New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 817844 | 44 (0.790) | 5 (0.090) | 4/246 | NT | 10.5% | coding (324/951 nt) | PP_0703 | transmembrane sensor |
? | NC_002947 | = 817882 | 43 (0.810) | coding (286/951 nt) | PP_0703 | transmembrane sensor |
GCGCTGTAGTGCAAGTCGATGGCACTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTCATCACCCAGATTACTGACTCGCTGCCAGGCC > NC_002947/817734‑818030 | gcgcTGTAGTGCAAGTCGATGGCACTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGcccagcccag < 3:248705/149‑1 (MQ=255) tGTAGTGCAAGTCGATGGCACTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGgctg < 7:209762‑M2/149‑5 (MQ=255) aGTCGATGGCACTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACg < 8:209762/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGcc < 1:299101/149‑1 (MQ=255) gCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGcccc < 4:215392/147‑1 (MQ=255) ggTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGc > 1:164307/1‑148 (MQ=255) tGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCGGCAACTTCAggtg > 3:332611/1‑149 (MQ=255) cAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACgg < 8:286388/122‑1 (MQ=255) cAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACgg > 7:286388/1‑122 (MQ=255) gACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTcc > 4:122428/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTg > 4:92423/1‑149 (MQ=255) ggCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTg > 2:173789/1‑149 (MQ=255) ccGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAg < 8:175605/134‑1 (MQ=255) ccGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAg > 7:175605/1‑134 (MQ=255) gTCACTGCCTTGCTATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCggctgg < 3:109415/149‑1 (MQ=255) gTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCGGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCggctgg < 4:332611/149‑1 (MQ=255) gTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCggctgg > 2:73617/1‑149 (MQ=255) cACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCggctggct > 3:71564/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCTTTGGCGCCGTTGGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTgg < 8:163833/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTgg < 3:122428/149‑1 (MQ=255) cATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGcag < 2:164307/149‑3 (MQ=255) ttCTCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCTGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCACAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCa < 5:187261/149‑1 (MQ=255) cGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAg < 2:205871/148‑1 (MQ=255) cTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTg > 8:137937/1‑149 (MQ=255) cAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCgg < 3:92423/149‑1 (MQ=255) tGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCACGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGt > 2:319472/1‑120 (MQ=255) tGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCACGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGt < 1:319472/120‑1 (MQ=255) cTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAg < 7:137937/149‑1 (MQ=255) tGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAgg > 6:66415/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCt > 4:78702/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTg < 8:70957/149‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGgctgctggccgacaccagcactgccacaggcgaacggcgccaatggcaaggcagtgacggcagccgtctgcagctcaacaccgccagtgccatcgacttgca < 1:288087‑M2/149‑103 (MQ=255) gCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTggg > 3:179794/1‑149 (MQ=255) ccAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGgctgctggccgacaccagcactgccacaggcgaacggcgccaatggcaaggcagtgacggcagccgtctgcagctcaacaccgccagtgccatcgacttgcac < 4:234130‑M2/149‑104 (MQ=255) ccAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGgctgctggccgacaccagcactgccacaggcgaacggcgccaatggcaaggcagtgacggcagccgtctgcagctcaacaccgccagtgccatcgacttgcac < 5:28646‑M2/149‑104 (MQ=255) agcagcTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAg < 3:78702/149‑1 (MQ=255) gcagcTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGgctgctggccgacaacagcactgccacaggcgaacggcgccaatggcaaggcagtgacggcagccggctgcagatcaacaccgccagtgccatcgacttgcacta < 4:247439‑M2/148‑106 (MQ=255) gCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATtcat > 7:43790/1‑149 (MQ=255) cTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTggg < 4:251336/130‑1 (MQ=255) cTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTggg > 3:251336/1‑130 (MQ=255) gcgGCCCAGCCCAGgctgctggccgacaccagcactgccacaggcgaacggcgccaatggcaaggcagtgacggcagccgtctgcagctcaacaccgccagtgccatcgacttgcactacagcgcggagcaacgccagctgaaactgat > 3:234130‑M2/1‑14 (MQ=255) cccagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGGCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTAATCACCCAGCTTACTGACTCGc > 4:34617/1‑149 (MQ=255) ccagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGc > 3:187419/1‑120 (MQ=255) ccagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGc < 4:187419/120‑1 (MQ=255) ccagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTCATCACCCAGATTACTGACt > 2:92675/1‑145 (MQ=255) ccagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTCATCACCCAGATTACTGACt < 1:92675/145‑1 (MQ=255) cagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCg > 2:344729/1‑117 (MQ=255) cagcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCg < 1:344729/117‑1 (MQ=255) gcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTg < 2:2399/106‑1 (MQ=255) gcccagGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTg > 1:2399/1‑106 (MQ=255) ggCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTCATCACCCAGATTACTGACTCGCTgccaggcc < 4:179794/149‑1 (MQ=255) | GCGCTGTAGTGCAAGTCGATGGCACTGGCGGTGTTGAGCTGCAGACGGCTGCCGTCACTGCCTTGCCATTGGCGCCGTTCGCCTGTGGCAGTGCTGGTGTCGGCCAGCAGCTGTGGCAGGCCTAGCGGTTCGCGCGCGGCCCAGCCCAGGCTGCCGCCCACGGCCAACAGCCCCAGCAACTTCAGGTGGTCCCTGCGGCTGGCTTTTGGGTGCTGGCTAGCGTCCAGGGTGCGCCGGCTCAGGTCCTTGGGCAGCCCGGCCAATTCATCACCCAGATTACTGACTCGCTGCCAGGCC > NC_002947/817734‑818030 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |