New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3085575 = | 51 (0.920) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.9% | coding (991/1443 nt) | PP_2694 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 3085615 = | 48 (0.920) | coding (951/1443 nt) | PP_2694 | aldehyde dehydrogenase family protein |
GGTTGATGCGCATGTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTT > NC_002947/3085428‑3085722 | gaatgcgcgctcaacggggccttcttcggcaccgggcagaaatgcaccgcttcgtcacggctgatcgtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGc < 8:136742‑M1/2‑1 (MQ=255) tGATGCGCATGTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTgg > 6:165606/1‑149 (MQ=255) gATGCGCATGTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGgc > 2:231566/1‑149 (MQ=255) cgcgctcaacggggccttcttcggcaccgggcagaaatgcaccgcttcgtcacggctgatcgtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGgc > 6:179352‑M1/143‑148 (MQ=255) tGCGCATGTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGgcgt < 8:288531/149‑1 (MQ=255) gcgcATTGCGTTGCGGCTGTTGATGAACTAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGGTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTGCTGTTCCAGCTGtcgt < 6:169642/148‑1 (MQ=255) gTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAg > 5:183941/1‑149 (MQ=255) cGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGc > 6:179206/1‑148 (MQ=255) tGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTCCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCACGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGATCCACCTGGCGTGCGTCCGCTACCGCGcc > 8:322287/1‑148 (MQ=255) atgaACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGATCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTg > 3:16454/1‑149 (MQ=255) gaACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGcc < 6:172156/141‑1 (MQ=255) gaACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCAATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGcc > 5:172156/1‑141 (MQ=255) ggCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCAGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAg > 7:254007/1‑149 (MQ=255) agaaatgcaccgcttcgtcacggctgatcgtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAg > 7:136742‑M1/111‑149 (MQ=255) aGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCGGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTAc > 4:155598/1‑126 (MQ=255) aGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTAc < 3:155598/126‑1 (MQ=255) ggCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGc > 7:26483/1‑145 (MQ=255) ggCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGc < 8:26483/145‑1 (MQ=255) tagtagCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTAc > 3:313480/1‑116 (MQ=255) tagtagCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTAc < 4:313480/116‑1 (MQ=255) ccATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGgcgtgc < 3:77099/101‑1 (MQ=255) ccATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGgcgtgc > 4:77099/1‑101 (MQ=255) cATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGAcc > 2:4632/1‑149 (MQ=255) tCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCtt < 1:2748/149‑1 (MQ=255) gtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTc < 1:315475‑M1/43‑1 (MQ=255) gtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTc > 2:315475‑M1/82‑124 (MQ=255) cAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGCCCTTGAGCTGgc > 7:248885/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGCTCTCGCCGCCTTCTATCAGGCTGGCTCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTACGCCAGTTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTATCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGgcgc < 8:248885/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATgcgcaggcg > 2:344407/1‑149 (MQ=255) gccgccTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATgcgcaggcgca < 5:179206/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGTCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCGTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 5:258594/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATgg > 7:191026/1‑107 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATgg < 8:191026/107‑1 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 8:211053/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 4:36287/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcg < 1:4632/146‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgacg > 3:305480/1‑147 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgacg > 2:349376/1‑147 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGaa < 7:322287/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCTGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAg < 1:231566/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAg < 4:16454/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGc > 1:152631/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt < 4:210338/149‑1 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt > 3:210338/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt < 1:344407/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATg < 1:349376/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCg > 3:307430/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCg > 3:15264/1‑149 (MQ=255) gggCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCg < 2:152631/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCg < 7:211053/148‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCa < 4:307430/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCTGCTACCGGGCCGATCTGGAAGCCAGCCTCCAGTGCATGGCAGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTCGATGCCGTCTCAg > 5:199591/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGa < 5:165606/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCa < 3:36287/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGc < 8:67313/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGcc > 6:96235/1‑149 (MQ=255) ggCCATGTTCTTTTCCCGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGt < 4:15264/148‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCg > 8:114168/1‑105 (MQ=255) ttCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCg < 7:114168/105‑1 (MQ=255) aGCTTGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCAttt < 6:183941/149‑1 (MQ=255) | GGTTGATGCGCATGTCGTTGCGGCTGTTGATGAACAAGGCAGGGCGCATGTAGTAGCCATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTT > NC_002947/3085428‑3085722 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |