New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2765041 = | 45 (0.810) | 5 (0.100) | 5/242 | NT | 10.6% | noncoding (183/199 nt) | PP_mr33 | Cobalamin regulatory region |
? | NC_002947 | 2765088 = | 42 (0.800) | noncoding (136/199 nt) | PP_mr33 | Cobalamin regulatory region |
GTGGCGAAACGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTGGGATTCCC > NC_002947/2764898‑2765186 | gatggtctaccatgcgggccgccggtttccaccacggaactaacagggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGcc > 7:177261‑M1/145‑149 (MQ=255) ggCGAAACGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAg < 5:298030/143‑1 (MQ=255) ggCGAAACGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGCGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAg > 6:298030/1‑143 (MQ=255) gAAACGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAgg > 4:130210/1‑149 (MQ=255) cGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGtctc < 6:9344/149‑1 (MQ=255) gcaTGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTg > 1:214062/1‑149 (MQ=255) caTGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTgg > 1:106631/1‑149 (MQ=255) cggtttccaccacggaactaacagggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGc > 5:58370‑M1/123‑126 (MQ=255) cggtttccaccacggaactaacagggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGc < 6:58370‑M1/4‑1 (MQ=255) ggCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCa > 5:354439/1‑149 (MQ=255) cTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCg < 2:106631/147‑1 (MQ=255) tCGGAGAGTTCTGGTGAGGATCGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCGCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGGAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTc < 6:354439/148‑1 (MQ=255) tCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTcc > 6:164989/1‑149 (MQ=255) gACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGc > 7:9854/1‑149 (MQ=255) taacagggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGc < 7:132771‑M1/45‑1 (MQ=255) ttCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTgg < 6:233773/122‑1 (MQ=255) ttCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTgg > 5:233773/1‑122 (MQ=255) agggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTc > 8:132771‑M1/101‑149 (MQ=255) gggaatcccaggcctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTcc > 3:56835‑M1/100‑149 (MQ=255) tGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCgg > 4:91783/1‑149 (MQ=255) gTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTc < 2:340297/143‑1 (MQ=255) gTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTc > 1:340297/1‑143 (MQ=255) gTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCggg < 7:250577/148‑1 (MQ=255) ctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGc > 6:131914‑M1/87‑90 (MQ=255) ctgccaatacaggccaatcggaactgcccccgcaactgtaggtgccgagcctgctccatcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGc < 5:131914‑M1/4‑1 (MQ=255) cGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCCCCGGGTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGt < 2:267029/149‑1 (MQ=255) gACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTgg < 2:214062/149‑1 (MQ=255) aGGCATCGCCGAGCGCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCAt > 7:304166/1‑149 (MQ=255) ggCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATc < 3:130210/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGCTAACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTcc > 1:37231/1‑92 (MQ=255) gCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTcc < 2:37231/91‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGAt < 8:9854/149‑1 (MQ=255) aTCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGAt > 3:343418/1‑149 (MQ=255) gAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCa < 7:102170/149‑1 (MQ=255) aGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAg > 1:260791/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTc > 5:352223/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTc > 4:134741/1‑149 (MQ=255) tGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTa > 6:264082/1‑149 (MQ=255) gCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTAc > 2:104943/1‑148 (MQ=255) gC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCg > 4:91993/1‑149 (MQ=255) aaCACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTc < 6:122167/131‑1 (MQ=255) aaCACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTc > 5:122167/1‑131 (MQ=255) aaCACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCggg < 3:91993/149‑1 (MQ=255) tGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTc < 1:104943/149‑1 (MQ=255) cAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGAt > 3:198874/1‑149 (MQ=255) tCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTgg > 2:138290/1‑149 (MQ=255) tcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTccc > 5:254056‑M1/29‑79 (MQ=255) tcgatgccactgggcctgccgcccgggaAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTccc < 6:254056‑M1/51‑1 (MQ=255) ccGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGc < 3:91783/148‑1 (MQ=255) acacCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCAt > 8:41591/1‑95 (MQ=255) acacCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCAt < 7:41591/95‑1 (MQ=255) cccGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTgg > 5:315139/1‑149 (MQ=255) cgccgGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCACGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTgg > 4:321757/1‑147 (MQ=255) gccgGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAg > 3:237113/1‑149 (MQ=255) cgGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGc < 6:352223/149‑1 (MQ=255) ggTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTgg > 1:131336/1‑148 (MQ=255) ggTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTgg < 3:134741/148‑1 (MQ=255) aTGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTGGGATTcc < 5:164989/149‑1 (MQ=255) tggAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTTGTGCGTCACGGACCTGCTCCGGCCTTCCTTGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTGGGATTccc > 1:293705‑M1/4‑149 (MQ=255) tGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTGGGATTccc < 5:264082/149‑1 (MQ=255) AGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTAtt < 3:145118‑M1/128‑1 (MQ=255) AGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTAtt > 4:145118‑M1/1‑128 (MQ=255) | GTGGCGAAACGGAGCAGCATGCTGGGCGATCTCCTATCGGACAGTTCTGGTGAGGAACGCACGGACAGGCATCGCCGAGCCCCAGCGGGTGGCTGGGGC‑AACACGGATGGCCAATCCCGGACACCCCGCCGGTTGGTGAATGTAGGCCGGCAGGTCTCCTGACTGGTGCGTCACGGCCCGGCTCCGGCCTTCCCGGGCGGCAGGCCCAGTGGCATCGATGGAGCAGGCTCGGCACCTACAGTTGCGGGGGCAGTTCCGATTGGCCTGTATTGGCAGGCCTGGGATTCCC > NC_002947/2764898‑2765186 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |