New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4847141 = | 48 (0.870) | 3 (0.060) | 3/244 | NT | 6.3% | coding (1891/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
? | NC_002947 | 4847177 = | 43 (0.810) | coding (1927/2475 nt) | PP_4261 | cation‑transporting P‑type ATPase |
GCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTGGCGGCCTGCGCCCGGATGACAAA > NC_002947/4846996‑4847281 | gcgcATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGccc > 6:138573/1‑149 (MQ=255) ccttgcgcccgtcagcctgcagggctttcaggcggtccagtttgtcatccgggcgcaggccgccaatggcctggtcgatacccagctgcgcggccacttcggcaaccatcggcgagctgtcgcccgacagcagcagggtgtgccaGccc > 4:208679‑M1/146‑149 (MQ=255) cgcATTGGTCGGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGcccc < 6:25968/149‑1 (MQ=255) ttgcgcccgtcagcctgcagggctttcaggcggtccagtttgtcatccgggcgcaggccgccaatggcctggtcgatacccagctgcgcggccacttcggcaaccatcggcgagctgtcgcccgacagcagcagggtgtgccaGCCCCg < 6:184041‑M1/6‑1 (MQ=255) cATTGCTCCGCCTCCCTTCGTCTGCGCCTTGAGTCGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCgg < 8:171405/149‑1 (MQ=255) aGGCTACCTTCGTCTGCGCCTGGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTc < 5:240164/149‑1 (MQ=255) ccTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGctgc < 5:138573/148‑1 (MQ=255) gTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCaa < 6:153775/149‑1 (MQ=255) cgcCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGgcgc < 3:144593/149‑1 (MQ=255) ttGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCACGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCgggg > 3:250671/1‑149 (MQ=255) ggtccagtttggcatccgggcgcaggccgccactggcctggtcgatacccagctgcgcggccacttcggcaaccatcggcgagctgtcgcccgacagcagcagggtgtgccaGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCt > 8:292491‑M1/113‑149 (MQ=255) gtggtgCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg < 1:135451/149‑1 (MQ=255) gtggtgCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg < 3:195180/149‑1 (MQ=255) cGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACAcc < 1:208047/149‑1 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACAccc > 5:213534/1‑149 (MQ=255) ggAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACAccc < 3:318424/149‑1 (MQ=255) gAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCct > 3:202591/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCctgct < 5:166904/149‑1 (MQ=255) cccGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCctgctgct > 5:184041/1‑149 (MQ=255) ccGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCctgctgctg > 5:293499/1‑149 (MQ=255) cTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCg < 8:298035/149‑1 (MQ=255) gTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGcac > 2:306722/1‑132 (MQ=255) tACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGc < 1:2540/149‑1 (MQ=255) cccGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg < 4:12449/126‑1 (MQ=255) cccGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg > 3:12449/1‑126 (MQ=255) cccGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGa < 4:190874/149‑1 (MQ=255) ccGAGCCGCACGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGAc < 4:250671/149‑1 (MQ=255) cgccaatggcctggtcgatacccagctgcgcggccacttcggcaaccatcggcgagctgtcgcccgacagcagcagggtgtgccaGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGc > 4:224508‑M1/86‑121 (MQ=255) cgccaatggcctggtcgatacccagctgcgcggccacttcggcaaccatcggcgagctgtcgcccgacagcagcagggtgtgccaGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGc < 3:224508‑M1/36‑1 (MQ=255) cGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACa < 6:293499/149‑1 (MQ=255) gAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAg > 2:86663/1‑149 (MQ=255) cgaaccaggCCAGTGGCCCCTGGCGGTCGCCCAGCAGCAGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGa > 7:196617/8‑144 (MQ=25) cgaaccaggCCAGTGGCCCCTGGCGGTCGCCCAGCAGCAGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGa < 8:196617/137‑1 (MQ=25) cgGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGa < 6:213534/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATg < 4:12081/149‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATg < 3:104101/149‑1 (MQ=255) tGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGc > 5:276661/1‑149 (MQ=255) ctgctgGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGaa < 7:166500/147‑1 (MQ=255) gggCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTgg < 8:168740/146‑1 (MQ=255) gggCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTgg > 7:168740/1‑146 (MQ=255) gACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCcgcg > 5:284005/1‑147 (MQ=255) cGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCt > 5:12778/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAgg < 8:295233/148‑1 (MQ=255) ccTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGc > 5:252178/1‑148 (MQ=255) tGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGccgc > 5:78700/1‑147 (MQ=255) ggTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCAtt > 2:56579/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATc < 5:199942/136‑1 (MQ=255) gTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATc > 6:199942/1‑136 (MQ=255) gTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTg > 6:156143/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTggcg < 4:202591/148‑1 (MQ=255) ccTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTGGCGGcc > 6:180152/1‑149 (MQ=255) tGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg < 1:294302/58‑1 (MQ=255) tGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTgg > 2:294302/1‑58 (MQ=255) cgcgACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTGGCGGCCTGCGCCCGGATGAc < 1:86663/147‑1 (MQ=255) gcgACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCTGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTGGCGGCCTGCGCCCGGATGACaaa > 7:114271/1‑149 (MQ=255) GCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTg > 8:164592‑M1/1‑118 (MQ=255) GCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTg < 7:164592‑M1/118‑1 (MQ=255) | GCGCATTGGTCAGGCTACCTTCGTCTGCGCCTTGAGTGGTGCGGAAATCCCCGCTGTACCCGAGCCGCGCGGCCAGTGGCTGCTGCTGGGCGACCGCCAGGGGCCACTGGCCTGGTTCGGCCTGGATGACCGCCTGCGCGACGATGCCCCGGCCCTGCTCGCTGCCTGCAAGGCGCGGGGCTGGCACACCCTGCTGCTGTCGGGCGACAGCTCGCCGATGGTTGCCGAAGTGGCCGCGCAGCTGGGTATCGACCAGGCCATTGGCGGCCTGCGCCCGGATGACAAA > NC_002947/4846996‑4847281 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |