New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2505864 = | 107 (1.930) | 8 (0.160) | 8/238 | NT | 7.5% | coding (464/1107 nt) | PP_2199 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2505904 = | 97 (1.890) | coding (504/1107 nt) | PP_2199 | hypothetical protein |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TCAGCGACATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGCCCGGAA > NC_002947/2505756‑2506051 | gcctgccccgcctcggctacccaatagcgctgccgcgcctcaccggggtgcaggcggtgatcctgctcgcctgctaccggcaatacctgcatgtgacgaccaatggcgGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATcgcc > 8:243815‑M1/109‑149 (MQ=255) aGCGACATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGACACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATcgccgc > 4:137438/1‑149 (MQ=255) gCGACATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATcgccgc > 7:245429/1‑148 (MQ=255) cGACATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCa > 6:52396/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑g < 5:362854/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑gg > 6:236818/1‑149 (MQ=255) aTCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑gg < 5:50009/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCAAACGAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGTGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑gg < 3:36020/149‑1 (MQ=255) tCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑Ggt > 3:152036/1‑149 (MQ=255) aTGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTcac < 4:111417/149‑1 (MQ=255) atcatcCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATg > 7:121669/1‑147 (MQ=255) tcCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTa > 8:256593/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTAt < 8:121669/148‑1 (MQ=255) gCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAg > 7:22885/1‑140 (MQ=255) ccGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAATCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCgg > 6:199373/1‑149 (MQ=255) ttCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAgg < 6:308310/149‑1 (MQ=255) tCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAgg < 8:153461/148‑1 (MQ=255) cAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGc > 1:230732/1‑147 (MQ=255) ggTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAg > 6:235878/1‑148 (MQ=255) ggTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGc < 5:235878/149‑1 (MQ=255) gggtgcaggcggtgatcctgctcgcctgctaccggcaatacctgcatgtgacgaccaatggcgGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATcgccg < 4:174626‑M1/42‑1 (MQ=255) gggtgcaggcggtgatcctgctcgcctgctaccggcaatacctgcatgtgacgaccaatggcgGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATcgccg > 3:174626‑M1/64‑105 (MQ=255) aTTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAAGCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCTCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCAATCGCCGCCATT‑GTTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAg < 1:143250/148‑1 (MQ=255) ttGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAgg < 2:165475/148‑1 (MQ=255) ttCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATc < 4:185079/148‑1 (MQ=255) ttCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTAATGCCGGTAGCAGGCTAGCAGGATCa > 4:252648/1‑149 (MQ=255) cGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCAcc > 6:49013/1‑149 (MQ=255) gATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCATCCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCg < 3:228227/149‑1 (MQ=255) gATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCAcc < 5:49013/148‑1 (MQ=255) gATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCg > 4:108477/1‑149 (MQ=255) aTCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGc > 7:78730/1‑149 (MQ=255) cGTGGTGATCGTCGCCACGTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTTCCGCGATGGCTTCAACCGAGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGGAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCAcc < 4:80381/149‑1 (MQ=255) tgATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTca > 4:126657/1‑97 (MQ=255) tgATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTca < 3:126657/97‑1 (MQ=255) aTCGTCGCCACCTCCAATCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGa < 5:199373/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAg < 1:330389/149‑1 (MQ=255) tcgtcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAg > 2:68993/1‑149 (MQ=255) tcgtcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAg > 8:44395/1‑149 (MQ=255) gtcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGACGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGgc > 7:293095/1‑149 (MQ=255) tcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCg > 4:26315/1‑141 (MQ=255) tcgCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCg < 3:26315/141‑1 (MQ=255) ccACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCGCATGCAGGTATTGCCGGTAGCAg > 1:216842/1‑111 (MQ=255) ccACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCGCATGCAGGTATTGCCGGTAGCAg < 2:216842/111‑1 (MQ=255) aCCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCg < 7:210479/136‑1 (MQ=255) aCCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCg > 8:210479/1‑136 (MQ=255) cTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgc > 1:152517/1‑149 (MQ=255) cTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgc > 7:74565/1‑149 (MQ=255) tCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgcg > 4:75465/1‑149 (MQ=255) ccAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgcgc > 5:287024/1‑149 (MQ=255) cAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTAtt < 6:106235/148‑1 (MQ=255) aCCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAg > 5:232253/1‑149 (MQ=255) cccGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATTGGGGCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAg > 1:286460/1‑149 (MQ=255) ccGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGcc > 8:145311/1‑149 (MQ=255) cGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCa > 2:160534/1‑75 (MQ=255) cGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCa < 1:160534/75‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGcc > 7:69485/1‑148 (MQ=255) gAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGcc > 4:200927/1‑147 (MQ=255) ctctACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCggg < 3:81484/149‑1 (MQ=255) cggcgatggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCAccc > 3:174626‑M2/43‑105 (MQ=255) cggcgatggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCAccc < 4:174626‑M2/63‑1 (MQ=255) ccGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAg < 1:233321/148‑1 (MQ=255) ccGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAg < 6:287024/148‑1 (MQ=255) ccGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCCGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAgg > 2:176379/1‑149 (MQ=255) ggcgatggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgc > 8:243815‑M2/42‑149 (MQ=255) cgatggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATAGGGTAGCCGAGGc < 7:191985‑M2/99‑1 (MQ=255) cgatggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATAGGGTAGCCGAGGc > 8:191985‑M2/40‑138 (MQ=255) CGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgcca > 4:152036‑M1/1‑149 (MQ=255) CGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgcca > 3:75465‑M1/1‑149 (MQ=255) GATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgccag > 7:52149‑M1/1‑149 (MQ=255) atggctggcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCgg > 2:211997‑M2/38‑138 (MQ=255) ATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgccagc > 4:99022‑M1/1‑149 (MQ=255) TGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCAGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGgccagc < 5:107232‑M1/148‑1 (MQ=255) TTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCTAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGtt < 1:319573‑M1/149‑1 (MQ=255) TTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGtt < 3:216136‑M1/149‑1 (MQ=255) tCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTg > 5:279355/1‑149 (MQ=255) gcaggaaccgctcgcggttgaagccatcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTg < 7:243815‑M2/118‑1 (MQ=255) aaCCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTggg > 6:130437/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTggg > 2:246566/1‑149 (MQ=255) aCCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgcgc < 8:240279/110‑1 (MQ=255) aCCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAgcgc > 7:240279/1‑110 (MQ=255) ccGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGc > 5:97630/1‑148 (MQ=255) cgcgAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAg < 4:203618/64‑1 (MQ=255) gcgAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAg < 3:240553/149‑1 (MQ=255) gcgAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAg < 6:232253/149‑1 (MQ=255) cgAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAgg < 8:69485/149‑1 (MQ=255) gTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTc < 3:137438/149‑1 (MQ=255) gTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTc < 4:216136/149‑1 (MQ=255) ttCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCg < 8:74565/149‑1 (MQ=255) ccTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGc < 1:68993/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAg > 7:112655/1‑149 (MQ=255) ccagccaTCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGc < 3:194333/104‑1 (MQ=255) ccagccaTCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAg < 5:64775/147‑1 (MQ=255) ccagccaTCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCt < 5:236818/149‑1 (MQ=255) ccagccaTCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCt > 8:35358/1‑149 (MQ=255) cagccaTCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAg > 5:111333/1‑134 (MQ=255) catcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGcc > 1:347221‑M2/7‑149 (MQ=255) atcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGccc > 3:324276‑M2/6‑149 (MQ=255) atcgcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGccc < 2:230732‑M2/144‑1 (MQ=255) gcCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGCCCgg > 6:302193‑M2/3‑148 (MQ=255) cCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGCCCGGaa < 7:145311‑M2/148‑1 (MQ=255) | TCAGCGACATCGGTGATGCGATCATCCTCGGCCGCTTGTTCCAGGTATTGTTCGATCAGGGCGTGGTGATCGTCGCCACCTCCAACCAGCCACCCGAGCAGCTCTACCGCGATGGCTTCAACCGCGAGCGGTTCCTGCCAGCCATCGCCGCCATT‑GGTCGTCACATGCAGGTATTGCCGGTAGCAGGCGAGCAGGATCACCGCCTGCACCCCGGTGAGGCGCGGCAGCGCTATTGGGTAGCCGAGGCGGGGCAGGCCAGCCAGTTGGGCGAGGTGTTTCGCCAGCTCAGCCCGGAA > NC_002947/2505756‑2506051 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |