New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1876471 | 41 (0.740) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 7.6% | coding (286/1182 nt) | PP_1682 | glycoside hydrolase family protein |
? | NC_002947 | = 1876531 | 34 (0.640) | coding (346/1182 nt) | PP_1682 | glycoside hydrolase family protein |
GTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGCCTACAACCTGATCAATGAGC > NC_002947/1876384‑1876675 | gTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTg > 1:314515‑M2/1‑148 (MQ=255) gAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggt > 4:71668‑M2/1‑146 (MQ=255) aaaCGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtc > 3:4600‑M2/1‑145 (MQ=255) aCGTGATTTCCTCCTTGGTAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcg < 1:41085‑M2/148‑6 (MQ=255) ctTGGTAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAgg < 2:41085/148‑1 (MQ=255) gcCGATACCTATGAAGGCCTGGCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga < 2:31567/149‑1 (MQ=255) ccGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCgat < 2:171607/149‑1 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga > 5:315604/1‑141 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCga < 6:315604/141‑1 (MQ=255) cTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGcc > 3:215282/1‑149 (MQ=255) tATGAAGGCCTGTCCGCCGCCGCCCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCCTCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACACCCAGGGCCAGTTCGAGGATCGCCt > 6:214815/1‑149 (MQ=255) aTGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCtg > 3:157587/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGTCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCtg < 8:298239/148‑1 (MQ=255) tGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCAGACAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATCATCGCCtg > 1:277477/1‑149 (MQ=255) gTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACACCCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGAc > 6:210041/1‑148 (MQ=255) cGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑ACAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAAc > 1:75651/1‑149 (MQ=255) gCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTa < 1:227097/149‑1 (MQ=255) ccGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGCGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTAc > 2:1984/1‑149 (MQ=255) cGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGCTCGCCTGTGGCAAGACAAACCATACt > 2:304771/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTcc < 7:33402/147‑1 (MQ=255) tgctgcGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCt < 4:215282/149‑1 (MQ=255) ccTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcac < 2:319079‑M2/149‑82 (MQ=255) tCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgt < 1:261583‑M2/149‑84 (MQ=255) gACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCgaga < 6:177283/149‑1 (MQ=255) aCCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGGCATCGCGACACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGat < 6:233581/149‑1 (MQ=255) ccGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGata < 2:277477/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGatat > 7:12636/1‑149 (MQ=255) ggCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTggtcgagggtggcacgcagcaccgccaggtcggcgtcggacaggccttcataggtatcggcgctgccaaggaggaaatcacgtttcaccggatgccatt > 2:261583‑M2/1‑50 (MQ=255) gCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACt < 2:75651/149‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGaaaa < 3:98792/147‑1 (MQ=255) tCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGaaaa > 4:98792/1‑147 (MQ=255) gtCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGc > 8:7173/1‑149 (MQ=255) aTCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGTGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCAt < 1:1984/149‑1 (MQ=255) aTCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCAt > 3:97927/1‑149 (MQ=255) gcgcCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCACTTCGATGATCGACTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCTGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATcgc > 6:301958/1‑149 (MQ=255) ccACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGc < 4:97927/149‑1 (MQ=255) aCTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGcc > 2:343704/1‑148 (MQ=255) tcGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGCCTACaa > 5:186566/1‑149 (MQ=255) gCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTg > 1:807/1‑86 (MQ=255) gCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTg < 2:807/86‑1 (MQ=255) ccGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGCCTACAACCTGa < 4:157587/148‑1 (MQ=255) cgcTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGCCTACAACCTGATCAATGAGc < 7:7173/148‑1 (MQ=255) | GTGAAACGTGATTTCCTCCTTGGCAGCGCCGATACCTATGAAGGCCTGTCCGACGCCGACCTGGCGGTGCTGCGTGCCACCCTCGACCGGGCGCA‑CCAGGCGGGGCTCAAGGTGGTCATCGCGCCACTCTCGCTACCGGGTATGCGCTGGTCGCAAAACAACCAGGGCCAGTTCGATGATCGCCTGTGGCAAGACAAACGCTACTGGTCCCAGGCTGCGGCGTTCTGGCGAGATATGGCGCGCGAACTGAAAAGTCATCCGGCCATCGCGGCCTACAACCTGATCAATGAGC > NC_002947/1876384‑1876675 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |