New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3085575 = | 51 (0.920) | 3 (0.060) | 3/240 | NT | 5.9% | coding (991/1443 nt) | PP_2694 | aldehyde dehydrogenase family protein |
? | NC_002947 | 3085615 = | 48 (0.920) | coding (951/1443 nt) | PP_2694 | aldehyde dehydrogenase family protein |
CATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGTTGAGCGCGCATTC > NC_002947/3085485‑3085761 | cATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGAcc > 2:4632/1‑149 (MQ=255) tCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCtt < 1:2748/149‑1 (MQ=255) gtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTc < 1:315475‑M1/43‑1 (MQ=255) gtctgcgacggcatccacgaccgcttcgtcgaggcgctgcgcctgcgcatgcgccagctcaaggtcggccatgcactggagGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTc > 2:315475‑M1/82‑124 (MQ=255) cAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGCCCTTGAGCTGgc > 7:248885/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGGCTCTCGCCGCCTTCTATCAGGCTGGCTCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTACGCCAGTTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTATCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGgcgc < 8:248885/149‑1 (MQ=255) tCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATgcgcaggcg > 2:344407/1‑149 (MQ=255) gccgccTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATgcgcaggcgca < 5:179206/149‑1 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGTCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCGTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 5:258594/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATgg > 7:191026/1‑107 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATgg < 8:191026/107‑1 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 8:211053/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgac > 4:36287/1‑148 (MQ=255) tCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcg < 1:4632/146‑1 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgacg > 2:349376/1‑147 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTcgacg > 3:305480/1‑147 (MQ=255) aGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGaa < 7:322287/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCTGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAg < 1:231566/149‑1 (MQ=255) gggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAg < 4:16454/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGc > 1:152631/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt > 3:210338/1‑149 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt < 1:344407/149‑1 (MQ=255) gcCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGt < 4:210338/149‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATg < 1:349376/148‑1 (MQ=255) ccTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCg > 3:15264/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCg > 3:307430/1‑149 (MQ=255) gggCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCg < 2:152631/149‑1 (MQ=255) ggCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCg < 7:211053/148‑1 (MQ=255) gCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCa < 4:307430/149‑1 (MQ=255) ccAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCTGCTACCGGGCCGATCTGGAAGCCAGCCTCCAGTGCATGGCAGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTCGATGCCGTCTCAg > 5:199591/1‑149 (MQ=255) ttGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGa < 5:165606/149‑1 (MQ=255) cAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCa < 3:36287/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGc < 8:67313/149‑1 (MQ=255) gTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGcc > 6:96235/1‑149 (MQ=255) ggCCATGTTCTTTTCCCGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGt < 4:15264/148‑1 (MQ=255) ttCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCg > 8:114168/1‑105 (MQ=255) ttCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCg < 7:114168/105‑1 (MQ=255) gaggctggcgtccagatcggcccggtagctgacgcacgccagcCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGAc < 1:315475‑M2/81‑1 (MQ=255) gaggctggcgtccagatcggcccggtagctgacgcacgccagcCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGAc > 2:315475‑M2/44‑124 (MQ=255) aGCTTGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCAttt < 6:183941/149‑1 (MQ=255) ctggcgtccagatcggcccggtagctgacgcacgccagcCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCt > 7:136742‑M2/40‑149 (MQ=255) GTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCg < 3:735‑M1/149‑1 (MQ=255) cgtCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGt < 6:258594/148‑1 (MQ=255) cTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCg > 1:318701/1‑146 (MQ=255) cGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAgg < 4:305480/149‑1 (MQ=255) cGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAgg > 7:108520/1‑149 (MQ=255) gggCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGc > 4:6997/1‑149 (MQ=255) ggCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATc < 4:278487/104‑1 (MQ=255) ggCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATc > 3:278487/1‑104 (MQ=255) ggCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGc > 3:122573/1‑131 (MQ=255) ggCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGc < 4:122573/131‑1 (MQ=255) cGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGt < 6:226888/118‑1 (MQ=255) cGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGt > 5:226888/1‑118 (MQ=255) cGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCg > 6:85893/1‑149 (MQ=255) agcTGGACGCCAGCCTCCAGTGCAGGGCCGACCTTGCGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGCAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCTGACGATCATCCTTGACGAAGCGGTGCATTCCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGtt < 6:199591/147‑1 (MQ=255) ggACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGTTGAgc > 7:68716/1‑149 (MQ=255) ggACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACATTGAGCTGGCGCATTCGCAGGAGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGAGGTGCATTTCTGCCCGGTGACGAAGAAGGCCCCTTTGAgc > 6:370532/1‑149 (MQ=255) gccagcCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGTTGAgcgcg > 6:179352‑M2/7‑148 (MQ=255) gcCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGTTGAGCGCGCATTc < 8:136742‑M2/147‑1 (MQ=255) | CATCGCAGGCCAGTTGCAGGCGCTCGCCGCCTTCTATCAGGGTGGCGCCTTCGGCCTGGGCCAGTTGCAGGTAGGCCAGGTTCTGTTCCAGCTGGCGTGCGTCAGCTACCGGGCCGATCTGGACGCCAGCCTCCAGTGCATGGCCGACCTTGAGCTGGCGCATGCGCAGGCGCAGCGCCTCGACGAAGCGGTCGTGGATGCCGTCGCAGACGATCAGCCGTGACGAAGCGGTGCATTTCTGCCCGGTGCCGAAGAAGGCCCCGTTGAGCGCGCATTC > NC_002947/3085485‑3085761 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |