New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1650007 = | 43 (0.780) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 7.4% | coding (1053/2043 nt) | PP_1446 | TonB‑dependent receptor |
? | NC_002947 | 1650043 = | 35 (0.670) | coding (1017/2043 nt) | PP_1446 | TonB‑dependent receptor |
GTTCTCGTTGCCTTTGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGCCTTCCTCGATTTCG > NC_002947/1649860‑1650148 | tcggtcaaggtagatgctggttacaccgactacgaacacagcgaaatcgaggaaggcgaggtccataccaccttcaagaacaagggctacgaagcccgcatcgaagcccgtcaccagccgctcgggccgattgaaggggtgatcggtGc < 6:236136‑M1/2‑1 (MQ=255) ttGCCTTTGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGc < 7:134188/149‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCgg < 1:346511/148‑1 (MQ=255) ccTTTGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGga < 3:268860/149‑1 (MQ=255) tttGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGgag > 3:50980/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAAt > 2:290490/1‑149 (MQ=255) gggTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGaa < 4:45262/140‑1 (MQ=255) gggTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGaa > 3:45262/1‑140 (MQ=255) ggTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCgg > 5:337137/1‑149 (MQ=255) tACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGa > 4:289453/1‑149 (MQ=255) gcgGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCt > 5:337723/1‑149 (MQ=255) gtgtGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGc < 6:337137/149‑1 (MQ=255) acacagcgaaatcgaggaaggcgaggtccataccaccttcaagaacaagggctacgaagcccgcatcgaagcccgtcaccagccgctcgggccgattgaaggggtgatcggtGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCa > 5:236136‑M1/113‑149 (MQ=255) cacagcgaaatcgaggaaggcgaggtccataccaccttcaagaacaagggctacgaagcccgcatcgaagcccgtcaccagccgctcgggccgattgaaggggtgatcggtGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCAc > 3:96396‑M1/112‑149 (MQ=255) cATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATc < 2:343552/148‑1 (MQ=255) tGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCAcc < 5:257016/149‑1 (MQ=255) aggaaggcgaggtccataccaccttcaagaacaagggctacgaagcccgcatcgaagcccgtcaccagccgctcgggccgattgaaggggttatcggtGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGCCACCGATCACCCCTTc > 7:283121‑M1/99‑149 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGccc < 8:103288/98‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGccc > 7:103288/1‑98 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATc < 6:337723/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATc > 2:354957/1‑149 (MQ=255) aGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAg < 4:50980/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGAc < 7:124209/149‑1 (MQ=255) ggTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACggg < 1:354957/149‑1 (MQ=255) gTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGc < 6:68009/149‑1 (MQ=255) cTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCg < 6:93857/149‑1 (MQ=255) gCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGAt < 7:71225/106‑1 (MQ=255) gCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGAt > 8:71225/1‑106 (MQ=255) aCTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTg < 2:123660/130‑1 (MQ=255) aCTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTg > 1:123660/1‑130 (MQ=255) aCTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCgg > 2:21291/1‑149 (MQ=255) aCTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCgg > 1:283228/1‑149 (MQ=255) cTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCtt > 1:242455/1‑149 (MQ=255) aTGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGcc > 4:90689/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTg > 3:130664/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCGGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTg > 6:219829/1‑149 (MQ=255) aGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGt > 8:126737/1‑148 (MQ=255) aGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGt < 7:126737/148‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGAAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGtt > 1:94238/1‑149 (MQ=255) gcCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTg < 4:37954/110‑1 (MQ=255) gcCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTg > 3:37954/1‑110 (MQ=255) cTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAggt < 3:289453/149‑1 (MQ=255) ggTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTAt > 1:265807/1‑149 (MQ=255) tgCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGGGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGcc < 7:87486/149‑1 (MQ=255) aCGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCtt > 5:57617/1‑122 (MQ=255) aCGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCtt < 6:57617/122‑1 (MQ=255) aaGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGCCTTCCTCGAt > 4:277531/1‑149 (MQ=255) aaGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGCCTTCCTCGAt > 8:87934/1‑149 (MQ=255) cTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGCCTTCCTCGATTTCg < 2:242455/149‑1 (MQ=255) GCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTg < 4:126538‑M1/109‑1 (MQ=255) | GTTCTCGTTGCCTTTGGCGTCCGGGTCTACGCGGGTGTGCTCCATGCGCGCGCCCAGGCTCAGGTTCAGGCGTTCGGTGGCTTGCCACTGCTCCAGCATGAACAGCGCCAGGCTGTCGGTATCGGTGTGCGGGACGAAGGCTTCCTCGCCCAGGGCGGAGAATTCGTTGCGGCTGACCTGGGCACCGATCACCCCTTCAATCGGCCCGAGCGGCTGGTGACGGGCTTCGATGCGGGCTTCGTAGCCCTTGTTCTTGAAGGTGGTATGGACCTCGCCTTCCTCGATTTCG > NC_002947/1649860‑1650148 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |