New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2793928 = | 63 (1.140) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.4% | coding (76/186 nt) | PP_2446 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2793958 = | 56 (1.050) | coding (46/186 nt) | PP_2446 | hypothetical protein |
TCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAGG > NC_002947/2793810‑2794105 | tCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGcc > 1:64277/1‑149 (MQ=255) cTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTa > 5:56597/1‑149 (MQ=255) gTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGc < 7:181329/149‑1 (MQ=255) gCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCAt > 6:326065/1‑147 (MQ=255) aCCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTAcc < 3:38792/138‑1 (MQ=255) aCCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTAcc > 4:38792/1‑138 (MQ=255) cGGCATGCCGCCCGGGCCGTCTTACTGGATGTGGCTTGGCGGGTTCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGc > 6:260532/1‑148 (MQ=255) gCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCt > 2:235450/1‑129 (MQ=255) gCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCt < 1:235450/129‑1 (MQ=255) cATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATg < 5:326065/149‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATgg < 6:56597/149‑1 (MQ=255) gccgccGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGt > 3:170523/1‑148 (MQ=255) ctggaaggtaaacgcggcccaatcaagcgcttgccgcaaagatggaggcacagatgagcctgaccatggcaattctcatgctggtagGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCAt < 5:61337‑M1/40‑1 (MQ=255) ctggaaggtaaacgcggcccaatcaagcgcttgccgcaaagatggaggcacagatgagcctgaccatggcaattctcatgctggtagGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCAt > 6:61337‑M1/88‑127 (MQ=255) ggCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCAt < 2:258371/149‑1 (MQ=255) tGGGTGTTGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTTGCTGGTGGTGTTCATGACGCCGCTCGATACGCAGTACACCCGAGAGCATGGCGTCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGACATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCa < 4:29503/149‑1 (MQ=255) cTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCt < 6:203474/149‑1 (MQ=255) gtgGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCGCAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCAt > 7:234573/1‑145 (MQ=255) gtgGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCGCAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCAt < 8:234573/145‑1 (MQ=255) gtgGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCttt > 7:259684/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACGCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGGTCATCTG‑TGCCTCCAACTTTGCg > 6:367953/1‑149 (MQ=255) gCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGc < 1:118344/148‑1 (MQ=255) gCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCg < 5:343665/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCgg > 2:211155/1‑148 (MQ=255) ttGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCgg > 4:241742/1‑148 (MQ=255) gCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAg > 5:195297/1‑149 (MQ=255) gCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTg > 7:220673/1‑149 (MQ=255) cGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGAtt < 1:76449/147‑1 (MQ=255) aGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATATGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGt > 8:121965/1‑149 (MQ=255) gtggtgTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGtt > 3:15312/1‑148 (MQ=255) tggtgTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCAGAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTa < 1:211155/149‑1 (MQ=255) tggtgTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTa < 5:260532/149‑1 (MQ=255) ggtgTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTAc > 3:27515/1‑149 (MQ=255) tgtgCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCt > 3:139474/1‑149 (MQ=255) tgtgCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCt < 7:106597/149‑1 (MQ=255) gtgCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGTCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCtt > 2:320742/1‑149 (MQ=255) tgCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCtt < 6:195297/148‑1 (MQ=255) tgCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTc > 1:144192/1‑149 (MQ=255) cATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTcc < 2:64277/148‑1 (MQ=255) gACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGa < 5:277741/125‑1 (MQ=255) gACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGa > 6:277741/1‑125 (MQ=255) cACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCtt < 4:27515/149‑1 (MQ=255) aCGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCtt > 1:173015/1‑148 (MQ=255) cGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTa < 7:43118/149‑1 (MQ=255) cGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTa < 4:170523/149‑1 (MQ=255) cAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGc < 2:173015/149‑1 (MQ=255) aGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGGGGCAAgc < 7:198233/102‑1 (MQ=255) aGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCAAGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAga > 8:198233/1‑101 (MQ=255) atgctggtaggcatgtggctgagcgtcgcagccgccatgcCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAg < 5:61337‑M2/87‑1 (MQ=255) atgctggtaggcatgtggctgagcgtcgcagccgccatgcCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAg > 6:61337‑M2/41‑127 (MQ=255) acCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTGCTGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTc < 1:79912/123‑1 (MQ=255) acCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTc > 2:79912/1‑122 (MQ=255) acCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCg > 4:93744/1‑149 (MQ=255) catgtggctgagcgtcgcagccgccatgcCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTg < 7:50294‑M2/64‑1 (MQ=255) catgtggctgagcgtcgcagccgccatgcCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTg > 8:50294‑M2/30‑93 (MQ=255) ATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGt < 2:76116‑M1/149‑1 (MQ=255) ggggcTGCGATGGTCACGCAGATGCCTACCTGCATGAGAATTGACATGGTCATGCTCATCTG‑TGACTCGATATTTGCGGCATGCGCTTGATTGGTCAGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTATCCCTTCGTATGTGACGttaa < 8:259684/147‑3 (MQ=255) gagccTCAGCCACCTGCCTCCCAGCATGAGCATGGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGAc < 8:258630/132‑1 (MQ=255) gACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAAc > 2:159253/1‑148 (MQ=255) gACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAAc > 5:126341/1‑148 (MQ=255) gACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCGTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGAc > 7:258630/1‑136 (MQ=255) cGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAAt < 4:15312/149‑1 (MQ=255) gCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTcc > 2:222280/1‑99 (MQ=255) gCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTcc < 1:222280/99‑1 (MQ=255) gCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATg > 5:229896/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATg < 2:144192/149‑1 (MQ=255) tCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCGATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTc > 7:25420/1‑96 (MQ=255) tCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTc < 8:25420/96‑1 (MQ=255) tCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATgg > 7:49394/1‑148 (MQ=255) aGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTc < 4:209838/148‑1 (MQ=255) ccACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTAt < 4:247329/149‑1 (MQ=255) ccACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTAt < 6:229896/149‑1 (MQ=255) cCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAgg < 6:126341‑M2/148‑1 (MQ=255) cCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAgg < 8:220673‑M2/148‑1 (MQ=255) cCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAgg < 1:76116‑M2/148‑1 (MQ=255) cCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAgg < 8:49394‑M2/148‑1 (MQ=255) | TCCTGAGGTTAGCTCACCCCGGCATGCCGCCGGGGCCGTCTTACTGGCTGTGGCTTGGCGGGTGCCTGCGGTGGCAGGTGGTGTGCATGACGCCGCACGATACGCAGTACACCCCACAGCATGGCGGCTGCGACGCTCAGCCACATGCCTACCAGCATGAGAATTGCCATGGTCAGGCTCATCTG‑TGCCTCCATCTTTGCGGCAAGCGCTTGATTGGGCCGCGTTTACCTTCCAGACACTGCTTTAGTCTAGCCCTTCGTCTGTGACGTTCCATCGAACAATGGTCTATCTCTAGG > NC_002947/2793810‑2794105 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |