‑149 (MQ=255) ttGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTc > 5:261723/1‑149 (MQ=255) ttGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTc < 7:216013/149‑1 (MQ=255) gAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGGGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCAc > 8:42487/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGgc > 6:202590/1‑149 (MQ=255) ccGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCa < 1:149773/149‑1 (MQ=255) aggTACGCCGTTGATAGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGTCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATGGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCAt < 3:68585/148‑1 (MQ=255) cGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTCTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGc > 1:22681/1‑148 (MQ=255) gATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGc < 6:337667/144‑1 (MQ=255) gATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGc > 5:337667/1‑144 (MQ=255) aTCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAgg < 7:227937/142‑1 (MQ=255) aTCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAgg > 8:227937/1‑142 (MQ=255) ttCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCGGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGCGAAATGCTTGAc > 5:341810/1‑149 (MQ=255) | GCCGTCACGGGCGACGCCGTGGCGAATCAGCTCCTGGATGGCACCGTGGTCGCTGATGGTCACGCCCTTGAAGCCCCACTCCTTGCGCAGCAGGTCGTTCATCAGCCA‑GGTGTTGGAGGTGGCCGGTACGCCGTTGATCGAGTTCAGCGCCACCATCACGCCACCGGCACCCGCATCGAGCGCGGCGCGATAGGGTGGCAGGTAGTCGTTGTACATTTTCGGCAGGCTCATATCGACCGTGTTGTAGTCGCGCCCGCCTTCCACGGCGCCATACAAGGCGAAATGCTTGAC > NC_002947/1600290‑1600580 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |