| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CGGGTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGA > NC_002947/2341694‑2341982 | cGGGTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGC < 4:155008‑M1/143‑1 (MQ=255)cGGGTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACATCGGCGTtgtg > 5:142954/1‑149 (MQ=255) gggTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTtgt < 4:109544/147‑1 (MQ=255) gggTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGc < 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gCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATACTGGCCAATgccgcggccgc > 3:333082/1‑149 (MQ=255) gCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGAACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccgcggccgc > 8:143118/1‑149 (MQ=255) cAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTa > 4:199925/1‑149 (MQ=255) aCGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCACTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACgg > 5:296659/1‑149 (MQ=255) gtggACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTtgtg > 8:320198/1‑111 (MQ=255) gtggACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTtgtg < 7:320198/111‑1 (MQ=255) tggACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGAc < 3:3015/149‑1 (MQ=255) gACTGGATTCCGGAAGCGCGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGAccc > 6:43294/1‑149 (MQ=255) aCTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCg < 4:337002/149‑1 (MQ=255) cTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCattggccaggatcggcacaacgccgaagta < 2:85496‑M1/130‑31 (MQ=255) cTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCattggccaggatcggcacaacgccgaagta > 1:85496‑M1/1‑100 (MQ=255) tGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGCCCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGt > 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ttCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGa > 5:186655/1‑148 (MQ=255) ggAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccg < 1:16609‑M2/116‑5 (MQ=255) ggAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTg > 3:216835/1‑149 (MQ=255) ggAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTg > 8:109470/1‑149 (MQ=255) gAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGc > 7:318355/1‑149 (MQ=255) aGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGccc < 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gTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATgg < 3:241943/149‑1 (MQ=255) gTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATgg > 7:151868/1‑149 (MQ=255) tactTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttccggaatccag < 2:85496‑M2/130‑101 (MQ=255) tactTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCtggtgg > 6:33693/1‑139 (MQ=255) ctTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGa < 5:248270/147‑1 (MQ=255) ctTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGAcc > 4:308818/1‑149 (MQ=255) ttCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcg > 7:258775/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcgc > 3:108288/1‑149 (MQ=255) tCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcgc > 4:332844/1‑149 (MQ=255) cGGCattggccaggatcggcacaacgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttcc < 1:16609‑M1/116‑113 (MQ=255) cGGCattggccaggatcggcacaacgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttcc > 2:16609‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCGTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcg < 5:203371/147‑1 (MQ=255) cGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACcgc > 3:549/1‑148 (MQ=255) ggCattggccaggatcggcacaacgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttccggaatccagtccaccagcgtctgggccaatgcat < 1:46349‑M1/149‑147 (MQ=255) ggCattggccaggatcggcacaacgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttccggaatccagtccaccagcgtctgggccaatgcat < 8:79406‑M1/149‑147 (MQ=255) ggCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttccggaatccagtccaccagcgtctgg < 8:163293‑M2/139‑116 (MQ=255) ggCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgctggtcagcgccaccaccagcgggaaccagtggctccacgcttccggaatccagtccaccagcgtctgg > 7:163293‑M2/1‑24 (MQ=255) gCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATgccgaagtagtacgcgtcgttggacagcacgaaggtcagcggcatgc > 8:322213‑M2/1‑23 (MQ=255) | CGGGTACCAAGATGGTCGATGCATTGGCCCAGACGCTGGTGGACTGGATTCCGGAAGCGTGGAGCCACTGGTTCCCGCTGGTGGTGGCGCTGACCAGCATGCCGCTGACCTTCGTGCTGTCCAACGACGCGTACTACTTCGGCGTTGTGCCGATCCTGGCCAATGCCGCGGCCGCGTACGGCATCGACCCGGTGGAAATTGCCCGCGCCTCGGTGCTTGGCCAGCCGGTTCACCTGATGAGCCCGCTGGTGGCCTCGACCCTGCTGCTGGTGGGCATGGTCGACCGCGA > NC_002947/2341694‑2341982 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |