New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1647433 = | 55 (0.990) | 6 (0.110) | 4/244 | NT | 11.3% | coding (1289/1335 nt) | oprB‑II | carbohydrate‑selective porin |
? | NC_002947 | 1647473 = | 42 (0.800) | coding (1249/1335 nt) | oprB‑II | carbohydrate‑selective porin |
ATCAGCAACAGCAGCGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTCGTAGTCATAGA > NC_002947/1647286‑1647577 | aTCAGCAACAGCAGCGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGAc < 2:131574/149‑1 (MQ=255) aGCAACAGCAGCGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTg > 4:59055/1‑149 (MQ=255) tcgcaagaacgcccgcctggtcaaccaggccgccggcctctatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaAGCTg > 5:167213‑M1/144‑148 (MQ=255) gCAACAGCAGCGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGc < 4:62491/149‑1 (MQ=255) gcagcGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGTCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACAcc < 1:224032/149‑1 (MQ=255) cgcgcCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACcccgc > 7:241119/1‑149 (MQ=255) gcgcCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACcccgcc > 8:167269/1‑149 (MQ=255) cgcCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACcccgccc > 6:100587/1‑149 (MQ=255) ccAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCgg < 4:331469/149‑1 (MQ=255) cAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCggg > 2:14297/1‑149 (MQ=255) aGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTTAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCg < 7:240527/149‑1 (MQ=255) aGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGc < 3:59055/148‑1 (MQ=255) aGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCATGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTgtc < 4:289100/148‑3 (MQ=255) ggCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCg > 6:295118/1‑148 (MQ=255) gcgGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATg > 8:318532/1‑149 (MQ=255) cgccggcctctatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTg < 1:217169‑M1/35‑1 (MQ=255) cgccggcctctatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTg < 1:211908‑M1/35‑1 (MQ=255) aGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAgg < 4:313759/149‑1 (MQ=255) gCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGt < 7:167269/149‑1 (MQ=255) ggCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTg < 7:318532/149‑1 (MQ=255) tctatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTg > 3:31770‑M1/106‑110 (MQ=255) tctatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTg < 4:31770‑M1/5‑1 (MQ=255) cTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTggg < 5:295118/149‑1 (MQ=255) tatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTggg > 2:217169‑M1/104‑147 (MQ=255) tatgactacgacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTggg > 2:211908‑M1/104‑147 (MQ=255) ccTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGc < 5:100587/148‑1 (MQ=255) ccTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCg > 1:172981/1‑149 (MQ=255) gacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGt > 3:30429‑M1/95‑134 (MQ=255) gacaacccgggcttcctgccagtgcaggacaccgagtacagcgccgagctgtattacggcattcacttggccgactggctcacggtacgccccaACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGt < 4:30429‑M1/40‑1 (MQ=255) gCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGTGCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGa < 8:157608/148‑1 (MQ=255) gCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGGTGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAg > 4:264255/1‑149 (MQ=255) gCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGa < 2:341443/148‑1 (MQ=255) cACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGc > 6:47947/1‑128 (MQ=255) cACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGc < 5:47947/128‑1 (MQ=255) cACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGc < 1:14297/149‑1 (MQ=255) cACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGc < 8:241119/149‑1 (MQ=255) aGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAGGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCgg < 6:223625/149‑1 (MQ=255) aGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCg < 4:152519/148‑1 (MQ=255) aGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTAAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCgg > 1:93927/1‑149 (MQ=255) gCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGcc > 1:55021/1‑148 (MQ=255) cTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGt < 4:236364/103‑1 (MQ=255) cTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGt > 3:236364/1‑103 (MQ=255) aTCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAg < 2:172981/147‑1 (MQ=255) aTCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGt < 8:151287/148‑1 (MQ=255) aTCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGt < 2:64719/148‑1 (MQ=255) tAGGTACTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGAACTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGGGGCGCATGTCCAGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGaagg > 4:76939/1‑147 (MQ=255) gTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCg > 1:245936/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATg > 1:147038/1‑89 (MQ=255) gTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATg < 2:147038/89‑1 (MQ=255) gTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCg > 6:192932/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCg > 6:197963/1‑149 (MQ=255) gTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCg > 6:330237/1‑149 (MQ=255) cAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGCCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGgc > 1:194105/1‑149 (MQ=255) aaaaaaGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTTAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGgcg < 2:93927/149‑1 (MQ=255) aGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGgtg > 3:76893/1‑149 (MQ=255) ctGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTg > 5:232415/1‑149 (MQ=255) tGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTgg < 2:194105/149‑1 (MQ=255) gATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGc < 2:55021/148‑1 (MQ=255) gATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCa < 4:198778/149‑1 (MQ=255) ttCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGTGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAgg > 6:186429/1‑147 (MQ=255) cgccgATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCggg > 6:20503/1‑149 (MQ=255) cgATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTg > 6:141118/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTc < 2:245936/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTCGTa < 4:76893/149‑1 (MQ=255) gggCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGgtg < 8:155651/116‑1 (MQ=255) gggCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGgtg > 7:155651/1‑116 (MQ=255) cATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTCGTAGTCa > 1:84960/1‑146 (MQ=255) aTCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGTGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTCGTAGTCATaga < 5:186429/149‑1 (MQ=255) | ATCAGCAACAGCAGCGCGCCAATCAGGCGCGGTAGCCAGCGGCTTCCTTGGTTCGCACCTTCAGTGCTCATCGTAGGTTCTCCGTCAGGTCAAAAAAGGGGTTAGAAACTGCTCTGGATCTTCAGGCCGCCGATCAGGGCGCCATCGACCTGCGACACCCCGCCCGGGTGGCGGATGTACTGCAGGTTGGGGCGTACCGTGAGCCAGTCGGCCAAGTGAATGCCGTAATACAGCTCGGCGCTGTACTCGGTGTCCTGCACTGGCAGGAAGCCCGGGTTGTCGTAGTCATAGA > NC_002947/1647286‑1647577 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |