New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1902818 | 55 (0.990) | 4 (0.080) | 4/244 | NT | 7.2% | coding (3369/4026 nt) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
? | NC_002947 | = 1902874 | 50 (0.950) | coding (3425/4026 nt) | PP_1703 | assimilatory nitrate reductase/sulfite reductase |
CAACAACTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTCCTTGCCGACCGT > NC_002947/1902672‑1902965 | caacaaCTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAgctg < 2:170188/149‑1 (MQ=255) aacTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGC > 5:20847‑M1/1‑143 (MQ=255) aacTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGC < 6:26151‑M1/143‑1 (MQ=255) aacTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGC < 6:20847‑M1/143‑1 (MQ=255) aacTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGC > 5:26151‑M1/1‑143 (MQ=255) cTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCAAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGctggctgg > 3:48039/1‑148 (MQ=255) cAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACt < 3:2804/149‑1 (MQ=255) aTTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTTGCTGGAACTGCTCa < 4:311905/149‑1 (MQ=255) aTTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTc > 6:283515/1‑148 (MQ=255) gCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAAc < 3:79982/148‑1 (MQ=255) aGCAACGCGCCTGCCGTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCACGGCCGAGCTGCAAGATGGGCGGGGGGGCCGGCAGTTGGGCTATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCCGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCAtt < 2:56113/149‑1 (MQ=255) gCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTg < 6:279801/149‑1 (MQ=255) gacTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCTAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATTTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCGAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGcc < 2:285818/145‑1 (MQ=255) cTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCgg < 2:252414/149‑1 (MQ=255) gACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATAGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGct > 1:263702/1‑149 (MQ=255) cTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTa > 3:104111/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCa < 8:3310/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAACATTGGCTGTGGGGCAGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCACCAGCAGTTGCCGATGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAAACATTGCAGCCGCGGAT‑CTAATCCATCAg > 5:260036/1‑149 (MQ=255) ctgcAGCCTGAATGCCAGGCCAAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGtt < 4:48039/148‑1 (MQ=255) ctgcAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTc < 5:283515/149‑1 (MQ=255) gcAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATc > 1:217862/1‑142 (MQ=255) gcAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATc < 2:217862/142‑1 (MQ=255) cAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGtt > 5:264734/1‑145 (MQ=255) cAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGtt < 6:264734/145‑1 (MQ=255) cTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGGCGTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCAGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCA‑CGATTCGATCAGTTCCAGCCCg < 7:55307‑M2/149‑2 (MQ=255) aaGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagccagctggccag < 7:134186‑M1/149‑66 (MQ=255) aaGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagccagctggccag > 8:134186‑M1/1‑84 (MQ=255) aaGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCgctggc < 3:152265‑M2/146‑7 (MQ=255) aaGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCgctggc > 4:152265‑M2/1‑140 (MQ=255) ccGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACcca < 2:263702/149‑1 (MQ=255) tGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACccaggccag > 1:319229/1‑149 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGtt > 4:332573/1‑121 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGtt < 3:332573/121‑1 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCAccc > 2:341814/1‑140 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCAccc < 1:341814/140‑1 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCCGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagcca < 1:208595‑M1/128‑57 (MQ=255) cAAGATTGGCTGTGGGGCCCGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagcca > 2:208595‑M1/1‑72 (MQ=255) aaGTTTGGCTGTGGGGGCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAATCGATTGCAGCCGCTGCT‑CTATTCGTTCTGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTg < 6:260036/149‑1 (MQ=255) aGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGTAGCCGCTGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGgcg < 1:37382/133‑1 (MQ=255) aGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGTAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGgcg > 2:37382/1‑133 (MQ=255) gggCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCCGGCCAGGTGCATCTGACGGTAt > 3:44483/1‑149 (MQ=255) ggCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGc < 8:136693/66‑1 (MQ=255) ggCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGc > 7:136693/1‑66 (MQ=255) gTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGc < 4:104111/149‑1 (MQ=255) ttGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGAc > 5:326124/1‑143 (MQ=255) ttGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGAc < 6:326124/143‑1 (MQ=255) ttGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCg > 4:79335/1‑149 (MQ=255) ggTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGt > 2:327145/1‑148 (MQ=255) gATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATgg < 3:79335/149‑1 (MQ=255) gtgCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCg > 7:321038/1‑148 (MQ=255) ctgcGCGCCTTCCCGCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACg > 7:304311/1‑149 (MQ=255) tgcGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACg > 5:325175/1‑148 (MQ=255) cgcgcCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTa < 8:304311/148‑1 (MQ=255) cTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACgg > 8:46958/1‑125 (MQ=255) cTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACgg < 7:46958/125‑1 (MQ=255) cTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATg > 7:307596/1‑134 (MQ=255) cTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATg < 8:307596/134‑1 (MQ=255) ccAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGc > 4:94440/1‑148 (MQ=255) cagcagTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATc > 1:340296/1‑66 (MQ=255) cagcagTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATc < 2:340296/66‑1 (MQ=255) cagcagTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAAc > 4:50104/1‑133 (MQ=255) cagcagTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAAc < 3:50104/133‑1 (MQ=255) gCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCTCCGGCGGCT‑CTATTCGATCACTTCCAGCCCGCTGGCTCACCCAGGCCTGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTc < 8:55307/148‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCTGCTTTTCGGTCAGTGCCGGCCCGGTGGCGCCCCCAGGCCAGGGGCATCTGCCGGTATCGCCGGTGCGGTAGGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCGCAAGTTTcc > 1:259843/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTCCtt > 1:70494/1‑149 (MQ=255) cGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTCCtt < 8:321038/149‑1 (MQ=255) cTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCgctggccagcggcaactgctgggggaaggcgcgcagcacatcgaccaactgccggccccacagccaatcttgcagctcggcctt > 8:134186‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCgctggccagcggcaactgctgggggaaggcgcgcagcacatcgaccaactgccggccccacagccaatcttgcagctcggcctt < 7:134186‑M2/149‑85 (MQ=255) gCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagccagctggccagcggcaactgctgggggaaggcgcgcagcacatcgaccaactgccggccccacagccaatcttgcagctcggcctt < 3:152265‑M1/146‑141 (MQ=255) gCCAGCgggctggaactgatcgaatagagccgcggctgcaatggtttgagcagttccagccagctggccagcggcaactgctgggggaaggcgcgcagcacatcgaccaactgccggccccacagccaatcttgcagctcggcctt > 4:152265‑M1/1‑6 (MQ=255) gCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGGGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTCGTTGCCGa > 4:147326/1‑149 (MQ=255) cgggctggaactgatcgaatcgtgccgcggctgcaatggtttgagcagttcctgccagctggccagcggcaactgctgggggacgccgcgcagcacatcgaccaactgccggccccacagccaatcttgcagctcggccttgcattcag < 7:55307‑M1/149‑149 (MQ=255) | CAACAACTGCAGGCATTTGCCAGCAACGCGCCTGACCTGCAGCGCTTGCTGCAGCCTGAATGCAAGGCCGAGCTGCAAGATTGGCTGTGGGGCCGGCAGTTGGTCGATGTGCTGCGCGCCTTCCCCCAGCAGTTGCCGCTGGCCAGCTGGCTGGAACTGCTCAAACCATTGCAGCCGCGGCT‑CTATTCGATCAGTTCCAGCCCGCTGGCGCACCCAGGCCAGGTGCATCTGACGGTATCGACGGTGCGTTATGGCGAACGTAAAGGCGTGTGCTCAAGTTTCCTTGCCGACCGT > NC_002947/1902672‑1902965 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |