New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5572520 | 34 (0.610) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 7.1% | coding (245/543 nt) | orn | oligoribonuclease |
? | NC_002947 | = 5572559 | 46 (0.880) | coding (206/543 nt) | orn | oligoribonuclease |
TTGCGGTAGTGGAAGTAGTTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTC > NC_002947/5572376‑5572668 | ttGCGGTAGTGGAAGTAGTTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCAt < 3:254103/149‑1 (MQ=255) gAAGTAGTTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTg < 5:186312/148‑1 (MQ=255) gtTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTcgc > 5:301903/1‑149 (MQ=255) gtTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGAGCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTcgc < 3:148409/149‑1 (MQ=255) cAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCTGGTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGATCTCGCGTAcg > 1:84557/1‑149 (MQ=255) ttGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTg < 2:84557/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCc > 2:238520‑M2/1‑148 (MQ=255) gTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCccgaag < 6:119727‑M2/149‑7 (MQ=255) gagGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagcc < 7:59873‑M1/148‑48 (MQ=255) ggAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGct < 5:128144/115‑1 (MQ=255) ggAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGct > 6:128144/1‑115 (MQ=255) gAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTcgc > 4:101357/1‑119 (MQ=255) gAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTcgc < 3:101357/119‑1 (MQ=255) aaCGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATgg < 6:301903/149‑1 (MQ=255) acgacgATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTTACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATggg < 8:250605/149‑1 (MQ=255) cgacgaTCGTGGCAGATGCT‑GTTGCCTCAGATCGGGGTCTTGCCTTTAGTCAGCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGGCTGTGTCTCGGCTTCGGCCATGGTGTCCTTGCTGTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGt < 8:188154/149‑1 (MQ=255) gacgaTCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTg > 3:288378/1‑149 (MQ=255) gacgaTCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTg > 8:88005/1‑149 (MQ=255) aTCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCggg > 3:107643/1‑149 (MQ=255) cggCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGtt > 5:71344/2‑149 (MQ=255) ggCAGATGCT‑GTTGCCGCAGGTCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTc > 3:20581/1‑149 (MQ=255) gCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGtt < 5:267809/147‑1 (MQ=255) gTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagccgaggcacagaccatc < 3:148435‑M1/136‑63 (MQ=255) gTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagccgaggcacagaccatc > 4:148435‑M1/1‑74 (MQ=255) cGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATgcgc > 2:8053/1‑149 (MQ=255) gATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCa < 5:119727/149‑1 (MQ=255) aTCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAg < 4:288378/149‑1 (MQ=255) ccTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACt > 6:177301/1‑149 (MQ=255) cTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTcc > 3:61644/1‑125 (MQ=255) cTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTcc < 4:61644/125‑1 (MQ=255) cTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtg > 1:147526/1‑149 (MQ=255) cTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCACTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtg > 1:11143/1‑149 (MQ=255) ttAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtgtg > 3:87385/1‑149 (MQ=255) tAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACtgt < 4:20581/147‑1 (MQ=255) gCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTgtggtg > 3:6599/1‑148 (MQ=255) aCCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGAt > 8:314454/1‑149 (MQ=255) tCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCAc > 1:206639/1‑149 (MQ=255) gATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCccgaagccgaggcacagaccatcgccttcctcgagcagtgggtgcctaaaggcaagtcgccgatctgcggcaac > 4:148435‑M2/1‑62 (MQ=255) gATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCccgaagccgaggcacagaccatcgccttcctcgagcagtgggtgcctaaaggcaagtcgccgatctgcggcaac < 3:148435‑M2/136‑75 (MQ=255) tGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGc > 4:126604/1‑148 (MQ=255) ggCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCccgaagccgaggcacagaccatcgccttcctcgagcagtgggtgcctaaaggcaagtcgccgatctgcggcaacagcatctgccaggatcgtcgtttcctc < 7:59873‑M2/148‑102 (MQ=255) ggCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCt > 3:201853/1‑149 (MQ=255) cTTCGGggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagccgaggcacagaccatcgccttcctcgagcagtgggtgcctaaaggcaagtcgccgatctgcggcaacagcatctgccaggatcgtcgtttcctctac < 6:119727‑M1/149‑144 (MQ=255) cTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCg < 4:201853/149‑1 (MQ=255) ttCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTc > 3:173328/1‑96 (MQ=255) ttCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTc < 4:173328/96‑1 (MQ=255) ttCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACAATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGc > 2:65655/1‑149 (MQ=255) cGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCt < 3:126604/148‑1 (MQ=255) cGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCt < 4:87385/148‑1 (MQ=255) gggctgacccagcgcgtacgcgagagcaaggtcagcatggccgaagccgaggcacagaccatcgccttcctcgagcagtgggtgcctaaaggcaagtcgccgatctgcggcaacagcatctgccaggatcgtcgtttcctctaccgcca > 2:238520‑M1/1‑1 (MQ=255) gCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTc < 4:107643/149‑1 (MQ=255) | TTGCGGTAGTGGAAGTAGTTTTCCAGGTTGCGCATGTGGCGGTAGAGGAAACGACGATCCTGGCAGATGCT‑GTTGCCGCAGATCGGCGACTTGCCTTTAGGCACCCACTGCTCGAGGAAGGCGATGGTCTGTGCCTCGGCTTCGGCCATGCTGACCTTGCTCTCGCGTACGCGCTGGGTCAGCCCCGAAGCACCATGGGTGCGGGTGTTCCACTCGTCCATGCGCGCCAGCACTTCGTCACTGTGGTGGATGGCGATCACCGGCCCTTCGGCCAAGGTATTGAGCTCGCTGTC > NC_002947/5572376‑5572668 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |