New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3825995 | 55 (0.990) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.4% | coding (51/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
? | NC_002947 | = 3826031 | 53 (1.010) | coding (15/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
GAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCA > NC_002947/3825884‑3826174 | ttggCGTTCTATGACCTCTTCCAGCGGCTTGGCGGTGGCTTCGGCCTGAAATTGCCGGTCGCAACCTATTAAACGGTATTTTGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg < 1:111070/147‑1 (MQ=255) gAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAg < 4:235430‑M2/149‑2 (MQ=255) aGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCCCTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAgg < 8:151488‑M2/149‑3 (MQ=255) ccTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATg > 1:47471/1‑149 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGTGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATgg < 3:235430/149‑1 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATgg > 1:45208/1‑149 (MQ=255) ctctTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATgg > 3:185179/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGtt > 5:88612/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAggc > 8:143851‑M2/1‑127 (MQ=255) cAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAggc < 7:143851‑M2/130‑4 (MQ=255) cGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa < 1:336595/149‑1 (MQ=255) cGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa < 2:30842/149‑1 (MQ=255) cGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTa < 2:47471/149‑1 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTc > 5:314486/1‑134 (MQ=255) gCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTc < 6:314486/134‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGtt < 1:221307/144‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGtt > 2:221307/1‑144 (MQ=255) ttCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGttt > 5:61627/1‑129 (MQ=255) ttCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGttt < 6:61627/129‑1 (MQ=255) cGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATa < 2:45208/147‑1 (MQ=255) ggCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtg < 4:185179/149‑1 (MQ=255) ccAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgat > 3:237309/1‑149 (MQ=255) aGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTc > 6:71083/1‑114 (MQ=255) aGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTc < 5:71083/114‑1 (MQ=255) cAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGaaa < 6:88612/149‑1 (MQ=255) aTTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAAcc > 1:173524/1‑149 (MQ=255) cGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGttt < 1:330672/149‑1 (MQ=255) gTCGCCACCGTTGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGGAACA‑CGCGCCACTTGACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCa < 7:151488/149‑1 (MQ=255) aCCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACAGCGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATa > 1:249501/1‑147 (MQ=255) cGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGc > 4:166801/1‑148 (MQ=255) aTGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCaa > 4:335452/1‑148 (MQ=255) tGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTc < 7:181727/102‑1 (MQ=255) tGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTc > 8:181727/1‑102 (MQ=255) cGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATgcg > 1:104951/1‑149 (MQ=255) gggAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATgcgc < 8:199239/149‑1 (MQ=255) gagaCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGt > 3:265293/1‑126 (MQ=255) gagaCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGt < 4:265293/126‑1 (MQ=255) agaCGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCggg < 2:173524/149‑1 (MQ=255) ggTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgatga > 4:122684/1‑114 (MQ=255) ggTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGtgatga < 3:122684/114‑1 (MQ=255) tttGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTc > 2:42209/1‑142 (MQ=255) tttGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTc < 1:42209/142‑1 (MQ=255) aaaCGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCg > 2:61464/1‑149 (MQ=255) cAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAggcgcgtgttgctggcgtttccaaagccaccgtctcccgttacatcggtggcgaccgccaattgctggccgaagccacggccaagcggctggaagag > 4:151535‑M2/1‑50 (MQ=255) cAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAggcgcgtgttgctggcgtttccaaagccaccgtctcccgttacatcggtggcgaccgccaattgctggccgaagccacggccaagcggctggaagag < 3:151535‑M2/147‑98 (MQ=255) cAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTTGTCAACAGGCCGTTGGTc < 2:104951/149‑1 (MQ=255) cAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAggcgcgtgttgctggcgtttccaaagccaccgtctcccgttacatccgtggcgaccgccaattgctggccgaagccacggccaagcggctggaagaggtcat < 4:351696‑M2/149‑103 (MQ=255) cAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCggg < 2:249501/149‑1 (MQ=255) cAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAAAACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGATGGACggg > 4:245918/1‑149 (MQ=255) aca‑cGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCa < 1:61464/149‑1 (MQ=255) aCTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAg > 1:39394/1‑149 (MQ=255) tGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGt > 7:35221/1‑149 (MQ=255) tGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGt > 8:258512/1‑149 (MQ=255) aTGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGtt > 6:338189/1‑148 (MQ=255) aTGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTa < 7:258512/149‑1 (MQ=255) gTGACGCGTTCGCTGGTATGGGCAGGCGCTTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCTCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCTGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAAt < 3:245918/149‑1 (MQ=255) gTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGt > 2:84657/1‑144 (MQ=255) gTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGt < 1:84657/144‑1 (MQ=255) gTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTaaa < 8:35221/148‑1 (MQ=255) gTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAAt > 1:97437/1‑149 (MQ=255) cccGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCa < 4:237309/149‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTaa < 2:39394/149‑1 (MQ=255) gggTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAata > 5:55030/1‑149 (MQ=255) tGGGCATGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCa < 3:335452/149‑1 (MQ=255) tGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCa < 3:166801/149‑1 (MQ=255) gggCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCa > 4:154659/1‑148 (MQ=255) gggCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCa > 1:222250/1‑148 (MQ=255) | GAGGCGTTCGATGACCTCTTCCAGCCGCTTGGCCGTGGCTTCGGCCAGCAATTGGCGGTCGCCACCGATGTAACGGGAGACGGTGGCTTTGGAAACGCCAGCAACA‑CGCGCCACTTCACTGATGGTGACCCGTTCGCGGGTATGGGCAGGCGCGTCGGTCATGGGTTTTCCTTATGATTGTTTTAATAGTGATGAAACCGGTTTCAATACAGCAAAAATGCGCGGGTTCGTCAACAGGCCGTTGGTCGGGCACGAAGACAGGAAATGTTAAATCGCATTAAGAATATTGCA > NC_002947/3825884‑3826174 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |