New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1876471 | 41 (0.740) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.6% | coding (286/1182 nt) | PP_1682 | glycoside hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 1876531 | 34 (0.640) | coding (346/1182 nt) | PP_1682 | glycoside hydrolase family protein |
TGCCCTGAGGGGGTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATAT > NC_002947/1876326‑1876619 | tGCCCTGAGGGGGTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCggg < 5:136649/149‑1 (MQ=255) cccTGAGGGGGTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGgc < 8:162734/148‑1 (MQ=255) cccTGAGGGGGTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGgc < 6:343989/148‑1 (MQ=255) ggTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTAGACCGGGCGCA‑CCAGGCg > 7:162970/1‑149 (MQ=255) gTACGTCGCCACATGGGTGAGGCTGTAGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCgg < 8:162970/149‑1 (MQ=255) gTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCgg > 7:298239/1‑149 (MQ=255) gccccttGGGTGCGGCTTTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGATACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCaa < 6:172830/143‑1 (MQ=255) cacaTGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGTCGGGGCTCAAgg < 1:92583/149‑1 (MQ=255) acaTGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAggt > 2:314515/1‑149 (MQ=255) caTGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAggtg < 3:204617/149‑1 (MQ=255) aTGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAggtgg < 7:197737/149‑1 (MQ=255) ggTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCgggg < 5:324883/136‑1 (MQ=255) ggTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCgggg > 6:324883/1‑136 (MQ=255) gTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCActct > 1:171607/1‑149 (MQ=255) aCGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCg > 2:227097/1‑149 (MQ=255) gACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACtctc < 4:161860/146‑1 (MQ=255) gACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACtctc > 3:161860/1‑146 (MQ=255) cAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATcgcg > 3:31322/1‑136 (MQ=255) cAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATcgcg < 4:31322/136‑1 (MQ=255) aaTGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcc > 2:261583‑M1/1‑99 (MQ=255) aTCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATg > 3:71668/1‑149 (MQ=255) ccGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGAGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATgcg > 4:4600/1‑149 (MQ=255) gTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTg > 1:314515‑M2/1‑148 (MQ=255) tGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCgg < 5:243866/138‑1 (MQ=255) tGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCgg > 6:243866/1‑138 (MQ=255) gAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggt > 4:71668‑M2/1‑146 (MQ=255) aaaCGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtc > 3:4600‑M2/1‑145 (MQ=255) aCGTGATTTCCTCCTTGGTAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcg < 1:41085‑M2/148‑6 (MQ=255) aCGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcga < 1:261583‑M1/149‑67 (MQ=255) gTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcgagg < 2:319079‑M1/149‑69 (MQ=255) ctTGGTAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAgg < 2:41085/148‑1 (MQ=255) ttGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCa < 6:203406/99‑1 (MQ=255) ttGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCa > 5:203406/1‑99 (MQ=255) gcCGATACCTATGAAGGCCTGGCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga < 2:31567/149‑1 (MQ=255) ccGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCgat < 2:171607/149‑1 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga > 5:315604/1‑141 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga < 6:315604/141‑1 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGcc > 3:215282/1‑149 (MQ=255) tATGAAGGCCTGTCCGCCGCCGCCCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCCTCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACACCCAGGGCCAGTTCGAGGATCGCCt > 6:214815/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCtg > 3:157587/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGTCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCtg < 8:298239/148‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCAGACAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATCATCGCCtg > 1:277477/1‑149 (MQ=255) gTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACACCCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGAc > 6:210041/1‑148 (MQ=255) cGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑ACAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAAc > 1:75651/1‑149 (MQ=255) gCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTa < 1:227097/149‑1 (MQ=255) ccGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGCGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTAc > 2:1984/1‑149 (MQ=255) cGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGCTCGCCTGTGGCAAGACAAACCATACt > 2:304771/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTcc < 7:33402/147‑1 (MQ=255) tgctgcGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCt < 4:215282/149‑1 (MQ=255) cGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTAt < 5:359049/71‑1 (MQ=255) cGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTAt > 6:359049/1‑71 (MQ=255) ccTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcac < 2:319079‑M2/149‑82 (MQ=255) tCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgt < 1:261583‑M2/149‑84 (MQ=255) cGACCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctaccaaggaggaaatcacgt < 1:41085‑M1/148‑144 (MQ=255) gACCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgttt > 3:4600‑M1/1‑4 (MQ=255) gACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCgaga < 6:177283/149‑1 (MQ=255) aCCagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgtttc > 4:71668‑M1/1‑3 (MQ=255) aCCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGGCATCGCGACACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGat < 6:233581/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGata < 2:277477/149‑1 (MQ=255) cagcgcatacccggtagcgagagtggcgcgatgaccaccttgagccccgcctggtgcgcccggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgtttcac > 1:314515‑M1/1‑1 (MQ=255) cGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGatat > 7:12636/1‑149 (MQ=255) | TGCCCTGAGGGGGTACGGCGCCACATGGGTGCGGCTGTCGTACGACAAATGGCATCCGGTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATAT > NC_002947/1876326‑1876619 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |