New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3610726 = | 48 (0.870) | 4 (0.080) | 4/238 | NT | 8.1% | coding (2958/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A |
? | NC_002947 | 3610778 = | 46 (0.890) | coding (2906/3396 nt) | mcoA | Mn(II) copper oxidase A |
CGCCACTGCTGGGGTGACGGCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGTTGGCCACGACAGG > NC_002947/3610579‑3610872 | caacgttccgcaccaaaaccgatgacgacgatgacgacccggccaacaaaccacctgtcgtggccaacgacagtgccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccg < 1:186135‑M1/1‑1 (MQ=255) acgttccgcaccaaaaccgatgacgacgatgacgacccggccaacaaaccacctgtcgtggccaacgacagtgccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCt < 2:37021‑M1/3‑1 (MQ=255) ctgctgGGGTGACGGCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACg < 5:206452/149‑1 (MQ=255) ctgGGGTGACGGCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCGCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTa > 8:72801/1‑149 (MQ=255) gcaccaaaaccgatgacgacgatgacgacccggccaacaaaccacctgtcgtggccaacgacagtgccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCTCACGGt < 7:172646‑M1/9‑1 (MQ=255) tGACGGCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTgg > 8:50876/1‑149 (MQ=255) ggCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCg > 6:103580/1‑148 (MQ=255) gATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGt > 1:133263/1‑149 (MQ=255) gATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGt > 5:150669/1‑149 (MQ=255) tGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCGCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTcc < 7:72801/149‑1 (MQ=255) gACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCCAGTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCggc > 1:259078/1‑149 (MQ=255) aCCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGTGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCGCTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCggct < 1:30125/148‑1 (MQ=255) ccGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGCCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCggctgg < 6:150669/149‑1 (MQ=255) cGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCATGGTACCCTGGCCGGAGTCCggctggc > 2:17830/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCggctggct > 1:179732/1‑148 (MQ=255) ggCCGGGGTAACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGa < 5:337216/149‑1 (MQ=255) gggTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCATGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCg < 1:17830/149‑1 (MQ=255) ggTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCgg < 7:256829/149‑1 (MQ=255) ccGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGGCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGccc > 7:336006/1‑149 (MQ=255) aacaaaccacctgtcgtggccaacgacagtgccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGAc < 6:123182‑M1/45‑1 (MQ=255) aaaccacctgtcgtggccaacgacagtgccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGt > 5:123182‑M1/102‑149 (MQ=255) ggCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGc < 2:133263/148‑1 (MQ=255) ccccTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTa > 4:248628/1‑149 (MQ=255) cccTTGGAATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTAc > 7:290070/1‑149 (MQ=255) ttGGTAGCAGGCGCC‑GTGTAATTGCAGCTGGCAGTGATCGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTAAGTCAGTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGtt < 8:336006/149‑1 (MQ=255) aTCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGt > 8:172646/1‑149 (MQ=255) gcC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTc < 2:179732/149‑1 (MQ=255) cc‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCg < 5:103580/149‑1 (MQ=255) ccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAg < 5:287478‑M1/51‑1 (MQ=255) ccgcaacgactgcaggcaagccgatcaccctgaacgtgctggccaacgacagcgacccggacggcaacgtaccGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAg > 6:287478‑M1/74‑124 (MQ=255) tAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTc > 1:55751/1‑149 (MQ=255) tAATGGAAGCCGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGGAGCGGGGGGCCTGTACGGCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGGGAGCGGTACGTTGCCGTCCTGGTCGCTGTc < 8:218849/149‑1 (MQ=255) aTTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCg < 2:259078/148‑1 (MQ=255) ttGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGtt > 6:116200/1‑149 (MQ=255) gAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTg < 3:112438/148‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCg < 4:180481/133‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCg > 3:180481/1‑133 (MQ=255) tGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAg > 5:107732/1‑148 (MQ=255) aCGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAg < 8:290070/148‑1 (MQ=255) cGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAggg > 2:186135/1‑149 (MQ=255) cGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGa > 5:370215/1‑149 (MQ=255) cGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGc < 6:370215/149‑1 (MQ=255) gACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCt > 1:37021/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTg > 3:111572/1‑149 (MQ=255) ggtggggtgTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGc < 4:172818/120‑1 (MQ=255) ggtggggtgTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGc > 3:172818/1‑120 (MQ=255) gtgtACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGc > 1:284377/1‑149 (MQ=255) gtgtACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGc > 2:103434/1‑149 (MQ=255) tACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCgg > 8:329111/1‑148 (MQ=255) tCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTg < 7:329111/149‑1 (MQ=255) aCTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTc < 6:107732/149‑1 (MQ=255) cTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCg > 8:180863/1‑149 (MQ=255) gtgCTGCCGTCCGTGCTCACGCTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGGGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGtt < 4:269460/149‑1 (MQ=255) tgctgcCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGTTg < 5:116200/149‑1 (MQ=255) tgcggcCGTCCGTGCTCCCGGTACCCGGGCCGGAGTGCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGtt < 4:111572/148‑1 (MQ=255) gtGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGTTGGCCACGACAgg < 2:284377/149‑1 (MQ=255) | CGCCACTGCTGGGGTGACGGCGATGCTGACCGTGGCCGGGGTCACCGAGTCGGCCCCCTTGGTATCACGCGCC‑GTGTAATTGAAGCTGGCCGTGAACGGCGTGGCGACCGTAGCGGGTGGGGTGTACGTCACTGTGCTGCCGTCCGTGCTCACGGTACCCTGGCCGGAGTCCGGCTGGCTGAGGCCGGTGACCGTGAGCGGTACGTTGCCGTCCGGGTCGCTGTCGTTGGCCAGCACGTTCAGGGTGATCGGCTTGCCTGCAGTCGTTGCGGCACTGTCGTTGGCCACGACAGG > NC_002947/3610579‑3610872 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |