New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 63722 = | 56 (1.010) | 5 (0.100) | 5/240 | NT | 10.1% | coding (741/858 nt) | PP_0054 | membrane protein |
? | NC_002947 | 63778 = | 37 (0.710) | coding (797/858 nt) | PP_0054 | membrane protein |
GGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTCCCACACCACCCGCAGGCGCACAGAC > NC_002947/63642‑63906 | ggCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTgg > 8:326163/1‑148 (MQ=255) gCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCATGGCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTgg > 1:229273/1‑148 (MQ=255) aGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAgg > 3:27456/1‑149 (MQ=255) tgtgGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCGCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGtt < 2:273143/149‑1 (MQ=255) tgGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTg < 3:52517/148‑1 (MQ=255) tCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGcc > 5:363543/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCt < 2:229273/149‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGcc > 6:300184/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGcc < 3:307699/149‑1 (MQ=255) cAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAGCCCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGcc < 1:281951/149‑1 (MQ=255) ggCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGc < 4:125644/149‑1 (MQ=255) aT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCtgtt < 8:29434/137‑1 (MQ=255) aT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCtgtt > 7:29434/1‑137 (MQ=255) aT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCGCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCaa < 5:300184/149‑1 (MQ=255) t‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAg < 1:60860/149‑1 (MQ=255) cACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCATCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAgg < 5:251181/148‑1 (MQ=255) aCTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGct > 4:47449/1‑149 (MQ=255) cTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGctc < 3:47449/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCTGCGGATTGCTGGGTCTGCTGCTGGGGGGGCCTTTGGCAT‑CCAGATTGGGCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGTCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCg < 4:27456/148‑1 (MQ=255) gTTGGCGCCCCGTTTGCCGGCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGTGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCgg < 2:39300/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGc < 6:363543/149‑1 (MQ=255) ggCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTCGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCt < 7:326163/148‑1 (MQ=255) gcgcCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTg < 6:235490/98‑1 (MQ=255) cgcCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGc < 2:258003/149‑1 (MQ=255) cccGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGc < 3:215679/132‑1 (MQ=255) cccGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGc > 4:215679/1‑132 (MQ=255) cGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTc < 4:232894/149‑1 (MQ=255) acggggCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGt < 8:94778/145‑1 (MQ=255) aGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCcgcg > 4:273256/1‑149 (MQ=255) ggTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAAc < 6:204377/148‑1 (MQ=255) tctgctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTc < 5:231749‑M2/77‑1 (MQ=255) tctgctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTc > 6:231749‑M2/57‑133 (MQ=255) gctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcagc > 5:130691‑M2/54‑149 (MQ=255) CTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcag < 6:114830‑M1/147‑1 (MQ=255) ctgcagacgcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcag > 1:250776‑M2/53‑147 (MQ=255) TGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcagcag < 6:234983‑M1/149‑1 (MQ=255) CTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCcagcag > 3:273256‑M1/1‑147 (MQ=255) gcgGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGATTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCAGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTAGGCCGCGCACAACGCCAGCAGCTAGTcc > 3:263759/1‑149 (MQ=255) gcggcccggccaatctggctgccaaaggccgcgccagcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTcc < 6:130691‑M2/105‑1 (MQ=255) cTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTCCCacac < 5:114830/149‑1 (MQ=255) tttGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTCCCAcccc > 4:104116/1‑149 (MQ=255) ccAGATTGGCCGGGCCGCGGCTGCAGCAGATGTTTGCCGGGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTATCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTGCCACACCACCCGCAg < 4:263759/149‑1 (MQ=255) gATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAAc > 5:289802/1‑117 (MQ=255) gATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAAc < 6:289802/117‑1 (MQ=255) cgggccgCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTCCCACACCACCCGCAGGCGCACAGAc < 5:234983/149‑1 (MQ=255) gcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTcc < 3:343530‑M2/105‑1 (MQ=255) gcagcagaTGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCAGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTcc > 4:343530‑M2/9‑113 (MQ=255) | GGCAGTGTGGTCAGCGCCAGCCTTGCGGGCGTCAT‑GCACTGGCAGGTTGGCGCCCCGTTTGCCGTCGGCGCAGTGCTCGGTCTGCTGCTGGCGCGGCCTTTGGCAG‑CCAGATTGGCCGGGCCGCGTCTGCAGCAGATGTTTGCCGTGGCAGGTTGGGCCGCTGCCCTGTTGTTGGCCGGCAAGGCTCTACTCGGCTAGCAACTCGCTTTGTTCGGCCGCGCACAACGCCAGCAGGTAGTCCCACACCACCCGCAGGCGCACAGAC > NC_002947/63642‑63906 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |